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簡介:隨著科技的發(fā)展,各類電子產(chǎn)品、電力設(shè)備廣泛使用,由此產(chǎn)生的各種不同頻率的電磁場已經(jīng)成為繼空氣、噪聲和水源污染后的第四大污染,嚴(yán)重影響和威脅人類健康。極低頻電磁場(ELFEMF)和射頻電磁場(RFEMF)是我們?nèi)粘I钪薪佑|到的最普遍的兩種電磁場。許多研究表明,ELFEMF和RFEMF暴露與人類健康損害和部分疾病的發(fā)生具有一定的相關(guān)性,包括兒童白血病、腦腫瘤、LOUGEHRIG疾病以及老年癡呆癥病等。由于雄性生殖器官對環(huán)境有害物質(zhì)非常敏感,隨著近年來精液質(zhì)量下降和不育的人群越來越多,人們開始密切關(guān)注ELFEMF和RFEMF對雄性生殖健康的潛在危害。然而,目前關(guān)于ELFEMF和RFEMF是否具有明顯的雄性生殖毒性的流行病學(xué)研究以及實驗研究結(jié)果還很不一致,而且關(guān)于ELFEMF和RFEMF暴露對(男)雄性生殖毒性以及機(jī)制也均不清楚。因此系統(tǒng)的開展ELFEMF和RFEMF生殖毒性效應(yīng)及其機(jī)制的研究,對于全面認(rèn)識二者對人類健康的影響及防治具有重要的意義。DNA甲基化是表觀遺傳修飾的途徑之一。它指的是在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶的作用下將活性S腺甲硫胺酸SAM轉(zhuǎn)移至DNA分子胞嘧啶環(huán)5C位點(diǎn)使其轉(zhuǎn)變?yōu)?甲基胞嘧啶的過程。DNA甲基化是一種廣泛的表觀遺傳調(diào)控機(jī)制。一般而言,基因啟動子區(qū)高甲基化會抑制其表達(dá)。因此DNA甲基化在基因表達(dá)調(diào)控中起重要作用,而且廣泛參與了各種生命活動和疾病的發(fā)生。MIRNA是表觀遺傳學(xué)調(diào)控的另一重要途徑,作為一類內(nèi)源性非編碼小RNA(長度大約在1925核苷酸),它幾乎存在于所有的生物體中,包括動物、植物和病毒。MIRNA主要的生物學(xué)功能是通過結(jié)合靶基因的3’非翻譯區(qū)從而在轉(zhuǎn)錄后水平上調(diào)控基因的表達(dá)。MIRNA通過與靶基因的結(jié)合能夠抑制靶MRNA的翻譯或提高M(jìn)RNA的降解。MIRNA介導(dǎo)的細(xì)胞調(diào)控是一種重要的表觀遺傳機(jī)制的調(diào)控途徑,人類基因組中約60%的基因都受到MIRNA的調(diào)控,MIRNA介導(dǎo)的細(xì)胞調(diào)控幾乎涉及參與全部的細(xì)胞進(jìn)程,如細(xì)胞增殖、細(xì)胞分化、細(xì)胞凋亡以及細(xì)胞周期等,且MIRNA與多種人類腫瘤和男性生殖障礙密切相關(guān)。越來越多的證據(jù)表明,DNA甲基化和MIRNA對精子的生成和男性的生育能力至關(guān)重要。鑒于EMF暴露對雄性生殖健康的潛在危害值得關(guān)注,但現(xiàn)有研究未得出明確的結(jié)論。存在較大爭議的原因一方面可能與無標(biāo)準(zhǔn)暴露裝置,暴露頻率、強(qiáng)度、時間不一,檢測方法和細(xì)胞敏感性不同等有關(guān);另一方面,不少研究發(fā)現(xiàn)ELFEMF和RFEMF沒有明顯的遺傳毒性。因此,本研究擬從表觀遺傳學(xué)這一新的角度入手,系統(tǒng)的評價EMFS暴露是否對DNA甲基化以及MIRNA等主要的表觀遺傳學(xué)調(diào)控產(chǎn)生影響;篩選關(guān)鍵性DNA甲基化調(diào)控應(yīng)答基因和MIRNA,并初步分析相關(guān)的DNA甲基化調(diào)控基因和MIRNA在EMFS暴露過程中的功能及其機(jī)制。為進(jìn)一步全面認(rèn)識電磁輻射的損傷效應(yīng)與醫(yī)學(xué)防護(hù)提供理論依據(jù)和研究材料。本論文主要研究內(nèi)容和結(jié)果如下(1)50HZELFEMF的表觀遺傳學(xué)研究①以不同電場強(qiáng)度(1MT,2MT和3MT),間歇式暴露模式(5MIN開10MIN關(guān))建立50HZELFEMF暴露條件下小鼠GC2細(xì)胞的表觀遺傳學(xué)細(xì)胞研究模型。暴露72H后采用CCK8和流式細(xì)胞術(shù)等分析方法發(fā)現(xiàn),不同場強(qiáng)的50HZELFEMF暴露對GC2細(xì)胞的形態(tài)、生長沒有明顯的影響,對GC2細(xì)胞的細(xì)胞周期和凋亡也沒有明顯的影響。表明50HZELFEMF短期暴露在體外沒有明顯的細(xì)胞功能改變。