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文檔簡介
1、慢性腎臟疾病的發(fā)病率逐年增長,已成為醫(yī)學(xué)界的一大難題。中藥方劑對于解決疑難雜癥有很好的效果,但其作用機(jī)理尚不明確。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)從分子角度研究藥物作用人體靶點(diǎn)的治病原理,而中藥具有多成分、多靶點(diǎn)的特色,使用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方劑能很好地解釋方劑的藥理機(jī)制,有助于輔助醫(yī)生進(jìn)行決策。
本文以中藥成分作用機(jī)制為研究點(diǎn),研究中藥成分作用的靶點(diǎn)蛋白和疾病來分析方劑在分子水平的藥理機(jī)制,輔助醫(yī)生進(jìn)行決策。本文研究點(diǎn)主要包括作用關(guān)系預(yù)測、網(wǎng)絡(luò)分析和
2、藥理輔助決策平臺實(shí)現(xiàn)三個(gè)模塊,并使用C#進(jìn)行服務(wù)端開發(fā),使用echarts等進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)和圖形的可視化。三個(gè)模塊的研究工作如下:
1.作用關(guān)系預(yù)測模塊包括成分和靶點(diǎn)以及成分和疾病的作用關(guān)系預(yù)測,統(tǒng)一視為成分和實(shí)體關(guān)系預(yù)測的分類問題。本文提出基于相似度的思想計(jì)算分類特征,使用化學(xué)指紋作為分子的指紋特征,使用分子指紋以及分子和實(shí)體的關(guān)系矩陣計(jì)算實(shí)體的指紋特征,使用8種相似度計(jì)算方法計(jì)算分子和實(shí)體的相似度作為分類模型特征,使用隨機(jī)森林算
3、法構(gòu)建模型。最后使用standard、pubchem和maccs指紋分別對酶、離子通道、G蛋白偶聯(lián)受體和核受體四個(gè)數(shù)據(jù)集構(gòu)建關(guān)系預(yù)測模型,使用五折交叉驗(yàn)證來驗(yàn)證模型的性能,三種分類模型的受試者工作特征曲線以下面積平均值分別達(dá)到99.51%、98.92%和97.66%。
2.網(wǎng)絡(luò)分析模塊包括對成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)、成分-疾病網(wǎng)絡(luò)的分析。為研究成分對于腎病的機(jī)理,構(gòu)建成分-腎靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)和成分-腎病網(wǎng)絡(luò);為研究成分在網(wǎng)絡(luò)上中的重要性對靶點(diǎn)和
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