家鵝mtDNA D-環(huán)區(qū)部分序列分析和系統(tǒng)進化研究.pdf

1、線粒體DNA序列分析技術(shù)使我們對人類及家養(yǎng)動物的起源進化和系統(tǒng)發(fā)育有了更深入細致的了解。在線粒體DNA上，D-環(huán)是整個線粒體基因組序列和長度變異最大的區(qū)域，其進化速度最快，一般用于種內(nèi)種群間的系統(tǒng)研究。本試驗通過對8個家鵝品種以及野生鵝種鴻雁共143個個體mtDNAD-環(huán)的部分序列研究，在分子水平上探討家鵝的起源和遺傳多樣性，為家鵝品種遺傳資源的保護和利用提供科學(xué)理論依據(jù)。
　　 本研究采用clsutalX軟件進行同源序列比對：

2、Dnasp4.01軟件用于遺傳多樣性分析、計算單倍型多樣度、核苷酸多樣度，平均核苷酸差異；MEGA4.1軟件用于采用鄰接法(NJ)和非加權(quán)組平均法(UPGMA)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹，并進行系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析；Network軟件用于網(wǎng)絡(luò)關(guān)系分析。
　　 對中國8個家鵝品種及野生鴻雁143個個體的mtDNAD-環(huán)部分序列(490bp)進行測序，T、C、A、G堿基平均含量分別為27.2％、30.7％、22.9％、19.2％；以白額鵝線粒體基因

3、組為對照進行分析，結(jié)果表明：家鵝8個品種及野生鵝種鴻雁143個個體490bp序列共檢測到核苷酸多態(tài)位點17個。所有變異位點均為轉(zhuǎn)換位點，其中單一多態(tài)位點有6個，簡約信息位點有10個，含有三個變異的堿基多態(tài)位點1個。
　　 143個序列由6個單倍型組成，單倍型比例為4.20％，在羅曼鵝中發(fā)現(xiàn)了一條稀有單倍型H6。鴻雁單倍型比例最高為66.67％，其次為浙東白鵝30.77％，陽江鵝單倍型比例最低為4.76％。
　　 對不同單