②全基因組DNA甲基化水平定量分析發(fā)現(xiàn)50HZELFEMF暴露后,1MT暴露組GC2細(xì)胞DNA的甲基化水平明顯降低;2MT和3MT暴露后,GC2細(xì)胞全基因組甲基化水平升高(P③利用DNA甲基化芯片初步篩選了50HZELFEMF暴露條件下主要的差異甲基化基因,建立了全基因組甲基化差異圖譜。其中有400多個基因發(fā)生了明顯的甲基化改變,表明50HZELFEMF暴露可能通過調(diào)控相關(guān)基因的甲基化產(chǎn)生生物學(xué)效應(yīng)。通過對部分候選基因DNA甲基化狀態(tài)的進(jìn)一步分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)NOD1、LRRC9、TAGLN等基因啟動子區(qū)明顯甲基化,且負(fù)調(diào)控相關(guān)基因的表達(dá),表明相關(guān)基因不僅可以作為50HZELFEMF暴露的候選標(biāo)志物,而且可能在50HZELFEMF誘發(fā)的生物學(xué)效應(yīng)中起重要作用。④利用表達(dá)譜芯片建立了50HZELFEMF暴露下差異基因表達(dá)譜。在1MT暴露條件下共有84個差異表達(dá)基因(其中包括44個基因上調(diào),40個基因顯著下調(diào));在3MT暴露條件下,差異表達(dá)的基因共有324個,其中包括235上調(diào)的基因和89個下調(diào)的基因。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)50HZELFEMF暴露下,MAOA、BHMT、GNG8、UGT2B34、DGAT1和ADH1等基因可能是1MT暴露條件下關(guān)鍵應(yīng)答靶基因;而CYP3A11、UGT2B34、ADCY5、PTGS1和CYP2B23等基因是3MT暴露條件下核心的靶基因。通過對相關(guān)基因表達(dá)驗證結(jié)合生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),這些關(guān)鍵性差異表達(dá)的基因主要涉及到免疫應(yīng)激、組蛋白修飾、氧化應(yīng)激等信號通路,提示50HZELFEMF可能影響相關(guān)的信號通路而產(chǎn)生生物學(xué)效應(yīng),為后續(xù)的深入研究提供了研究資料。⑤通過MIRNA表達(dá)譜芯片建立了50HZELFEMF暴露條件下差異MIRNA表達(dá)譜。結(jié)果表明50HZELFEMF暴露可以明顯誘導(dǎo)MIRNA差異表達(dá)。1MT暴露組共有19個MIRNA的表達(dá)發(fā)生改變,其中有7個MIRNA表達(dá)上調(diào),12個MIRNA表達(dá)下調(diào)。在3MT暴露組,差異表達(dá)的MIRNA共有36個,其中有9個MIRNA表達(dá)上調(diào),27個MIRNA表達(dá)下調(diào)。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),在1MT暴露組中,MIR2113P、MIR4943P、MIR669F3P和MIR1907是關(guān)鍵性應(yīng)答MIRNA。然而,在3MT暴露組,MIR30E5P、MIR2105P、MIR2245P、MIR196B5P、MIR5043P、MIR669C5P和MIR4553P是關(guān)鍵性應(yīng)答MIRNA。這些差異表達(dá)MIRNA可能與ELFEMF的生物學(xué)效應(yīng)密切相關(guān)。采用GO和KEGG對MIRNA靶基因所涉及的信號通路分析發(fā)現(xiàn),相關(guān)的MIRNA靶基因主要參與MT信號通路、晝夜節(jié)律信號通路、P53信號通路、長期抑郁和MAPK信號通路等信號通路,提示50HZELFEMF可能通過MIRNA影響上述信號通路和相關(guān)的生物學(xué)功能。我們的研究也表明這些顯著改變的MIRNA可作為候選的生物標(biāo)志物。⑥首次發(fā)現(xiàn)不同場強(qiáng)的50HZELFEMF能夠改變GC2細(xì)胞中MIR26B5P的表達(dá)水平。單獨(dú)過表達(dá)或者沉默MIR26B5P對GC2細(xì)胞的生長、凋亡以及細(xì)胞周期沒有明顯影響。但是過表達(dá)MIR26B5P再暴露于3MT50HZELFEMF會引起GC2細(xì)胞由G0G1期向S期轉(zhuǎn)換,提示MIR26B5P與50HZELFEMF存在著明顯的交互作用。進(jìn)一步的機(jī)制分析表明,CCND2是MIR26B5P的一個直接的靶基因,MIR26B5P的表達(dá)與CCND2的表達(dá)呈負(fù)相關(guān)。