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文檔簡介
1、背景:
類風濕關節(jié)炎(rheumatoid arthritis,RA)是慢性,進行性,主要侵蝕外周滑膜關節(jié),以對稱性多關節(jié)炎為主要臨床表現(xiàn)的異質(zhì)性、系統(tǒng)性、自身免疫性疾病。我國類風濕關節(jié)炎的患病率約為0.32%~0.36%,是造成人群喪失勞動力與致殘的主要病因之一。流行病學調(diào)查顯示,類風濕關節(jié)炎的發(fā)病與性別,年齡,遺傳因素,免疫紊亂,環(huán)境因素密切相關。類風濕關節(jié)炎多發(fā)于女性,與男性的比例為3:1。類風濕關節(jié)炎80%發(fā)病于3
2、5-50歲。家系調(diào)查發(fā)現(xiàn)類風濕關節(jié)炎先證者的一級親屬發(fā)生類風濕關節(jié)炎的概率為11%。對孿生子的調(diào)查結(jié)果顯示,單卵孿生子同時患類風濕關節(jié)炎的概率為12%~30%,而雙卵孿生子同時患類風濕關節(jié)炎的概率只有4%。免疫紊亂被認為是類風濕關節(jié)炎主要的發(fā)病機制,是以活化的CD4+T細胞和MHC-Ⅱ型陽性的抗原遞呈細胞(antigen presentingcell,APC)浸潤滑膜關節(jié)為特點的。在病程中T細胞和滑膜的巨噬細胞受抗原的刺激而活化,TNF
3、-α、IL-1、IL-6、IL-8等細胞因子增多,關節(jié)滑膜處于持續(xù)增生炎癥狀態(tài)。炎癥破壞關節(jié)軟骨和骨,造成關節(jié)畸形。IL-1、IL-6等引起類風濕關節(jié)炎全身性癥狀如低熱、乏力、急性期蛋白合成增多,C反應蛋白和血沉升高。生物制劑如IL-1拮抗劑,IL-6,及TNF-α拮抗劑,CTLA4和CD20單克隆抗體等,在國內(nèi)外逐漸用于治療類風濕關節(jié)炎,臨床試驗提示它們有抗炎及防止骨破壞的作用。細胞因子通過激活Janus激酶/信號轉(zhuǎn)導及轉(zhuǎn)錄激活因子(
4、Januskinase/signal transducer and activator of transcription,JAK/STAT)途徑而發(fā)揮作用,而細胞因子信號轉(zhuǎn)導抑制因子家族(SOCS)是JAK/STAT通路唯一的反饋抑制因子,又被稱為細胞的“分子剎車”,在維持機體免疫自穩(wěn)中發(fā)揮重要作用。細胞因子信號轉(zhuǎn)導抑制因子家族一共有8個成員,包括細胞因子誘導SH2結(jié)構(gòu)域結(jié)合蛋白(CIS)和SOCS1-7。這些家族成員都是細胞內(nèi)的一種信
5、號調(diào)節(jié)蛋白,結(jié)構(gòu)相似,氨基端(N末端)是不同長度的可變區(qū)域,中間是一個SH2結(jié)構(gòu)域,羧基端(C末端)是一段保守序列,約40個氨基酸大小的SOCS盒子。人類SOCS3作為SOCS家族一員,最早發(fā)現(xiàn)于1997年,基因在染色體上的位置為17q25.3,有兩個包含2729個核苷酸的外顯子組成。外顯子2編碼序列由678個連續(xù)核苷酸組成,編碼225個氨基酸。SOCS3是細胞內(nèi)的一種信號調(diào)節(jié)蛋白,正常情況下,SOCS3的mRNA在骨髓和脾等組織,以及
6、外周血細胞表達很低。但在細胞因子或其它刺激物誘導后,SOCS3的mRNA表達上調(diào),其表達方式和時間因刺激因子和所在組織不同而改變。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotidepolymorphism,SNP)系指人類基因組中大量存在的單個核苷酸的差異.核苷酸序列的一定差異決定了不同人種和不同個體的差異,以及不同人群疾病易感性和藥物治療敏感性的差異。因此,SNP是一個具有高度穩(wěn)定性的遺傳學標記,可以成為尋找疾病相關基因,進行疾病診斷
7、、預防和藥物篩選的基礎。目前,對SNP的檢測方法多種多樣,如限制性內(nèi)切酶片段長度多態(tài)性(RFLP)、單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)、等位基因特異性擴增(ASA)和質(zhì)譜法等。四引物擴增受阻突變體系PCR(tetra-primer amplification refractory mutation systemPCR,tetra-ARMS-PCR)方法擴增的338bp片段的一級結(jié)構(gòu)特征是GC含量高達77%。GC含量高,Tm值就高。高GC含量模板
