氡染毒動物差異表達(dá)基因的高通量篩選.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:在建立氡染毒動物模型的基礎(chǔ)上,篩選和鑒定氡染毒動物外周血細(xì)胞、骨髓細(xì)胞和氣管—支氣管上皮細(xì)胞差異表達(dá)基因,為探討氡致肺癌的分子機制提供基礎(chǔ)資料。 方法:實驗用HD—3型多功能移動式氡室,對BALB/c小鼠和Wistar大鼠動態(tài)吸入染毒,建立動物模型。按照實驗動物吸入氡及其子體的累積劑量分為實驗組(100WLM)和對照組(室內(nèi)本底濃度,0.8WLM),每組4只動物。染毒時間每天8小時,每周6天。通過觀察小鼠外周血、骨髓細(xì)胞和

2、大鼠外周血的早期生物學(xué)指標(biāo)以及氣管—支氣管的病理學(xué)改變,建立動物模型。取小鼠外周血細(xì)胞、骨髓細(xì)胞和大鼠氣管—支氣管上皮細(xì)胞,抽提總RNA,采用SMART cDNA和抑制性消減雜交(Suppression Subtractive Hybridization,SSH)技術(shù),構(gòu)建差異表達(dá)基因cDNA文庫,TA克隆,選取含有插入cDNA片斷的克隆進(jìn)行反向Northern雜交篩選上調(diào)或下調(diào)的陽性克隆。陽性克隆的測序結(jié)果在GenBank Blast

3、中進(jìn)行同源性檢索,同源性高的序列進(jìn)行功能分析和生物信息學(xué)分析,同源性低的序列提交GenBank。用熒光實時定量PCR對最終得到的部分差異片斷進(jìn)行驗證。 結(jié)果:動物氡染毒100WLM后,小鼠外周血和骨髓細(xì)胞出現(xiàn)計數(shù)改變、脂質(zhì)過氧化損傷和遺傳學(xué)改變;大鼠外周血SOD活性降低和MDA含量升高,組織學(xué)檢查出現(xiàn)明顯的支氣管炎性浸潤。運用SMART cDNA和抑制性消減雜交成功構(gòu)建了消減cDNA文庫。挑取白斑1004個,獲得837個含有插入

4、片斷的單克隆,進(jìn)行反向Northern雜交,分析基因的上調(diào)或下調(diào)水平。選取差異表達(dá)克隆126個進(jìn)行測序及生物信息學(xué)分析,最終獲得44條已知功能或有注釋差異基因片斷,39條未知功能的已知差異基因片斷,24條重復(fù)差異基因,19條未知EST,其中未知EST提交至GenBank,獲得注冊號。44條已知功能或有注釋的差異基因的結(jié)果提示,篩選出的差別表達(dá)基因涉及氧化損傷、細(xì)胞增殖、凋亡、DNA損傷和腫瘤發(fā)生等多方面的功能。 結(jié)論:

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