部分鴨種線粒體D-環(huán)部分序列多態(tài)性與系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究.pdf

1、本試驗(yàn)采用Sanger雙脫氧鏈終止法測(cè)定了我國浙江省4個(gè)家鴨品種(類群)，1個(gè)野鴨品種及1個(gè)番鴨品種共106個(gè)個(gè)體的線粒體DNA控制區(qū)(D-loop)部分序列，分析結(jié)果表明： 浙江4個(gè)家鴨品種共60個(gè)個(gè)體mtDNA D-環(huán)部分序列(523bp)T、C、A、G的平均含量分別為：25.1％、35.O％、23.5％、16.5％：共檢測(cè)到12個(gè)變異位點(diǎn)，約占總位點(diǎn)的2.29％；其中單一多態(tài)位點(diǎn)(Singleton polymorphic

2、 sites)8個(gè)，占1.53％；簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)(Parsimony informative polymorphic sites)4個(gè)，占0.76％。共檢測(cè)到兩種變異類型，即轉(zhuǎn)換、顛換，其中轉(zhuǎn)換10次，顛換2次，分別占總變異位點(diǎn)的83.3％、16.7％。各品種內(nèi)核苷酸多樣度分別為0.408％、0.193％、0.098％、0.372％。說明這四個(gè)品種內(nèi)核苷酸多樣度不豐富。試驗(yàn)共檢測(cè)到12種單倍型，平均單倍型多樣度較高(0.769±0.035

3、)，說明浙江家鴨核苷酸單倍型類型較豐富。但總體來說，浙江家鴨的遺傳多樣性較低。 本試驗(yàn)測(cè)定了西湖野鴨31個(gè)個(gè)體mtDN D-環(huán)部分序列，共檢測(cè)到4種單倍型(Haplotype)，單倍型多樣度為0.424±0.095，核苷酸多樣度為0.00478±0.00342，表明西湖野鴨的單倍型類型和核苷酸多樣度并不豐富。結(jié)合Genbank中已報(bào)道的綠頭野鴨序列計(jì)算品種間遺傳距離，結(jié)果表明：西湖野鴨和浙江家鴨與綠頭野鴨單倍型B之間的遺傳距離最

4、大，分別為0.030±0.007，0.032±0.007；西湖野鴨和浙江家鴨間的遺傳距離最小，為0.004±0.007。從系統(tǒng)發(fā)生樹中可以看出綠頭野鴨和斑嘴鴨主要分為兩個(gè)進(jìn)化支A和B，而西湖野鴨和浙江地方品種家鴨的16種單倍型則全位于分支A中，表明家鴨起源單一。 本試驗(yàn)測(cè)定了浙江番鴨15個(gè)個(gè)體mtDNA D-100p區(qū)部分序列，T、C、A、G的平均含量分別為：24.3％、33.5％、25.1％和17.1％。試驗(yàn)共檢測(cè)到7個(gè)變異位

5、點(diǎn)，6種單倍型，單倍型多樣度為0.790±0.079，說明番鴨單倍型比較豐富，但核苷酸多樣度并不豐富。結(jié)合已報(bào)道的鴨科河鴨屬(10個(gè)個(gè)體)、狹嘴潛鴨屬(1個(gè)個(gè)體)和鴛鴦屬(2個(gè)個(gè)體)mtDNA D-loop序列計(jì)算四個(gè)屬間的遺傳距離，并構(gòu)建番鴨線粒體D環(huán)序列分子系統(tǒng)樹。結(jié)果表明，番鴨與鴛鴦屬、河鴨屬、狹嘴潛鴨屬的遺傳距離較近，分別為0.089±0.013、0.095±0.013、0.111±0.016。在系統(tǒng)分支中，番鴨也是先與鴛鴦屬聚