黃瓜根結RDR酶基因的分離與表達分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、依賴于RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RDRP)在真核生物中廣泛存在,植物中有四類RDR酶,其成員參與了植物的生長發(fā)育等,參與多種調控作用。為了確定黃瓜根結發(fā)育過程中表達的RDR酶基因及其表達特點,從黃瓜cDNA中克隆了黃瓜到了5種與根結發(fā)育過程中表達的的CsRDR基因的編碼序列,對其進行了序列分析；并且分析CsRDR基因在根結發(fā)育中的表達特性。主要研究結果如下:
　　 1.以全基

2、因組測序的黃瓜(Cucumis sativus L.)品種9930為材料,接種南方根結線蟲二齡幼蟲(Meloidogvne incognita),利用所設計的引物,采用RT-PCR的方法獲得了5種與根結發(fā)育發(fā)育中表達的CsRDR基因(CsRDR1a、CsRDR1b,CsRDR1c、CsRDR2,CsRDR6)的編碼序列。在全基因組水平上,基因定位分析表明,CsRDR1a、CsRDR1b和CsRDR1c位于5號染色體；CsRDR2和CsR

3、DR6分別位于1號和2號染色體上。GenBank登錄號為HQ738485-HQ738489。
　　 2.序列分析表明CsRDR基因編碼的蛋白序列均含有真核生物RDR酶的特征基序DbDGD(b在RDR3中為F,在RDR1、RDR2、RDR6中為L)。系統(tǒng)發(fā)育樹分析表明CsRDR1a、CsRDR1b,CsRDR1c編碼第一類RDR,CsRDR2和CsRDR6分別編碼第二類和第四類RDR。
　　 3.用qPCR的方法分析5種C

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