兒童過敏性紫癜基因表達(dá)譜及腎損傷相關(guān)基因研究.pdf

1、目的：
　　 用Roche NimbleGen人基因表達(dá)譜芯片技術(shù)篩選過敏性紫癜(HenochSchonlein purpura，HSP)患兒疾病發(fā)生及腎損傷相關(guān)基因，以進(jìn)一步從分子水平更全面、系統(tǒng)地分析兒童HSP發(fā)生發(fā)展及腎損傷發(fā)生機(jī)制。
　　 方法：
　　 利用Roche NimbleGen人基因表達(dá)譜芯片(約含有45033個(gè)基因)，分別檢測單純過敏性紫癜組外周血(HSP)、紫癜性腎炎組外周血(HSPN)、健

2、康對(duì)照組外周血(C)的基因表達(dá)譜，用相關(guān)生物信息學(xué)分析方法對(duì)不同實(shí)驗(yàn)組間基因表達(dá)譜進(jìn)行差異分析，最后應(yīng)用實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)對(duì)部分差異表達(dá)基因進(jìn)行驗(yàn)證。
　　 結(jié)果：
　　 1、單純過敏性紫癜組與對(duì)照組間：共有1064條差異表達(dá)基因，其中2倍以上差異基因225條，2.5倍以上38條，3倍以上5條；其中225條2倍以上差異基因中146條表達(dá)上調(diào)，79條表達(dá)下調(diào)。紫癜性腎炎組與單純過敏性紫癜組：共有830條差異表達(dá)基因，其中2

3、倍以上差異基因283條，2.5倍以上118條，3倍以上51條；其中283條2倍以上差異基因中180條表達(dá)上調(diào)，103條表達(dá)下調(diào)。
　　 2、隨機(jī)選取其中3條差異基因進(jìn)行Real.time PCR驗(yàn)證，其結(jié)果與基因芯片篩查結(jié)果一致，結(jié)果充分證實(shí)表達(dá)譜芯片差異表達(dá)基因結(jié)果的可靠性。
　　 3、對(duì)單純過敏性紫癜組與對(duì)照組2倍以上差異基因進(jìn)行GO生物學(xué)過程分析發(fā)現(xiàn)，已知功能分類的共119條，主要涉及：轉(zhuǎn)錄/翻譯、物質(zhì)合成/代謝過

4、程和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)/通路相關(guān)基因，其次為分化/發(fā)育、免疫/炎癥和凋亡/抗凋亡相關(guān)基因；而在紫癜性腎炎組與單純過敏性紫癜組2倍以上差異基因中，我們發(fā)現(xiàn)已知功能分類的有201條，主要涉及：物質(zhì)合成/代謝過程相關(guān)基因，其次為轉(zhuǎn)錄/翻譯、免疫/炎癥、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)/通路、分化/發(fā)育和細(xì)胞周期。
　　 4、初步篩選出免疫炎癥/細(xì)胞黏附/信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路相關(guān)基因AIF1、LAMC2、BCAM、CD209、MFAP4、ELMOD3、SCUBE1、ADAM33

5、、RET、CLEC7A、MASP2、TAPS、AOAH、MGST2、PSMA3、SP100，代謝/凋亡相關(guān)基因MUC3B、MUC1、HSD11B1、MTHFS、TNFAIP8及未知基因BM88、CEACAM3等可能在HSP發(fā)病中起重要作用，同樣也篩選出免疫炎癥/信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路相關(guān)基因KRT18、GRB10、VEGFB、HSP90AB1、HSPD1、F12、TGFBR2、TGM2、UBE2L6、CTSS、PXDN、GBP2、HLA-DRB1

6、、HLA-DMA、HLA-DPA1，代謝/分化發(fā)育/凋亡相關(guān)基因SORD、HSPE1、ARG2、HSP90AA2、PRAME、TNFAIP2、MMP19、ZFP36L1，細(xì)胞黏附相關(guān)基因CLDN4及未知基因CKMT1B等可能與HSP腎臟損傷的發(fā)生密切相關(guān)。
　　 結(jié)論：
　　 l、首次用快速高通量的表達(dá)譜芯片篩選出過敏性紫癜及紫癜性腎炎相關(guān)基因。
　　 2、初步篩選出(AIF1、BCAM、CLEC7A、CD209

7、、AOAH、MAPS2等)可能導(dǎo)致HSP發(fā)病的易感基因，進(jìn)一步證實(shí)了免疫炎癥、細(xì)胞黏附相關(guān)基因的表達(dá)異常可能在HSP發(fā)病過程中起到了主導(dǎo)作用，同時(shí)也發(fā)現(xiàn)了一些可能導(dǎo)致HSP發(fā)生的代謝/凋亡相關(guān)基因(如MUC3B、HSD11B1、MTHFS、TNFAIP8等)及未知基因。
　　 3、研究不僅證實(shí)了在HSP腎損傷過程中可能起重要作用的已被認(rèn)識(shí)的基因如VEGFB、HLA-DRB1，也首次發(fā)現(xiàn)了一些以往在HSPN發(fā)病過程中未曾報(bào)道的已知