進(jìn)一步的實驗表明50HZELFEMF與MIR26B5P表達(dá)都可以改變CCND2MRNA和蛋白的表達(dá)水平從而影響細(xì)胞周期。相關(guān)研究首次表明MIR26B5PCCND2在GC2細(xì)胞暴露于50HZELFEMF過程中對細(xì)胞周期的調(diào)控發(fā)揮重要作用。(2)1800MHZRFEMF的表觀遺傳學(xué)研究①以不同比吸收率(1WKG、2WKG和4WKG),間歇式暴露模式(5MIN開10MIN關(guān))分別建立了1800MHZRFEMF暴露條件下小鼠GC2細(xì)胞的表觀遺傳學(xué)細(xì)胞研究模型。暴露72H后采用CCK8和流式細(xì)胞術(shù)等方法分析發(fā)現(xiàn)不同比吸收率的1800MHZRFEMF暴露對GC2細(xì)胞的形態(tài)、生長沒有明顯的影響。不同比吸收率的1800MHZRFEMF對GC2細(xì)胞的細(xì)胞周期和凋亡也沒有明顯的影響。②采用DOTBLOT方法分析1800MHZRFEMF暴露后GC2細(xì)胞全基因組甲基化水平,分析結(jié)果表明1WKG和2WKGRFEMF暴露時全基因組甲基化水平無明顯變化,而4WKGRFEMF暴露條件下GC2細(xì)胞全基因組甲基化水平升高。進(jìn)一步的機(jī)制分析發(fā)現(xiàn)1800MHZRFEMF可改變DNMTSMRNA和蛋白水平的表達(dá)。表明4WKGRFEMF暴露能導(dǎo)致GC2細(xì)胞DNA甲基化異常改變,且DNMTS參與了4WKGRFEMF誘導(dǎo)的全基因組甲基化水平改變調(diào)控。③利用DNA甲基化芯片對差異甲基化調(diào)控基因進(jìn)行了篩選,發(fā)現(xiàn)4WKGRFEMF暴露條件下,共有132個差異甲基化位點(diǎn)(54高甲基化和78低甲基化)。深入分析發(fā)現(xiàn)CYCS、XPNPEP3、NMUR2和MOB1A等基因的甲基化改變較為明顯,且負(fù)調(diào)控相應(yīng)基因的表達(dá),提示我們DNA甲基化可能參與了1800MHZRFEMF的生物效應(yīng)過程。④通過MIRNA表達(dá)譜芯片建立了1800MHZRFEMF暴露條件下差異MIRNA表達(dá)譜。分析結(jié)果表明4WKGRFEMF暴露可以誘導(dǎo)MIRNA差異表達(dá)。通過QRTPCR驗證和生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),MIR19A3P、MIR291B5P、MIR76845P、MIR69583P、MIR344G5P、MIR669N和MIR1896可能是4WKGRFEMF暴露條件下主要應(yīng)答MIRNA。這些差異表達(dá)MIRNA可能與4WKGRFEMF的生物學(xué)效應(yīng)密切相關(guān)。⑤通過表達(dá)譜芯片建立了4WKGRFEMF暴露后全基因組表達(dá)譜。發(fā)現(xiàn)共511差異表達(dá)基因,其中255個基因表達(dá)上調(diào),256個基因表達(dá)下調(diào)。SIGNAL分析發(fā)現(xiàn)UGT2A1和CYP2B10可能是重要的靶基因。通過進(jìn)一步驗證和信號通路分析發(fā)現(xiàn),4WKGRFEMF暴露條件下主要影響天然免疫反應(yīng)、Β干擾素細(xì)胞反應(yīng)、嗅覺信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、神經(jīng)活性的配體受體之間的相互作用、G蛋白偶聯(lián)受體等信號通路,提示RFEMF暴露對一些基本生命活動有一定的影響。⑥進(jìn)一步對1800MHZRFEMF作用機(jī)制進(jìn)行了分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)4WKGRFEMF暴露后與天然免疫反應(yīng)有關(guān)的基因,包括IL1А、IL6、IL10、PSG19、OAS1G和CXCL10表達(dá)水平改變明顯;與嗅覺信號轉(zhuǎn)導(dǎo)有關(guān)的基因,包括OLFR50、OLFR128、OLFR167等基因的表達(dá)水平也發(fā)生了顯著的改變,表明免疫反應(yīng)和嗅覺信號轉(zhuǎn)導(dǎo)信號通路可能在4WKG1800MHZRFEMF的生物效發(fā)揮著重要的作用,具有進(jìn)一步深入研究的必要。綜上所述,本實驗結(jié)果表明50HZELFEMF和1800MHZRFEMF短期暴露都可以顯著誘導(dǎo)DNA甲基化和MIRNA差異表達(dá),具有明顯的表觀遺傳學(xué)效應(yīng)。利用基因組學(xué)技術(shù)和生物信息學(xué)方法初步篩選和確定了兩種不同頻率EMFS暴露條件下的關(guān)鍵性應(yīng)答甲基化調(diào)控基因和MIRNA,建立了應(yīng)答關(guān)鍵基因信號通路網(wǎng)絡(luò),表明50HZELFEMF和1800MHZRFEMF暴露可以通過表觀遺傳學(xué)調(diào)控影響免疫應(yīng)激反應(yīng)等信號通路從而產(chǎn)生生物學(xué)效應(yīng)。本研究為后續(xù)EMFS的研究提供可靠依據(jù)和研究資料。
