SET基因家族的分子進(jìn)化機(jī)制和基于RNa-Seq技術(shù)的擬南芥花轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究.pdf_第1頁(yè)
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1、目錄目錄Ej錄I摘要1Abstract3前言5一日U舌第一部分研究綜述和背景。711植物基因組研究現(xiàn)狀7111基因組重復(fù)7112基因組的進(jìn)化速率lO12基因家族13121基因家族的定義13122植物基因家族1413基因重復(fù)17131基因重復(fù)機(jī)制18132基因重復(fù)后的保留19133基因重復(fù)后分化機(jī)制19134基因重復(fù)后表達(dá)分化2l14基因家族進(jìn)化模型2215轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展及應(yīng)用23151轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展23152RNASeq技術(shù)的應(yīng)用241

2、53花發(fā)育轉(zhuǎn)錄組研究現(xiàn)狀2516參考文獻(xiàn)26第二部分SET基因家族的分子進(jìn)化3321摘要。3322引言3323材料與方法38231基因家族成員識(shí)別38232多序列聯(lián)配和構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹39233基因在染色體組上的定位和基因重復(fù)類型分析40目錄第四部分基于RNASeq技術(shù)的擬南芥花轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究。8741摘要。8742慧：：=lIillllllllllllllllllllllllllllllllllllllll87lllllll43材料與方法

3、‘Y270611589431樣本收集及測(cè)序89432樣本與基因組比對(duì)89433計(jì)算基因表達(dá)量及差異表達(dá)基因89434Zscore計(jì)算90435基因家族和GO注釋9044結(jié)果和討論90441RNASext技術(shù)檢測(cè)到大量基因表達(dá)90442RNA—Seq技術(shù)比傳統(tǒng)芯片多檢測(cè)到的8512個(gè)基因93443擬南芥至少有多少基因表達(dá)95444全局分析花發(fā)育的轉(zhuǎn)錄組96445鑒定參與花發(fā)育過程中的基因98446不同的花發(fā)育階段中富集調(diào)控基因99447一

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