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文檔簡(jiǎn)介
1、中國(guó)大鯢(Andrias davidianus)又稱(chēng)娃娃魚(yú),隸屬兩棲綱、有尾目、隱鰓鯢科,是世界上現(xiàn)存?zhèn)€體最大的有尾目?jī)蓷?lèi)。大鯢有“活化石”之稱(chēng),是我國(guó)的Ⅱ級(jí)保護(hù)動(dòng)物。近年來(lái)受多種因素的影響,中國(guó)大鯢的分布范圍逐漸縮小,資源受到極大的破壞,對(duì)大鯢的保護(hù)刻不容緩。中國(guó)大鯢屬于由水生向陸生轉(zhuǎn)變的過(guò)渡兩棲動(dòng)物,且其遷移捕食能力較差,是研究生物進(jìn)化和多樣性的好材料。大鯢小腸作為重要的消化和吸收器官,在超微結(jié)構(gòu)上已經(jīng)具備了較強(qiáng)的消化、吸收、合成
2、和分泌功能的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),如細(xì)胞質(zhì)中線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體和溶酶體豐富。目前中國(guó)大鯢的研究主要集中在組織形態(tài)學(xué),但在分子層面的研究未見(jiàn)報(bào)道。因此,本文采用iTRAQ標(biāo)記結(jié)合LC-MS/MS的蛋白質(zhì)研究技術(shù)對(duì)正常中國(guó)大鯢的小腸進(jìn)行蛋白檢測(cè)。然后用GO、NCBI、GENMAPP、KEGG、QIAGEN和IPA軟件等生物信息學(xué)方法對(duì)鑒定到的蛋白進(jìn)行生理活動(dòng)分類(lèi),挑選出糖代謝、脂代謝、蛋白質(zhì)和氨基酸代謝以及核酸代謝相關(guān)蛋白,之后用IPA軟件這些蛋
3、白進(jìn)行通路分析。最后通過(guò)查閱相關(guān)文獻(xiàn)資料,研究代謝相關(guān)信號(hào)通路中的主要蛋白在中國(guó)大鯢小腸中的功能作用。
主要結(jié)果如下:
(1)參與中國(guó)大鯢小腸糖類(lèi)代謝的蛋白有117種。涉及糖代謝的有:糖酵解和糖異生途徑,主要蛋白有ALOA、ALOB、ENO1、ENO2、ENO3和GPI等;磷酸戊糖途徑,主要蛋白有PGD和PGLS等。
(2)參與中國(guó)大鯢小腸脂代謝的蛋白有142種,涉及脂代謝的有:脂肪酸β氧化途徑,主要蛋白有
4、ACADM、ACSL1、ECHS1、HADHA和HADHB等;酮體生成途徑,主要蛋白有BDH1和HMGCS1等。在中國(guó)大鯢小腸糖代謝和脂代謝中均檢測(cè)到了AMPK信號(hào)通路,主要蛋白為CYP7B1。
(3)參與中國(guó)大鯢小腸蛋白質(zhì)及氨基酸代謝的蛋白有121種,主要涉及蛋白泛素化途徑,主要蛋白有PSMC1、PSMC2、PSMC3、PSMC4和PSMC5等;AHR信號(hào)通路,主要涉及的蛋白有SLC7A8和SLC3A1等;組胺降解途徑,主要
5、蛋白有DAO等。
(4)參與在中國(guó)大鯢小腸核酸代謝的蛋白有105種,涉及嘧啶核苷酸從頭合成途徑的主要蛋白有AK1、NME7、NUDT9和UMPS等;SAPK/JNK信號(hào)通路,主要蛋白有CDC42,CRK和CRKL等。
綜上所述,本文用iTRAQ標(biāo)記結(jié)合LC-MS/MS的蛋白質(zhì)研究技術(shù)檢測(cè)了中國(guó)大鯢正常小腸中參與糖代謝、脂代謝、蛋白質(zhì)和氨基酸代謝以及核酸代謝相關(guān)蛋白的表達(dá)豐度,用生物信息學(xué)方法分析了中國(guó)大鯢小腸中代謝活
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