8、擴增必須用耐熱性DNA聚合酶。SNP中其3’端正好與SNP位點重合,由引物的3’端控制著引物的延伸反應,根據(jù)延伸產(chǎn)物的長度確定SNP類型。為提高SNP測定的特異性,在特異性引物的3’端倒數(shù)第3個堿基引入了一個人為錯配堿基,當錯配堿基數(shù)目達到一定程度同時反應條件達到一定的嚴謹程度時,3’末端堿基因磷酸二酯鍵形成困難而不能延伸,反應終止,得不到特異條帶,表明沒有與之相應的突變,反之則有。所以必須使用缺少3’→5’外切酶活性的Taq DNA聚
9、合酶。設計4條引物進行PCR擴增,其中F1F2外引物(F1:C-920A-o-F:5’CCG CGC TCA GCC TTT CTC TGC TGC GA3’;F2:C-920A-o-R:5’AGT CCA CAA AGG AGC CTT CGC GCG CG3’)用于擴增一段含有SNP位點的338bp片段,另一對N1N2內(nèi)引物(N1:C-920A-i-F:5’CCC GCACGC AGC CAG CCG TCC3’;N2:C-920A
10、-i-R:5’AGC TGG GCC GGG CGG GCG ACT3’)為SNP位點特異性引物,4條引物在單管中同時進行PCR擴增反應,根據(jù)延伸產(chǎn)物的長度確定SNP的類型。其中F1F2擴增的338bp片段,是必須出現(xiàn)的條帶;F1N2是210bp,基因型是A;F2N1是170bp,基因型是C。
我們研究中國漢族人群SOCS35’非翻譯區(qū)(外顯子2)內(nèi)的-920 C>A(rs12953258)和啟動子區(qū)的-1044C>A的單
11、核苷酸多態(tài)性,以及兩個基因位點是否存在連鎖不平衡(PDT),即SOCS3的編碼序列(-920 C>A)和啟動子區(qū)(-1044C>A)的連鎖關系。
目的:
研究SOCS3的-1044C>A(外顯子2的ATG上游堿基)和-920 C>A(rs12953258)兩個位點在中國漢族人群的突變頻率,類風濕關節(jié)炎患者和健康對照是否存在差異,以及兩個位點有無連鎖不平衡(PDT),對類風濕關節(jié)炎的發(fā)病機制和診斷有重要意義。<
12、br> 方法:
1.實驗組類風濕關節(jié)炎患者100例,全部符合美國風濕病學院(ACR)1987類風濕關節(jié)炎的分類標準,對照組健康漢族人100例,性別及年齡相匹配。記錄其臨床資料,并收集抗凝的外周血2ml。
2.提取DNA。
3.四引物擴增受阻突變體系PCR檢測SOCS3的-920 C>A(rs12953258)位點,用限制性內(nèi)切酶片段長度多態(tài)性(RFLP)檢測SOCS3的-1044C>A位點
13、。電泳,根據(jù)電泳條帶描述基因型。
4.測序。
結(jié)果:
1.100名類風濕關節(jié)炎患者中82名類風濕因子陽性。
2.SOCS3的-920 C>A(rs12953258)位點,中國漢族人群類風濕關節(jié)炎患者基因型CC3%,AC89%,AA8%;健康對照組基因型CC9%,AC82%,AA9%。
3.SOCS3的-1044C>A位點,中國漢族人群類風濕關節(jié)炎患者基因型CC100%
14、,ACO%,AAO%;健康對照組基因型CC100%,ACO%,AAO%。
4.200名中國漢族人群SOCS3的編碼序列(-920 C>A)和啟動子區(qū)(-1044C>A)的連鎖關系,PDT顯示了沒有傳遞不平衡。
結(jié)論:
1.100名類風濕關節(jié)炎患者中82名類風濕因子陽性,其中女性67名基因型是AC59AA6CC2,男性15名基因型是AC12AA2CC1,共計82名基因型是AC71AA8CC3。
15、r> 2.丹麥后裔的高加索人群SOCS3的-920 C>A(rs12953258)基因型CC92%,ACO%,AA8%。而中國漢族人群類風濕關節(jié)炎患者基因型CC3%,AC89%,AA8%;健康對照組基因型CC9%,AC82%,AA9%。說明人種差異。
3.丹麥后裔的高加索人群SOCS3的-1044C>A基因型CC99%,ACO%,AA1%。而中國漢族人群類風濕關節(jié)炎患者基因型CC100%,ACO%,AAO%,健康對照
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