鮑曼不動桿菌Diversilab@系統(tǒng)分型方法的建立與評價.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:
　　 應(yīng)用DiversiLab系統(tǒng)對鮑曼不動桿菌進(jìn)行基因分型,并系統(tǒng)評價DiversiLab系統(tǒng)、多位點(diǎn)序列分析技術(shù)、脈沖場凝膠電泳技術(shù)的分辨率和三種方法的一致性分析。
　　 方法:
　　 對2005年全國15個城市醫(yī)院臨床分離的89株鮑曼不動桿菌,應(yīng)用以rep-PCR為原理的DiversiLab系統(tǒng)分型技術(shù)進(jìn)行分型,并與脈沖場凝膠電泳分型和多位點(diǎn)序列分析技術(shù)結(jié)果進(jìn)行比較;應(yīng)用Ridom EpiCompa

2、re Version1.0軟件得出Simpson相關(guān)系數(shù)及可信區(qū)間、AR系數(shù)和Wallace系數(shù)等,從而更精確地比較三種方法的分辨力和一致性分析。
　　 結(jié)果:
　　 DiversiLab系統(tǒng)將89株鮑曼不動桿菌分為8簇流行克隆和28個散發(fā)克隆;多位點(diǎn)序列分型將其分為39個序列型,并歸為一個克隆復(fù)合體CC92(CloneComplex92)和47個單一體(Singleton);脈沖場凝膠電泳將其分成5個流行脈沖型和37個

3、散發(fā)克隆。DiversiLab系統(tǒng)、MLST和PFGE的Simpson相關(guān)系數(shù)分別為0.899,0.894和0.934。AR(MLST-PFGE)=0.502,AR(DiversiLab-PFGE)=0.479,AR(DiversiLab-MLST)=0.434,從AR值來看,MLST和PFGE的相關(guān)性最好。對于DiversiLab系統(tǒng)而言,與PFGE分型結(jié)果的一致性比其與MLST分型結(jié)果的一致性好。Wallace系數(shù)中,W1(PFGE

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