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1、DNA分子機(jī)器在核酸放大檢測(cè)中的應(yīng)用研究學(xué)位論文完成日期:指導(dǎo)教師簽字:2Q12生魚旦晝目絲墟答辯委員會(huì)成員簽字:之銘定》態(tài)硪與二蟄青島科技大學(xué)研究生學(xué)位論文DNA分子機(jī)器在核酸放大檢測(cè)中的應(yīng)用研究摘要光學(xué)分析法具有較高的靈敏度和選擇性,且具有方法簡(jiǎn)單實(shí)用、操作方便、高效、快速等優(yōu)點(diǎn),受到研究者的廣泛關(guān)注。本文基于DNA分子機(jī)器建立了兩種核酸放大檢測(cè)的新方法——基于DNA輪烷結(jié)構(gòu)的交叉滾環(huán)復(fù)制放大方法和基于核酸外切酶的級(jí)聯(lián)循環(huán)放大方法,
2、采用光學(xué)分析法檢測(cè),分別實(shí)現(xiàn)了對(duì)腫瘤細(xì)胞中提取的信使RNA(mRNA)和免標(biāo)記DNA的高靈敏度、高選擇性測(cè)定,并將這兩種方法成功應(yīng)用于復(fù)雜樣品和血清樣品的分析。本文豐要開展了以下兩個(gè)方面的工作:一、基于DNA輪烷結(jié)構(gòu)的交叉滾環(huán)復(fù)制放大檢測(cè)腫瘤細(xì)胞中mRNA的研究建立了一種高靈敏度和高選擇性的免PCR檢測(cè)mRNA表達(dá)水平的新方法。首先,合成兩種DNA準(zhǔn)輪烷結(jié)構(gòu)(DPRI和DPR—II),加入與Bactin0CTB)mRNA相對(duì)應(yīng)的靶cDN
3、A,DPR—I中的缺口環(huán)作為滾環(huán)復(fù)制反應(yīng)的模板,在生物素修飾的引物、DNA酶和dNTPs的作用下,引發(fā)滾環(huán)復(fù)制反應(yīng),取代釋放DNA,引發(fā)DPRI和DPR—II之間的交叉滾環(huán)復(fù)制過(guò)程。合成出滾環(huán)復(fù)制產(chǎn)物包含多個(gè)HRP模擬酶單元,可催化H202氧化ABTS。生成ABTS一??紤]到在ABTS2。/H202紫外可見體系中hemin本身產(chǎn)生的高背景值,通過(guò)生物素一親和素的特異性識(shí)別,采用親和素包被的磁珠捕獲生物素化的滾環(huán)復(fù)制產(chǎn)物檢測(cè)cDNA的檢測(cè)
4、限可達(dá)01zmol,靈敏度與PCR方法相當(dāng)。將所建立的方法應(yīng)用j二乳腺癌細(xì)胞中ACTBmRNA的檢測(cè),具有一定的臨床應(yīng)用價(jià)值。二、基于核酸外切酶級(jí)聯(lián)循環(huán)放大免標(biāo)記檢測(cè)DNA的研究采用三種無(wú)標(biāo)記頸環(huán)結(jié)構(gòu)DNA(MBl,MB2,MB,),基于核酸外切酶lII(Exo。III)作用于雙鏈DNA,沿3’一5’方向逐步切去單核苷酸的性質(zhì),通過(guò)靶DNA的引發(fā),實(shí)現(xiàn)了基于核酸外切酶輔助的級(jí)聯(lián)循環(huán)放大(ExoCRA)免標(biāo)記檢測(cè)DNA。通過(guò)優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件(
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