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1、上海大學(xué)碩士學(xué)位論文TCP轉(zhuǎn)錄因子和真核RdRP基因家族的分子進(jìn)化學(xué)研究姓名：姚譞申請學(xué)位級別：碩士專業(yè)：生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師：王健張大兵20080501上海大學(xué)碩士學(xué)位論文ABSTRACTBioinformaticswaswidelyusedindifferentfieldsofbiologicalresearchesInthispaperweapplieditinthestudiesonthemolecularevoluti
2、onofTCPtranscriptionfactorgenefamilyandeukaryoticRdRPgenefamilySeveralTCPgeneshavebeenreportedtoplayimportantrolesinplantdevelopment，theTCPhomologsencodesaplantspecifiicfamilyofputativetranscriptionfactorsTounderstandthe
3、evolutionaryrelationshipofTCPgenesofArabidopsisthalianaandOryzasativa三(hereaftercalledrice)，weidentified23and22TCPgenesinArabidopsisandricegenomedatabases，andtheirphylogeneticanalysesindicatethattheyformthreewellsupporte
4、dclades，whicharedefinedassubfamiliesWealsoanalysedtheaminoacidcontributionintheTCPdomain，showingthatitdisplayedallatypicalbHLHstructure，implyingthattheseconservedresidueswereimportantforthefunctionsofTCPproteinsBesidesTC
5、Pdomain，othermotifswerealsoincludedinsomeTCPproteinsThegenomedistributionoftheTCPgenesstronglysupportsthehypothesisthatgenome—wideandtandemduplicationcontributedtotheexpansionoftheTCPgenefamilyTheexpressionpatternsofTCPg
6、enesinArabidopsisandriceindicatedthattheymightplaydifferentrolesinthemolecularregulationofplantdevelopmentEukaryoticRNAdependentRNApolymerase(RdRP)wasshowedtoheimportantindiverseRNAsilencingmechanisms，whichwereprovedtobe
7、importantindevelopmentalregulation，maintenanceofgenomeintegritydefenseagainstforeignnucleicacidandSOon，anditshomologsencodeaeukaryoticgenefamilyInthisarticle，weidentifiedthegenefamilymembersinwiderangeofeukaryotes，fromea
8、rlybranchingprotiststomulticellularorganisms，includingplants，animalsandfungiAnimalRdRPswerenotaswidelydistributedasthatinplantsandfungi，anditcouldnotbedetectedinsomeanimals，eventhoughRNAinterferenceOccursintheseorganisms
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