免疫相關(guān)基因在食管癌中表達(dá)及其臨床意義的研究.pdf

1、研究背景：
　　腫瘤組織細(xì)胞的微環(huán)境在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要的作用。其中腫瘤組織細(xì)胞慢性炎癥微環(huán)境參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展已被大量的實(shí)驗(yàn)證據(jù)所證明。腫瘤組織細(xì)胞炎癥微環(huán)境的特點(diǎn)是白細(xì)胞不僅存在于腫瘤組織外圍基質(zhì)中，還深入浸潤到腫瘤組織內(nèi)部。這些浸潤到腫瘤組織內(nèi)部的白細(xì)胞，不僅可以促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的生長播散，還可以導(dǎo)致腫瘤免疫抑制。大量的實(shí)驗(yàn)證據(jù)表明，腫瘤細(xì)胞通過表達(dá)一些免疫相關(guān)基因/蛋白，例如某些細(xì)胞因子及其受體等，來模仿免疫細(xì)胞的功能

2、。這種免疫特性的獲得使得腫瘤細(xì)胞不僅可以產(chǎn)生促進(jìn)其自身生長的蛋白分子等，還可以通過操縱免疫系統(tǒng)產(chǎn)生免疫抑制微環(huán)境，促進(jìn)腫瘤的惡性發(fā)展。然而迄今為止，在食管癌組織細(xì)胞中，免疫相關(guān)基因或蛋白表達(dá)及其臨床意義尚不甚清楚。
　　實(shí)驗(yàn)研究方法：
　　首先，我們從18對食管癌及其配對的相對正常食管上皮組織樣本的RNA-seq分析中，篩選獲得11986個上調(diào)表達(dá)基因（上調(diào)2倍），作為基因集1；其次，從1對永生化食管上皮細(xì)胞及其惡性轉(zhuǎn)化的食

3、管癌細(xì)胞（SHEE和SHEEC）的RNA-seq分析中，篩選獲得2803個上調(diào)表達(dá)基因，作為基因集2；最后，我們又從KEGG通路中，確定800個發(fā)揮免疫功能的基因，作為基因集3?；诖耍覀儗⑸鲜?個基因集進(jìn)行交叉對比，從中找出34個共有基因。然后，再從該34個共有基因中挑選11基因，其編碼蛋白定位于細(xì)胞膜，作為本文的候選基因。在此基礎(chǔ)之上，我們進(jìn)一步通過聯(lián)合應(yīng)用組織芯片與免疫組化實(shí)驗(yàn)方法，選取兩個不同的隊(duì)列，檢測上述11個候選基因編碼

4、蛋白在食管癌組織中的表達(dá)情況，建立食管癌預(yù)后預(yù)警分子標(biāo)志物模型，評判食管癌患者預(yù)后。
　　實(shí)驗(yàn)結(jié)果與結(jié)論：
　　1）經(jīng)過多個層次的篩選比對分析，本文最終確定的11個候選基因是CCR1、CD40、CD44、CSF2RA、CXCR、F2R、IL3RA、ITGB、LILRB、MME和TLR2；2）免疫組化檢測結(jié)果表明，上述11個候選基因的編碼蛋白在相對正常食管上皮組織、不典型增生食管上皮組織，以及食管癌組織中均有所表達(dá)；3）三種組

5、織間比較，總體而言，11個候選基因的編碼蛋白在食管癌組織中表達(dá)明顯增強(qiáng)；4）進(jìn)一步的食管癌患者生存期相關(guān)分析結(jié)果表明，CD40、CXCR4、F2R和IL3RA，四者的表達(dá)水平，一對一分析，均與食管癌患者的生存期縮短顯著相關(guān)；5）將CD40、CXCR4、F2R和IL3RA四者，進(jìn)行四中取三，或全部的組合，構(gòu)建一聯(lián)合分子標(biāo)志物模型，開展食管癌患者生存期預(yù)警分析，結(jié)果表明，將CD40、CXCR4和F2R三者組合在一起所構(gòu)筑的聯(lián)合分子標(biāo)志物模型