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文檔簡介
1、背景:
帕金森病(Parkinson's disease,PD)是一種復雜的神經變性疾病,65歲以上的老年人帕金森病患病率為1-2%,帕金森病病因包括多種基因及環(huán)境因素,也包括二者復雜的交互作用。最近,國際帕金森病組織通過對5個全基因組關聯研究數據的mata分析,得出了5個新的與PD相關的基因(ACMSD, STK39, MCCC1/LAMP3,SYT11以及CCDC62/HIP1R)。繼而很多研究在不同人群中驗證這些新發(fā)現的
2、位點與PD的關系,由于芯片設計等原因,其中CCDC62基因多態(tài)性位點rs12817488并未直接研究,而是通過一個代理的連鎖位點rs10847864/HIP1R間接反映其與PD的關系。卷曲螺旋域蛋白62(Coiled-coil domain-containing protein62,CCDC62)與雌激素受體激活相關,而PD與雌激素及雌激素受體有密切關系。已有研究證實,PD與雌激素相關位點有一定的關聯性,因此我們直接研究rs128174
3、88/CCDC62位點與中國大陸人群PD的關系。
目的:
探討CCDC62基因多態(tài)性位點rs12817488與中國漢族人群PD的關聯性;在蛋白水平上研究不同基因型CCDC62蛋白表達情況;探討另一雌激素位點rs2697962/PRDM2與同一人群PD的關聯性,并主要探討兩位點的有無潛在的交互作用。
方法:
1.通過聚合酶鏈反應-限制性片段長度多態(tài)性(Polymerase chain reactio
4、n andrestriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)的方法研究rs12817488多態(tài)性位點在341個散發(fā)性PD病人(178個男性和163女性)和423個健康對照(226男性和197女性)的基因型情況;PD和對照組性別年齡匹配,均來是自于中國大陸東部的漢族人群。
2.在蛋白水平上,取41個基因型為純合子的PD和健康對照的外周血,分離外周血單個核細胞(Peripheral
5、 blood mononuclear cells,PBMCs),提取蛋白,進行免疫印跡實驗,觀察四組(PD AA,PD GG,Control AA,Control GG)的CCDC62蛋白水平。
3.通過PCR-RFLP的方法研究rs2697962多態(tài)性位點在同一人群中的基因型分布情況;多元logistic回歸用于兩個多態(tài)性位點的交互作用分析。
結果:
1.Rs12817488/CCDC62A等位基因的基因
6、頻率在PD組顯著高于對照組(P=0.006,OR1.327,95% CI1.083-1.626),A等位基因是PD的危險等位基因。PD組和對照組基因型分布有統(tǒng)計學意義(P=0.011 for AA vs.AG vs.GG;P=0.003 for AA vs.AG+GG,OR1.604,95% CI1.175-2.190)。進一步作性別和年齡分層分析,性別分層分析發(fā)現僅僅女性PD組和對照組基因型和等位基因存在統(tǒng)計學差異(P=0.019 f
7、or AA vs.AG vs.GG; P=0.009,OR1.481,95% CI1.102-1.991 for A vs.G),男性PD和男性對照基因型和等位基因無統(tǒng)計學差異;年齡分層分析發(fā)現rs12817488與PD相關性僅存在于晚發(fā)性PD和對照組比較(基因型分布P=0.014;等位基因分布P=0.011),早發(fā)性PD和對照組基因型和等位基因比較無統(tǒng)計學差異。Rs12817488基因型和等位基因分布與PD三種運動分型,即震顫為主型、
8、強直少動型、混合型,無相關性,與PD臨床評分,即帕金森綜合評分量表評分和Hoehn-Yahr分級無關。
2.PDAA組的蛋白表達水平明顯比其他組別高: PD AA組是對照AA組蛋白表達水平的1.46倍,是對照GG組蛋白表達水平的1.78倍,有統(tǒng)計學意義(P<0.05);其他基因型的蛋白水平之間比較無統(tǒng)計學意義。
3.Rs2697962/PRDM2PD組和對照組基因型和等位基因卡方檢驗結果均無統(tǒng)計學意義,對應性別比較的
9、性別分層分析也無統(tǒng)計學意義,而女性PD組和男性PD組比較基因型和等位基因均有統(tǒng)計學意義,從基因型和最小等位基因A在女性PD較男性PD高(P=0.019 for AA vs.AG vs.GG; P=0.008 for A vs.G)。我們進一步分析兩位點即rs12817488/CCDC62和rs2697962/PRDM2對PD可能存在的交互作用。我們的統(tǒng)計結果表明,在總PD組和對照組中rs12817488 AA型和rs2697962 A等
10、位基因同時出現時增加患病風險(OR1.636,95% CI1.007-2.656,P=0.047);進一步在女性PD組和女性對照組中分析,統(tǒng)計結果表明rs12817488 A等位基因和rs2697962 AA型同時出現時增加PD患病風險(OR5.687,95% CI1.112-29.086,P=0.037).
結論:
總之,我們的研究首次證明rs12817488多態(tài)性位點與中國漢族人群散發(fā)性PD易感性相關,而且與性別
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