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1、碭山酥梨(Pyrus bretschneideri cv.Dangshan Su)原產(chǎn)安徽省碭山縣,栽培歷史悠久,是我國(guó)主要的梨出口品種。近幾年來,由于氣候變化、栽培管理粗放等原因,梨果實(shí)中石細(xì)胞含量增加,影響其食用品質(zhì)和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。梨果實(shí)中石細(xì)胞是一種厚壁組織細(xì)胞,是次生壁在初生壁上沉積形成的,與木質(zhì)素的合成、轉(zhuǎn)運(yùn)及沉積均密切相關(guān)。咖啡酸氧甲基轉(zhuǎn)移酶(COMT)是木質(zhì)素合成的關(guān)鍵酶,主要參與S-木質(zhì)素的合成。碭山酥梨果實(shí) COMT基因的
2、克隆,目前未見報(bào)道。因此,克隆和鑒定碭山酥梨果實(shí)中COMT基因,探討COMT的分子特性,對(duì)利用分子生物學(xué)技術(shù)調(diào)控梨木質(zhì)素的合成和石細(xì)胞的發(fā)育意義重大。
本研究以碭山酥梨果實(shí)為材料,克隆其 COMT cDNA全長(zhǎng),進(jìn)行生物信息學(xué)分析,進(jìn)行原核表達(dá)和實(shí)時(shí)熒光定量表達(dá)分析,另外還成功構(gòu)建了真核表達(dá)載體,為后期蛋白定位和遺傳轉(zhuǎn)化奠定基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:
1.利用RT-PCR技術(shù)并結(jié)合 RACE方法得到碭山酥梨咖啡酸氧甲基
3、轉(zhuǎn)移酶(COMT)基因的全長(zhǎng)cDNA,命名為PbCOMT,GenBank登錄號(hào)為KC905086。PbCOMT基因全長(zhǎng)1371 bp,其開放閱讀框?yàn)?098 bp,編碼365個(gè)氨基酸。
2.生物信息學(xué)分析結(jié)果為:PbCOMT蛋白的理論分子量約為40 KD,理論等電點(diǎn)為5.61。PbCOMT氨基酸序列與蘋果的COMT氨基酸同源性最高,相似性達(dá)94%。PbCOMT蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)中含有34.25%α螺旋,16.44%伸展鏈,49.32
4、%的無規(guī)則卷曲。 PbCOMT蛋白為疏水性蛋白,其N端無信號(hào)肽,說明該蛋白可能定位在細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)中,屬于非分泌性蛋白。PbCOMT蛋白的N末端有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)二聚作用的結(jié)構(gòu)域,同時(shí)也發(fā)現(xiàn)了催化SAM的甲基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域。
3.將該基因重組到表達(dá)載體 pET-32a(+)中進(jìn)行原核表達(dá),經(jīng) IPTG誘導(dǎo),SDS-PAGE檢測(cè)表明,PbCOMT基因能在大腸桿菌BL21(DE3)中表達(dá),電泳檢測(cè)到一條大約60 KD的外源蛋白,與預(yù)測(cè)的融合蛋
5、白分子量相符。
4.實(shí)時(shí)熒光定量表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),不同發(fā)育時(shí)期(23 d,39 d,47 d,63 d和125 d)碭山酥梨果實(shí)PbCOMT基因表達(dá)量呈現(xiàn)先增加后下降的趨勢(shì),在63 d時(shí)達(dá)到最大表達(dá)量?;ê?7 dPbCOMT基因表達(dá)量,果中部>近果核>近果皮,并且果中部明顯高于近果皮和近果核;而63 d PbCOMT基因表達(dá)量,近果核>近果皮>果中部。
5.以pCAMBIA1301-EGFP為真核載體質(zhì)粒,成功構(gòu)建了1
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