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文檔簡介
1、目的:描述浙江省寧波市鄞州區(qū)人群PCSK9、LDLR基因多態(tài)性的分布情況,篩選出與高脂血癥發(fā)生關(guān)系密切的SNP位點,探討基因-基因、基因-環(huán)境的交互作用,為高脂血癥的個體化預(yù)防提供依據(jù)。
方法:對浙江省寧波市鄞州區(qū)40歲以上的人群進行病例對照研究,其中高脂血癥患者1532例,對照771例,檢測其體重、腰圍、血壓等指標,調(diào)查病例和對照組成員的生活行為習慣。經(jīng)知情同意,每名研究對象采集外周血,應(yīng)用連接酶檢測反應(yīng)技術(shù),檢測研究對象P
2、CSK9、LDLR基因8個SNP位點基因分型,利用SPSS17.0統(tǒng)計軟件包對實驗數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計學處理,主要采用t檢驗、方差分析、χ2檢驗、非條件logistic逐步回歸分析等,應(yīng)用Haploview軟件進行基因位點間的連鎖不平衡分析,運用R軟件中的Haplo.stats程序包進行單體型分析,采用叉生分析的方法對有意義的基因與環(huán)境因素進行交互作用分析。
結(jié)果:⑴除身高、HDL-C外,高脂血癥組各項體格檢查指標及生化指標均值均高于
3、對照組相應(yīng)指標均值( P<0.05)。⑵樣本中8個SNP的基因型頻率分布全部符合Hardy-Weinberg平衡( P>0.05)。⑶rs2738466位點基因型為GG的HDL-C水平低于AG+AA的HDL-C水平,有統(tǒng)計學差異( P<0.01),rs1003723位點基因型為CC的TC、LDL-C水平低于CT+TT的TC、LDL-C水平,rs6413504位點基因型為AA的TC、LDL-C水平低于AG+GG的TC、LDL-C水平,差異
4、均有統(tǒng)計學意義( P<0.01)。⑷PCSK9基因rs2479409、rs17111503、rs2483205、rs662145、rs11583680和LDLR基因rs1003723、rs6413504位點的基因型頻率在高脂血癥組和對照組間差異均無統(tǒng)計學意義( P均大于0.05),但LDLR基因rs2738466的基因型頻率在兩組間有差異。⑸調(diào)整年齡的logistic分析,LDLR基因rs2738466位點多態(tài)性與高脂血癥存在關(guān)聯(lián)( O
5、R=1.40,95%CI=1.08~1.82),多因素分析PCSK9基因rs662145位點,LDLR基因rs2738466、rs6413504位點,BMI、腰圍、SBP、體力活動、飲酒與高脂血癥相關(guān)(OR=1.42,95%CI=1.11~1.81;OR=1.27,95%CI=1.04~1.55;OR=1.30,95%CI=1.08~1.58; OR=1.68,95%CI=1.42~1.99; OR=1.33,95%CI=1.07~1.
6、65; OR=1.50,95%CI=1.24~1.82;OR=0.85,95%CI=0.75~0.96;OR=0.58,95%CI=0.46~0.73)。⑹PCSK9基因SNP位點構(gòu)成的單體型與高脂血癥沒有關(guān)聯(lián)。LDLR基因rs2738466(A/G)、rs1003723(C/T)構(gòu)成單體型GC與高脂血癥有關(guān)( OR=1.20,95%CI=1.04~1.38)。⑺rs662145、rs2738466、rs6413504與BMI有交互作用
7、,rs662145與SBP有交互作用( P交互作用<0.05),rs662145與rs2738466有交互作用( P交互作用<0.05)。
結(jié)論:攜帶rs2738466位點次要等位基因個體的HDL-C較低,攜帶rs1003723、rs6413504位點次要等位基因個體的TC、LDL-C較高;PCSK9基因rs662145位點CT+TT基因型,LDLR基因rs2738466和 rs6413504位點AG+GG基因型,超重及肥胖,
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