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文檔簡介
1、阿爾茨海默病(Alzheimer's Disease)是一種癡呆癥，該病危害性極大。目前仍未知該病的病發(fā)原因。利用計(jì)算方法對AD基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘，識別與AD有關(guān)的候選致病基因，研究它們的致病機(jī)理。對尋找治愈AD方法的研究而言是有一定參考意義的。
聚類分析是處理生物數(shù)據(jù)常用方式。結(jié)合生物信息理論本文選擇改進(jìn)了的模糊C均值算法(FCM)—基于PCA的模糊迭代自組織算法對基因表達(dá)數(shù)據(jù)聚類。首先，利用主成分分析方法(PCA)對AD
2、基因表達(dá)數(shù)據(jù)降維來獲取FCM的初始類別數(shù)目和類別中心。其次，利用模糊目標(biāo)函數(shù)和模糊約束函數(shù)，確定FCM算法的模糊指數(shù)。最后，引入迭代自組織數(shù)據(jù)分析方法(ISODATA)控制或優(yōu)化FCM算法的類別數(shù)，減小算法失真，獲得較好的聚類結(jié)果。
通過算法最終文章識別出29個AD可能的致病基因。對基因進(jìn)行理論上的分析后得到如下結(jié)論:①輔助性伴侶蛋白表達(dá)異常降低機(jī)體ATP供能可能導(dǎo)致Aβ沉積而引發(fā)AD。②基因RERE、HNRNPC表達(dá)異常通過
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