對基因芯片中篩選與骨肉瘤相關(guān)長鏈非編碼RNA的初步驗證.pdf

1、目的：
　　 骨肉瘤是一種惡性程度極高的惡性腫瘤，預(yù)后是很差的，骨肉瘤發(fā)展迅速，如果未經(jīng)正規(guī)的處理，一年內(nèi)就會發(fā)生肺腫瘤轉(zhuǎn)移，導(dǎo)致患者生存率很低，截肢后3～5年存活率僅為5～15％。同其他惡性腫瘤一樣，骨肉瘤嚴(yán)重影響著人們健康。但是骨肉瘤的特點(diǎn)與其他腫瘤不同，骨肉瘤特別好發(fā)于一類人群，那就是青少年群體。近年來越來越多的長鏈非編碼RNA(lncRNAs)被發(fā)現(xiàn)，這些lncRNA被發(fā)現(xiàn)與很多疾病的發(fā)生發(fā)展有著密切的關(guān)系，包括腫瘤。在

2、這篇論文中，我們首先分析lncRNAs的結(jié)構(gòu)、功能、機(jī)制，然后通過基因芯片的結(jié)果結(jié)合文獻(xiàn)找出最有研究價值的lncRNAs，接著應(yīng)用realtimePCR技術(shù)驗證基因芯片的結(jié)果，最后我們分析結(jié)果，找出lncRNAs在骨肉瘤治療中的潛在性的作用以及對預(yù)后預(yù)測的分子靶點(diǎn)。
　　 方法：
　　 本研究采用本科室已有的上?？党缮镄酒净?例骨肉瘤標(biāo)本的芯片結(jié)果，初步獲得了骨肉瘤異常表達(dá)的基因，結(jié)合文獻(xiàn)進(jìn)一步分析在骨肉瘤發(fā)生發(fā)

3、展中可能起著重要作用的基因，從而篩選出11個表達(dá)上調(diào)的LncRNA，12個表達(dá)下調(diào)的LncRNA，進(jìn)一步利用分子生物學(xué)實(shí)驗real-timePCR驗證篩選出骨肉瘤中異常表達(dá)的LncRNA.
　　 結(jié)果：
　　 1、以骨肉瘤基因芯片結(jié)果為基礎(chǔ)，在骨肉瘤組織中獲得了251個異常表達(dá)的基因，其中表達(dá)上調(diào)的有68個，表達(dá)下調(diào)的有183個。
　　 2、結(jié)合文獻(xiàn)分析，找出23個具有研究價值的LncRNA，其中表達(dá)上調(diào)的有11

4、個，表達(dá)下調(diào)的有12個，它們分別為:ASLNC21868、ASLNC23518、ASLNC24291、ASLNC23844、exon4713、AW606502、ASLNC21888、DQ786309、BQ183547、BU617029、D20368、ASLNC17568、BF995651、AK026910、ASLNC18376、AK131233、BX649136、ASLNC03769、ASLNC13744、ASLNC19675、ASLN

5、C01877、ASLNC11197、ASLNC21134、BM720600
　　 3、通過實(shí)時熒光定量PCR(real-timequantitativePCR)技術(shù)對ASLNC01877這個基因在骨肉瘤組織中的表達(dá)進(jìn)行檢測，發(fā)現(xiàn)ASLNC01877這個基因在骨肉瘤中的表達(dá)確實(shí)比在癌旁組織中低，這與基因芯片的方向一致。
　　 結(jié)論：
　　 1、利用基因芯片發(fā)現(xiàn)骨肉瘤組織中確實(shí)存在大量表達(dá)上調(diào)或者下調(diào)的lncRNA<