45389.蜘蛛組蛋白h3基因保守序列的克隆與進(jìn)化分析

1、號(hào)科門科專導(dǎo)教究文題研究類⑩煦型荸礎(chǔ)霉壅』匕Z。薌羹紫了鬻纛vE髓S掣纛’鬻碩士學(xué)位論文類業(yè)師生。蔗黛黲幻擴(kuò)鬻黲震飄然泌理學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)曾慶韜教授張瓊目卻警粵等守竺蘭里堡!堂型竺克隆與進(jìn)化分析答辯日期：二oo六年六月六日學(xué)學(xué)指研論摘要本論文主要對(duì)蜘蛛3個(gè)科54個(gè)種的組蛋白H3基因的一級(jí)結(jié)構(gòu)、二級(jí)結(jié)構(gòu)及其蛋白質(zhì)序列進(jìn)行了分析結(jié)果表明：組蛋白H3基因不存在缺失／插入?yún)^(qū)，A、T、c、G含量比較平均，變異位點(diǎn)數(shù)122，簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)數(shù)74

2、：在所分析成員中存在高度保守的區(qū)段：“GGCCTGATAcGA”。利用RNAdr鉀軟件模擬的二級(jí)結(jié)構(gòu)顯示：二級(jí)結(jié)構(gòu)與分類關(guān)系遠(yuǎn)近沒有關(guān)聯(lián)，DNA一級(jí)結(jié)構(gòu)高度保守的區(qū)段都不分布在二級(jí)結(jié)構(gòu)“莖”區(qū)。氨基酸水平上不同科間差異比較大，而相同科內(nèi)的所有成員氨基酸差異不明顯(PO05)，在所有分析的種內(nèi)“ATvPGLYR孵FLTPPVAGAL”完全保守。我們利用DNsP3O軟件計(jì)算了系統(tǒng)樹每個(gè)支序的Ka／Ks比值(Ka／Ksratios)，結(jié)果顯示

3、：組蛋白m基因在加速進(jìn)化現(xiàn)象。進(jìn)一步MacDonald—l(reitlllan中性檢驗(yàn)(MacDonald—I(reitmanneutralitytestneutralitytest)檢驗(yàn)結(jié)果證實(shí)譜系內(nèi)基因的不同區(qū)域的選擇壓力不同。slidingwindow分析支持蜘蛛組蛋白H3基因的3’端承受著正向選擇壓力。ML和Bayesan法構(gòu)建的分子系統(tǒng)樹基本一致，皿蛛科，圓蛛科和球腹科聚類為獨(dú)立的三大支系，并且各科都形成單起源系，皿蛛科為第一