應(yīng)用點著色聚類方法識別阿爾茨海默病致病基因.pdf_第1頁
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3、卜應(yīng)用點著色聚類方法識別阿爾茨海默病致病基因計算數(shù)學(xué)專業(yè)研究生:周江霖指導(dǎo)教師:龐朝陽摘要阿爾茨海默病是一種最常見的癡呆癥。識別與阿爾茨海默病有關(guān)的候選致病基因是一項重要的研究。目前通過分析DNA微陣列數(shù)據(jù)從而識別與疾病有關(guān)的基因已經(jīng)成為一個熱點,并且在這些分析方法中,聚類是計算分析的一個基礎(chǔ)。在本文中,應(yīng)用圖論中的點著色理論,將表達相似的基因聚在一起(即生物功能相近的基因聚在一起)。然后分析聚類后的結(jié)果,識別出可能與阿爾茨海默病有關(guān)的

4、基因。本文提出了在圖論的點著色基礎(chǔ)上一種全新的聚類識別方法。運用這種方法,識別了27個基因與阿爾茨海默病有關(guān),并且其中3個基因已經(jīng)被其他研究小組證明與阿爾茨海默病有關(guān),另外2個基因與神經(jīng)疾病有關(guān)。本文的方法有如下三個優(yōu)點:1能將共同表達的基因聚在一起;2聚類后得到類的個數(shù)在理論上是最少的:3使用點著色方法對基因進行聚類和識別在過去的研究中從沒被提出過。本文主要研究內(nèi)容如下:(1)介紹了阿爾茨海默病的研究現(xiàn)狀和DNA微陣列技術(shù),并介紹DN

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