6-羥甲基-7，8-二氫喋呤磷酸化酶的分子對接和分子動力學模擬研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本論文主要圍繞HPPK酶及其復合物、突變體進行了理論計算方面的研究，主要包括分子對接和動力學模擬兩個部分；另外，對定量結構-活性/性質關系這一方法進行了部分改進?！　”菊撐膹氖荏w表面的表征方法(connolly、dms)、活性部位的大小來看對對接結果的影響，以HPPK和含有金屬離子Mg2+的HPPK為受體，底物HP的類似物為配體進行了分子對接，同時并考慮了活性口袋的大小,使用connolly受體表面表征方法、加入金屬鎂離子參數等調整好

2、的參數文件基礎上進行了MDL數據庫ACD3D子庫的對接?！　”菊撐奶接懥薍PPK在溶液、加入行衡離子的水溶液環(huán)境下的動力學行為，并加入在真空環(huán)境下的計算進行對比，使用柔性分子對接和動力學模擬方法對HPPK與底物HP、ATP的復合物結構進行了模建，同時考慮活性部位金屬鎂離子和配位水分子，共四個體系,對HPPK及其突變體進行了動力學模擬，對HPPK催化磷轉移的機理進行了定性的探討，對磷轉移機理的進一步深入研究提供了思路。　　本論文主要使

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