過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體天然泛激動(dòng)劑的虛擬篩選.pdf

1、本研究主要采用分子對(duì)接和分子動(dòng)力學(xué)模擬的方法，結(jié)合中藥對(duì)Ⅱ型糖尿病及高血脂等疾病的治療效果，從已解析出結(jié)構(gòu)的天然中藥中選取以黃酮類(lèi)化合物為主的38種中藥成份，篩選過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體的天然泛激動(dòng)劑，以探索中藥化合物治療Ⅱ型糖尿病及高脂血癥的機(jī)理，為中藥在分子水平上治療疾病提供理論依據(jù)。通過(guò)實(shí)驗(yàn)可知，姜黃素、白藜蘆醇、漢黃芩素、黃芩苷元、大豆黃素代謝產(chǎn)物Ⅲ和Ⅳ六種物質(zhì)與過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體三種亞型對(duì)接后都在AF2、helix3

2、、helix7、helix10及4個(gè)β-sheet所形成的疏水性活性腔中。因此，它們可作為過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體三種亞型潛在的天然泛激動(dòng)劑。
　　 選取其中的一個(gè)化合物漢黃芩素與過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體三種亞型的對(duì)接復(fù)合物進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬，研究配體與過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體三種蛋白質(zhì)間的相互作用機(jī)理。結(jié)果表明：漢黃芩素與過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體三個(gè)亞型對(duì)接后，都處于AF2、helix3、helix7、helix10與

3、4個(gè)β-sheet之間形成的一個(gè)疏水位置。同時(shí)對(duì)漢黃芩素與過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體三種亞型間的氫鍵、疏水及靜電相互作用進(jìn)行分析的結(jié)果表明：漢黃芩素與過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體α、δ之間沒(méi)有氫鍵形成，僅有過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體γ的Ser289和漢黃芩素苯環(huán)上的羥基之間形成了氫鍵；漢黃芩素與過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體三種蛋白質(zhì)活性腔存在較弱的疏水作用；另外，漢黃芩素與過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體三種亞型蛋白之間的靜電作用很強(qiáng)。因此，漢黃