微RNA與疾病關(guān)聯(lián)關(guān)系的研究與實現(xiàn).pdf

1、在生物信息學(xué)領(lǐng)域，疾病與基因之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系是一個極其重要的研究方向。是研究人類遺傳疾病的重要手段，掌握了復(fù)雜疾病的治病機理，就可以根據(jù)致病基因所對應(yīng)的表型對癥下藥，或者避免遺傳疾病的產(chǎn)生。隨著越來越多的基因被發(fā)現(xiàn)，數(shù)據(jù)量的飛速提升，基因與疾病的對應(yīng)關(guān)系將從生物學(xué)實驗階段步入新的計算機實驗階段。
　　本文受到原有的微RNA-疾病對應(yīng)關(guān)系算法研究的啟發(fā)，提出了利用改進的隨機游走算法在構(gòu)建的疾病相似性網(wǎng)絡(luò)上進行隨機游走，對未知的微RNA

2、-疾病關(guān)聯(lián)關(guān)系進行打分排序，針對排序結(jié)果進行預(yù)測。主要的研究內(nèi)容和成果如下:
　　利用已發(fā)表文獻挖掘經(jīng)過生物學(xué)實驗驗證的微RNA-疾病的對應(yīng)關(guān)系作為原始數(shù)據(jù)。利用基于Mesh概念的相似性算法計算相關(guān)疾病的相似性，用以構(gòu)建疾病相似性網(wǎng)絡(luò)。在傳統(tǒng)的隨機游走算法中默認初始節(jié)點游走至下一節(jié)點的概率是相等的，并沒有結(jié)合網(wǎng)絡(luò)本身的特性來進行判斷，針對這一問題，本文提出了結(jié)合疾病網(wǎng)絡(luò)的實際情況，構(gòu)建基于節(jié)點重要性的疾病重要性矩陣，將節(jié)點重要性作

3、為權(quán)重應(yīng)用到轉(zhuǎn)移概率矩陣中。同時，結(jié)合原始數(shù)據(jù)中的對應(yīng)關(guān)系，本文為網(wǎng)絡(luò)中已對應(yīng)關(guān)系的疾病節(jié)點設(shè)置了一個評估參數(shù)，用來提升對應(yīng)節(jié)點的轉(zhuǎn)移概率，從而加大排序的正確性。
　　實驗結(jié)果驗證了算法的可行性。實驗結(jié)果得出本文365個微RNA關(guān)聯(lián)的疾病排序，通過對每個RNA樣本排名前20位疾病進行驗證，證明了本文提出算法的準確性。同時與其他算法進行對比，驗證了此算法的高效性，此外該算法的算法的AUC值達到了73.5％，相較于傳統(tǒng)算法高出了一個百