葫蘆科植物中NBS-LRR類抗病基因的基因組學與進化研究.pdf

1、背景:在不同植物中，NBS-LRR編碼基因（R基因）數(shù)量的變化非常大。在已經(jīng)測序的植物物種中，黃瓜，甜瓜和西瓜基因組中抗病基因的數(shù)量非常少，分別只有70，71和55個。目前植物抗病基因數(shù)量低拷貝數(shù)的機制還不清楚。
　　 結果:在本研究中，研究了來自8個葫蘆科栽培物種以及一個野生物種的R基因。全基因組的抗病基因鑒定，系統(tǒng)分化分析以及兼并引物PCR分析表明，在葫蘆科植物中，只有有限的抗病基因家族數(shù)量，我們手工注釋了已經(jīng)測序的黃瓜、甜

2、瓜和西瓜中的抗病基因，發(fā)現(xiàn)有超過半數(shù)的基因是假基因，沒有找到據(jù)有嵌合體結構的R基因家族，并且和預期一樣，大部分尺基因在黃瓜的不同基因型中高度保守。同時，我們根據(jù)這些家族建立了葫蘆科植物抗病基因的結構模型，可以方便今后葫蘆科植物抗病基因的注釋。然而，在野生型葫蘆科物種栝樓中，發(fā)現(xiàn)了一個具有嵌合體結構的抗病基因家族。通過比較葫蘆科植物和楊樹及大豆基因組中的R基因，我們發(fā)現(xiàn)在葫蘆科物種中頻繁的丟失尺基因家族。并且，在葫蘆科中，R基因在每個家族