水稻Rho GTP酶激活蛋白編碼基因OsRhoGAP1的特征分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、水稻OsRhoGAP1和OsRhoGAP2是通過酵母雙雜交篩選到的與水稻Rop蛋白OsRacD相互作用蛋白的編碼基因。前期研究提示,OsRacD可能參與水稻育性調(diào)控。為了研究OsRhoGAP1基因在水稻生長發(fā)育過程中的作用,本研究分析比較了兩種OsRhoGAPs基因的序列特征以及在水稻不同發(fā)育階段的表達(dá)特性,進(jìn)一步分析了OsRhoGAP1的表達(dá)與外源植物激素的關(guān)系,預(yù)測和分析了該基因的啟動子序列,構(gòu)建了OsRhoGAP1的植物過表達(dá)載體

2、,并轉(zhuǎn)化水稻,篩選陽性轉(zhuǎn)基因植株,為深入研究OsRhoGAP1的功能及調(diào)控機(jī)制奠定基礎(chǔ)。
  采用生物信息學(xué)方法對OsRhoGAP1和OsRhoGAP2進(jìn)行了序列特征分析和比較。水稻基因組序列數(shù)據(jù)庫的檢索顯示,OsRhoGAP1和OsRhoGAP2分別定位于12號和2號染色體上,兩個基因具有相似的基因結(jié)構(gòu),都包含5個外顯子和4個內(nèi)含子。OsRhoGAP1的cDNA編碼區(qū)全長1353bp,編碼450個氨基酸和1個終止密碼,OsRho

3、GAP2的cDNA編碼區(qū)全長1320bp的編碼框,編碼439個氨基酸和1個終止密碼。兩個基因編碼蛋白都具有植物RhoGAP/RopGAP蛋白保守的序列特征,即含有RhoGAP和CRIB兩個保守結(jié)構(gòu)域,但在N端和C端序列的差異較大。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,OsRhoGAP1與水稻OsRacGAP3相似性最高,OsRhoGAP2與玉米ZmRacGAP2相似性最高。
  采用實時定量PCR技術(shù)分析了OsRhoGAP1和OsRhoGAP2在水稻

4、不同發(fā)育階段的組織表達(dá)特性,結(jié)果顯示,這兩個基因在水稻不同發(fā)育階段均顯示廣泛表達(dá)的特征,并且二者的組織表達(dá)特性具有一致性,主要在細(xì)胞分裂旺盛的幼葉、幼根、幼穗,以及成熟根中高表達(dá),提示它們可能參與了水稻相關(guān)生長、發(fā)育、分化等過程。然而,OsRhoGAP1和OsRhoGAP2在特定發(fā)育階段的表達(dá)量存在差異,提示它們可能各自具有獨(dú)特的功能。
  數(shù)據(jù)庫檢索和預(yù)測提示,OsRhoGAP1啟動區(qū)含有光、植物激素、非生物脅迫應(yīng)答的元件。為確

5、定激素對該基因表達(dá)的影響,采用實時定量PCR技術(shù)分析了6種植物激素對OsRhoGAP1表達(dá)的影響,結(jié)果顯示,ABA、SA、MeJA使OsRhoGAP1的表達(dá)先上調(diào)至3~4.1倍后出現(xiàn)下調(diào),GA使之出現(xiàn)大幅度上調(diào),最大幅度為6.4倍,而IAA和6-BA則使之迅速下調(diào)至0.2~0.3倍。說明該基因的表達(dá)受到多種植物激素信號的調(diào)控,尤其以GA、IAA和6-BA對該基因表達(dá)的影響最為顯著。
  為了通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)鑒定OsRhoGAP1基因

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