病原微生物分子分型技術研究進展_論文

1、111病原微生物分子分型技術研究進展病原微生物分子分型技術研究進展現(xiàn)代分子分型技術主要包括質粒DNA圖譜分析、限制性內切酶消化后的染色體DNA分析、核酸探針雜交、脈沖場凝膠電泳(PFGE)、PCR和多位點序列分析(MLST)技術。DNA重復序列PCR技術(RepPCR)的實用性強、低用費、可再現(xiàn)性好，可用來進行普查工作。PFGE技術分辨力高，是病原微生物分子分型的最佳選擇。而有更高分辨力和再現(xiàn)力的MLST新技術正在逐漸被使用。這些分子分

2、型技術將有助于在全球范圍內進行病原微生物流行病學研究。本文對近年來常用的病原微生物分子分型技術的研究進展作一綜述。1評估分型技術標準的可行性評估一項分型技術是否可行的標準有2個：完成標準(有效性)和便利標準(效率性)。完成標準包括分型能力、分辨力和分型技術間的一致性，而便利標準包括通用性、快捷性、解釋和執(zhí)行的容易程度。一項分型技術的分型能力意味著通過這項分型技術，分離株被劃分為所屬類型的比例。再現(xiàn)性是指通過這種技術對同種樣品在重復檢測時

3、，產生相同結果的能力。分辨力是指擁有一致的或非常相似的相關圖譜的分離株事實上具有相同的傳播途徑的可能性。2種分型技術的一致性通過使用這些技術把高度相似的分類株分組歸類而被評價〔1，2〕。因此，對一種分型技311性(超螺旋的、斷口的和線形的)而被影響，而凝膠電泳時具有不同遷移速度。大多數病原微生物有質粒，但沒有質粒的就不能用此技術分型。此外，由于有些分離株中含有1個或2個質粒，會使菌株間的分辨力降低〔4〕。22染色體DNA限制性內切酶分

4、析技術染色體DNA經限制性核酸內切酶消化，消化后的片段再通過瓊脂糖凝膠電泳進行分離。用限制性內切核酸酶BglⅡ和EcI等消化病原微生物基因組DNA，因為它們對染色體上的酶切位點非常敏感，可以產生大量短的片段。電泳后，將獲得一系列被分離的DNA圖譜。通過比較圖譜，就可以進行菌相似性研究。幾乎所有的病原微生物分離株都可以通過這種方法分型，但由于基因組DNA巨大，酶切后產生的片段眾多，且含有大量的重疊片段，這將導致菌株間圖譜一致性分析產生困難