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文檔簡介
1、已有研究顯示,植物RhoGAP/RopGAP可能通過調(diào)節(jié)Rop蛋白來參與多種生物學過程。本實驗室采用酵母雙雜交技術(shù),從水稻幼穗中分離得到一個與水稻Rho/Rop蛋白OsRacD相互作用蛋白的編碼基因,命名為OsRhoGAP2,目前對該基因的研究尚未見報道。本研究從序列特征、亞細胞定位、激素對該基因表達的影響、啟動子的克隆和序列缺失、過表達和RNA干擾技術(shù)鑒定該基因功能開展一系列的研究,旨在確定該基因的調(diào)控機制及其在水稻生長發(fā)育中的功能,
2、為研究OsRacD與OsRhoGAP2的相互作用和功能聯(lián)系奠定基礎(chǔ)。
采用生物信息學分析,對OsRhoGAP2的基因結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)、編碼蛋白的二級結(jié)構(gòu)和亞細胞定位等特性進行了預測。結(jié)果顯示,OsRhoGAP2位于2號染色體,由5個外顯子和4個內(nèi)含子組成。該基因cDNA全長1552bp,含有一個1320bp的讀碼框,編碼439個氨基酸和1個終止密碼子。蛋白序列中包括RhoGAP和CRIB保守結(jié)構(gòu)域,屬親水蛋白,二級結(jié)構(gòu)主要由α螺
3、旋、β轉(zhuǎn)角和無規(guī)則的螺旋組成。
為研究OsRhoGAP2的亞細胞定位,采用DNA重組技術(shù),構(gòu)建了與綠色熒光蛋白(eGFP)融合的pCAMBIA1302-OsRhoGAP2-eGFP載體,使其受控于CaMV35S強啟動子。采用農(nóng)桿菌侵染的方法,檢測融合蛋白在洋蔥表皮細胞中的分布,發(fā)現(xiàn)OsRhoGAP2-eGFP融合蛋白主要定位在細胞膜上。
為研究OsRhoGAP2基因的表達調(diào)控機制,通過水稻基因組序列數(shù)據(jù)庫的檢索和比對
4、,確定了OsRhoGAP2基因翻譯起點上游1912bp的啟動子序列,采用植物啟動子順式元件數(shù)據(jù)庫比對,對啟動子的元件進行了預測和分析。結(jié)果顯示,該基因的表達可能受到激素、高鹽和干旱等非生物脅迫的調(diào)控。進而采用實時PCR技術(shù)檢測了IAA、6-BA、GA、SA、MeJA、ABA等6種植物激素,以及高鹽、干旱等非生物脅迫對該基因表達的影響,發(fā)現(xiàn)該基因在IAA、6-BA、GA、SA處理下,表達量均有2倍以上的提高。在MeJA和ABA激素的處理下
5、,OsRhoGAP2基因的表達量變化幅度在2倍以內(nèi);而在干旱和鹽等非生物脅迫處理過程中發(fā)現(xiàn),OsRhoGAP2基因的表達量都在3h時達到最大值,然后逐漸恢復到正常水平。兩類實驗的共同提示,OsRhoGAP2的表達受到多種信號的調(diào)控。為進一步研究其表達調(diào)控機制,通過PCR介導的方法,克隆了該基因的啟動子序列,并進行了序列缺失,分別構(gòu)建了6個與GUS報告基因融合的系列啟動子缺失植物表達載體,為進一步通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)鑒定該基因的表達調(diào)控機制奠定
6、基礎(chǔ)。
為了鑒定OsRhoGAP2基因的功能,采用了功能獲得和功能缺失兩種策略,分別構(gòu)建了OsRhoGAP2基因的過表達植物載體以及RNA干擾植物表達載體,并通過農(nóng)桿菌介導的方法轉(zhuǎn)化水稻,獲得了19棵T0代陽性過表達轉(zhuǎn)基因植株。分子檢測顯示,重組基因已經(jīng)整合到水稻基因組中,并實現(xiàn)了過表達。OsRhoGAP2基因干擾轉(zhuǎn)基因植株的篩選正在進行當中。
本文通過一系列實驗對OsRhoGAP2基因的序列特征、表達及調(diào)控機制以及
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