復雜交配設計數(shù)量性狀基因圖譜的構建方法.pdf

1、揚州大學博士學位論文復雜交配設計數(shù)量性狀基因圖譜的構建方法姓名：敖雁申請學位級別：博士專業(yè)：作物遺傳育種指導教師：徐辰武20070501揚州大學博士學位論文中文摘要QTL圖譜的構建方法及其應用研究是數(shù)量遺傳學在近些年的研究熱點。為此，國內(nèi)外已發(fā)展了許多QTL作圖的統(tǒng)計方法和相應分析程序。然而這些方法大多依據(jù)雙親本雜交衍生的單個分離群體進行QTL作圖。雙親本雜交衍生的作圖群體每一基因座位上最多只有2種等位基因，遺傳結構最為簡單，所得結果的

2、局限性也最大。為了較全面地了解數(shù)量性狀的遺傳變異。必須擴大作圖群體的遺傳基礎，例如利用多向雜交、多系雜交或聯(lián)合多個分離群體等復雜設計進行QTL作圖，但目前還沒有較為系統(tǒng)的方法解決該類問題。鑒于此，筆者提出四向雜交和八向雜交設計的QTL作圖方法，雙親雜交衍生的多個相關群體QTL圖聯(lián)合構建方法，以及多個親本雜交衍生的多個相關群體QTL圖聯(lián)合構建方法。通過計算機模擬研究驗證了上述方法的可行性和優(yōu)越性。此外，本研究還探討了利用貝葉斯統(tǒng)計進行多個

3、相關群體QTL圖聯(lián)合構建的方法。主要內(nèi)容如下：l四向雜交設計QTL分析的極大似然方法四向雜交設計是指4個純系親本參與雜交衍生分離群體的一種交配設計。盡管國際上已經(jīng)提出基于四向雜交設計的迭代重新加權最小平方(iterafivelyreweighedleastsquares，IRWLS)QTL作圖方法，但由于該方法忽略了雙側標記基因型內(nèi)QTL基因型的混合分布特性，因此當QTL位置和標記的位置不重合時IRWLS方法的作圖精度較低。本研究根據(jù)四

4、向雜交設計的數(shù)量遺傳模型，發(fā)展出基于四向雜交設計和混合分布理論的QTL作圖的極大似然估計方法。該方法首先利用染色體上所有標記基因型聯(lián)合計算該染色體上任一假定位置QTL的條件概率，然后根據(jù)混合分布理論建立基于EM算法實現(xiàn)的QTL作圖的極大似然估計方法。以計算機模擬數(shù)據(jù)研究了QTL遺傳力、樣本容量和分子標記信息含量3個因素對方法的影響，結果表明：(1)在QTL的被發(fā)現(xiàn)能力上，標記信息不完全的四向雜交設計僅略低于信息完全時的四向雜交設計；(2