從轉(zhuǎn)錄水平研究5種新基因在大鼠肝再生中的作用.pdf

1、肝臟具有很強的再生能力。當肝臟因創(chuàng)傷、手術(shù)、感染壞死、中毒等原因造成肝損傷后，殘存的肝臟細胞在生長因子、激素、信號通路等多種因素的調(diào)控下由G0期迅速進入G1期，并通過有絲分裂和細胞增殖迅速再生恢復至原有的體積和重量，最終達到肝組織結(jié)構(gòu)的重建及肝功能恢復，這一過程被稱為肝再生。肝再生是一個相當復雜的生理過程，涉及多種基因/蛋白的參與調(diào)控，了解相關(guān)基因/蛋白在肝再生中的作用是揭示肝再生分子機制的必要環(huán)節(jié)。為此，本研究建立2/3肝切除誘導的大

2、鼠肝再生模型(PH)，并用大鼠基因表達譜芯片Rat Genome2302.0檢測PH后10個恢復點的基因表達變化，結(jié)果發(fā)現(xiàn)，在檢出的13922個基因中，3886個基因至少在大鼠肝再生中的一個時間點的表達豐度大于等于對照3倍或小于等于對照0.33倍，稱為有意義表達變化基因。其中，C5ORF45、C11ORF96、C7ORF42、CXORF23、C3ORF43分別和254、9、85、10、18個已知基因的表達變化趨勢一致，稱為共表達基因。進

3、一步分析上述共表達基因參與的信號通路與生理活動發(fā)現(xiàn)，C5ORF45的254個共表達基因共參與93種信號轉(zhuǎn)導和37種生理活動;C11ORF96的9個共表達基因共參與65種信號轉(zhuǎn)導和21種生理活動;C7ORF42的85個共表達基因共參與67種信號轉(zhuǎn)導和35種生理活動;CXORF23的10個共表達基因共參與7種信號轉(zhuǎn)導和13種生理活動;C3ORF43的18個共表達基因共參與9種信號轉(zhuǎn)導和20種生理活動。然后，分別按共表達基因數(shù)和共表達基因比例

4、計算上述信號通路和生理活動的綜合排名，將排名前四初步確定為新基因C5ORF45、C11ORF96、C7ORF42、CXORF23、C3ORF43可能參與的信號通路/生理活動，再比對兩種方法得到的前四名信號通路/生理活動，最終將兩種方法中均出現(xiàn)者確認為新基因C5ORF45、C11ORF96、C7ORF42、CXORF23、C3ORF43在大鼠肝再生中可能參與的信號通路/生理活動。結(jié)果表明，新基因C5ORF45在大鼠肝再生中可能通過參與Te

5、c激酶信號通路和eNOS信號通路來發(fā)揮作用;新基因C11ORF96在大鼠肝再生中可能通過參與PPAR信號通路和細胞分化、細胞存活、氨基酸代謝、血管生成4種生理活動來發(fā)揮作用;新基因C7ORF42在大鼠肝再生中可能通過參與Tec激酶信號通路、p38MAPK信號通路、STAT3信號通路3種信號轉(zhuǎn)導和細胞內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)定、凝集2種生理活動來發(fā)揮作用;新基因CXORF23在大鼠肝再生中可能通過參與樁蛋白信號通路和細胞發(fā)育、細胞生長、細胞分化和細胞運