黃牛線粒體DNA D-環(huán)序列多態(tài)性與系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究.pdf

1、該研究測定了中國飼養(yǎng)的8個黃牛品種50個個體的線粒體DNA控制區(qū)(D-loop)全序列,分析結(jié)果表明:中國飼養(yǎng)的黃牛D-loop全序列長度為910bp、911bp和912bp,檢測到59個多態(tài)位點(diǎn),占分析位點(diǎn)總數(shù)的6.48﹪,其中單一多態(tài)位點(diǎn)9個,簡約信息位點(diǎn)50個;核苷酸位點(diǎn)突變類型有五種,即轉(zhuǎn)換、顛換、插入/缺失及轉(zhuǎn)換與顛換共存.確定了23種單倍型,其中單倍型H4為中國黃牛的主體單倍型,各單倍型在品種間和品種內(nèi)的分布和頻率均不平衡,

2、所測定的8個黃牛品種單倍型多樣度范圍從0.500~0.9444,各單倍型間的平均遺傳距離為0.018(0.000~0.051),說明我國黃牛D-loop單倍型類型豐富.黃牛品種間雙參數(shù)距離范圍較大(0.000~0.048).群體核苷酸不配對分布曲線是一條不規(guī)則的多峰波浪型曲線,所有序列經(jīng)Tajima's D中性檢驗(yàn)結(jié)果均不顯著(p>0.10),表明中國黃牛在過去沒有出現(xiàn)群體擴(kuò)張.黃牛不同地方品種之間存在一定程度的基因交流,品種之間出現(xiàn)了

3、顯著的遺傳分化.采用黃牛mtDNA D-環(huán)全序列單倍型,以及GenBank中相關(guān)序列,通過Paup4.0和Mega2.1軟件構(gòu)建黃牛D-環(huán)全序列的NJ樹和MP樹,不同系統(tǒng)發(fā)育樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)相似,并進(jìn)行拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)檢驗(yàn),差異不顯著(P>0.05),表明構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹準(zhǔn)確.D-環(huán)的MP樹和NJ樹上,明顯分成歐洲普通牛型和印度瘤牛型2個分枝,表明中國黃牛起源上含有歐洲普通牛和印度瘤牛的血統(tǒng),但受普通牛的影響更大一些;對中國黃牛是否含有斑騰牛的血統(tǒng)