疏水電荷誘導(dǎo)置換色譜中吸附和轉(zhuǎn)換過程的分子模擬研究.pdf

1、疏水電荷誘導(dǎo)置換色譜(HCIDC)將置換操作模式應(yīng)用于疏水電荷誘導(dǎo)色譜,在抗體分離純化方面具有不可比擬的優(yōu)勢(shì),但其過程和機(jī)理不明,影響其工業(yè)化應(yīng)用。本文利用粗粒化分子動(dòng)力學(xué)模擬研究HCIDC的微觀動(dòng)態(tài)過程,考察其影響因素并解析其作用機(jī)理。
　　 首先通過均勻排布球形粒子的正六邊形平板模擬色譜基質(zhì),其上偶聯(lián)配基5-氨基吲哚。采用連接配基的兩平行平板模擬色譜孔道,以溶菌酶為目標(biāo)溶質(zhì),選取三丁基四癸基氯化磷(TC)、十六烷基二甲基芐基

2、氯化銨(CC)和芐索氯銨(BC)為置換劑,按照Martini粗?；?chǎng)的簡(jiǎn)化原則分別構(gòu)建其粗?；Ｐ?。
　　 在此基礎(chǔ)上,以色譜孔道為研究對(duì)象,詳細(xì)考察吸附和置換過程中溶菌酶、配基以及置換劑之間的相互作用模式、接觸位點(diǎn)和能量,研究溶菌酶的構(gòu)象變化過程、溶菌酶初始構(gòu)象及配基密度對(duì)吸附過程的影響、置換劑種類及濃度對(duì)置換效果的影響。
　　 研究結(jié)果表明,吸附發(fā)生前,溶菌酶不斷調(diào)整自身構(gòu)象及方位以便與配基形成最低能量接觸；吸附過

3、程中,溶菌酶處于天然態(tài)-部分展開態(tài)的動(dòng)態(tài)變化中,并以疏水相互作用與配基結(jié)合,其中129號(hào)殘基LEU是關(guān)鍵吸附殘基。高配基密度時(shí),溶菌酶的吸附較強(qiáng),但自身構(gòu)象變化也較明顯。置換過程中,置換劑與配基的疏水相互作用強(qiáng)于溶菌酶,且存在聚集-分散的動(dòng)態(tài)平衡,可推動(dòng)溶菌酶在基質(zhì)平面上移動(dòng)。置換劑BC屬于化學(xué)選擇性置換劑,而TC置換效果優(yōu)于CC。高濃度置換劑的置換效果較好,而高配基密度可能會(huì)造成置換劑與配基結(jié)合過于牢固而難以洗脫。
　　 該研