重要病原菌毒力因子多樣性研究及數(shù)據(jù)庫的建立.pdf

1、近半個世紀以來，科學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展推動了現(xiàn)代醫(yī)學(xué)水平的飛速提高，極大的改善了人類健康生活水平。然而，傳染病仍然是公共衛(wèi)生安全的嚴重威脅，也是世界范圍內(nèi)引起人類死亡的主要原因之一。特別是近年來新發(fā)傳染病不斷涌現(xiàn)和一些以往已經(jīng)控制流行的傳染病再度猖獗，大量臨床耐藥菌株的不斷出現(xiàn)，使得病原菌的致病機理依然是當(dāng)今微生物學(xué)研究的重點和熱點之一。
　　 毒力是指病原體的致病性進行相對量化的描述，而近年來分子生物學(xué)技術(shù)以及基因組學(xué)的飛速發(fā)展，

2、許多病原菌的致病性已經(jīng)在分子水平上得到闡明。病原菌所編碼的那些能夠使其在宿主環(huán)境中黏附侵襲、繁殖和造成損傷的基因產(chǎn)物稱為毒力因子。對毒力因子的認識和研究不僅可以從分子水平揭示病原菌致病機理，而且可以為進一步研發(fā)有效的疫苗和新型抗毒力因子藥物提供線索。
　　 本研究在查閱大量原始文獻資料和系統(tǒng)的數(shù)據(jù)收集整理的基礎(chǔ)上，對常見的重要病原菌中已知的黏附與侵襲、分泌系統(tǒng)、細菌毒素、和鐵轉(zhuǎn)運四大類毒力因子進行了跨種屬的比較分析，共收集整理了

3、來自1100多篇文獻的，1145個毒力因子的數(shù)據(jù)，涉及75個屬160多種病原菌，近6000個毒力相關(guān)基因。分析內(nèi)容包括DNA序列、蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)域、三維結(jié)構(gòu)、編碼基因構(gòu)成、基因排布等。利用生物信息學(xué)技術(shù)分析歸納了同類毒力因子在不同病原菌中的DNA序列或蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的保守特征，發(fā)現(xiàn)其中的潛在規(guī)律，為在更多的細菌中發(fā)現(xiàn)新的潛在毒力因子提供有效手段。同時開展了一些重要毒力因子的演化過程和進化規(guī)律的分析，從而為揭示重要病原菌毒力因子的多樣性，及

4、其毒力進化過程和變異規(guī)律提供了線索，并為將來可能出現(xiàn)的新發(fā)和再發(fā)傳染病研究提供參考。另一方面，本研究所收集整理的大量原始數(shù)據(jù)和分析結(jié)果都很好的整合進入了病原菌毒力因子數(shù)據(jù)庫VFDB，同時在數(shù)據(jù)庫頁面中使用了ExtJS跨平臺的JavaScript類庫，發(fā)揮JS在客戶端運行的優(yōu)勢，一方面可以減輕服務(wù)器端的計算負擔(dān)，另一方面可以實現(xiàn)更加友好的的用戶界面，網(wǎng)頁里的數(shù)據(jù)可以象在Excel表里一樣排序，篩選，使用起來非常方便。本研究不僅進一步拓展豐