結(jié)球甘藍(lán)花粉發(fā)育相關(guān)DHHC鋅指蛋白全基因組分析和差異性表達(dá).pdf

1、鋅指是一種具有“指狀”結(jié)構(gòu)的調(diào)控基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子。DHHC(Asp-His-His-Cys)是富含半胱氨酸高度保守的鋅指結(jié)構(gòu)域，屬于類C2H2型鋅指，是DNA結(jié)合蛋白中經(jīng)常出現(xiàn)的結(jié)構(gòu)基元。目前在植物中對(duì)于DHHC鋅指蛋白基因研究有限。在之前的研究中，DHHC鋅指蛋白基因At4g24630是bol-miR172a的靶基因之一，參與花粉的發(fā)育。本次試驗(yàn)運(yùn)用生物信息學(xué)技術(shù)全面研究和分析DHHC鋅指蛋白基因家族，包括此基因家族的確認(rèn)和特征分析

2、，生物進(jìn)化分析，基因在染色體分布情況及基因結(jié)構(gòu)分析。另外，運(yùn)用半定量PCR、熒光定量PCR技術(shù)進(jìn)一步研究并分析了6個(gè)結(jié)球甘藍(lán)DHHC鋅指蛋白基因在不同器官、不同花粉發(fā)育時(shí)期(S1-S5)的差異性表達(dá)。
　　本次試驗(yàn)共得到31個(gè)DHHC鋅指蛋白，并用生物進(jìn)化樹和保守蛋白區(qū)域分析了其保守性和差異性。根據(jù)對(duì)基因家族的詳細(xì)分析，其家族成員除了差異性特別大的Bol032399/Bol015394和Bol009994/Bol022882外，被

3、分成4個(gè)組。其表達(dá)分析表明，在不同的組織器官和不同的花粉發(fā)育時(shí)期，6個(gè)基因都表現(xiàn)出明顯的差異性表達(dá)。研究顯示，Bol032202，Bol015002，Bol009994，Bol035824和Bol037914在花粉和莖中集中表達(dá)。不同花粉發(fā)育時(shí)期的表達(dá)方式表明，Bol039449，Bol015002，Bol009994和Bol035824在保持系和細(xì)胞質(zhì)雄性不育系植株中表現(xiàn)出巨大的差異性，并在保持系中高表達(dá)。
　　詳細(xì)的數(shù)據(jù)分析有