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簡介:南京醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明所呈交的論文是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下,獨(dú)立進(jìn)行研究工作所取得的成果。除了文中特別加以標(biāo)注引用的內(nèi)容外,本論文不包含任何其他個人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫的成果作品。對本文的研究做出重要貢獻(xiàn)的個人和集體,均己在文中以明確方式標(biāo)明。本人完全意識到本聲明的法律后果由本人承擔(dān)。作者簽名導(dǎo)師簽名哮彭日期砷肜年歲月≥陽日期加形年鄉(xiāng)月沖日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,同意學(xué)校保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版,允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)南京醫(yī)科大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編本學(xué)位論文。本學(xué)位論文屬于請在以下相應(yīng)方框內(nèi)打“、/”I、保密口,在一年解密后適用本授權(quán)書。2、不保密彭作者簽名導(dǎo)師簽名、學(xué)穆日期加76年鄉(xiāng)月沖日日期硼膨年鄉(xiāng)月乙尹日南京醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要阿爾茨海默病AD是一個復(fù)雜的多因素導(dǎo)致的神經(jīng)退行性疾病,它已成為一個很重要的公共健康問題。AD是以淀粉樣斑塊形成、神經(jīng)纖維纏結(jié)、神經(jīng)元丟失壞死為基本病理特點(diǎn)。然而,AD的發(fā)生和發(fā)展機(jī)制在很大程度上仍不清楚。3羥基3甲基戊二酰輔酶A還原酶基因是AD的一個強(qiáng)有力的候選基因,因為它編碼酶的部分他汀類結(jié)合域,這一部分是哺乳動物細(xì)胞膽固醇代謝的限速步驟。現(xiàn)在我們研究HMGCR基因的位點(diǎn)RS3846662在AD相關(guān)病理中的潛在作用,我們通過對神經(jīng)影像學(xué)的生物標(biāo)記評估來實現(xiàn)這一研究。我們從ADI經(jīng)影像學(xué)行動計劃數(shù)據(jù)庫中納入了812個受試者。經(jīng)過研究我們認(rèn)為在兩年后的隨訪研究中,HMGCR的位點(diǎn)RS3846662可以減慢右側(cè)內(nèi)嗅皮質(zhì)區(qū)P003385和左海馬區(qū)FP001839的體積萎縮。并且這個位點(diǎn)可減輕右側(cè)顳葉的糖代謝的降低。但是我們并沒有發(fā)現(xiàn)嬲儺的位點(diǎn)與P淀粉樣蛋白A13沉積之間的關(guān)系。我們在分組的AD、輕度認(rèn)知功能障礙MCI、正常對照叫C人群中驗證我們的實驗結(jié)果。在納入MCL人群中,我們的所有結(jié)果被證實。即在MCL人群中,HMGCR的位點(diǎn)RS3846662可以減慢右側(cè)內(nèi)嗅皮質(zhì)區(qū)P003385和左海馬區(qū)PO01839的體積萎縮。并且RS3846662可減輕右側(cè)顳葉的糖代謝的降低。我們的研究結(jié)果表明HMGCR的位點(diǎn)RS3846662在AD的病理形成中起著關(guān)鍵作用,它的作用主要表現(xiàn)在影響腦的結(jié)構(gòu)和影響糖代謝上。關(guān)鍵詞阿爾茨海默??;HMGCR基因;神經(jīng)影像;糖代謝
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簡介:⑧論文作者簽名蕉塑璺指導(dǎo)教師簽名論文評閱入1評閱人2評閱人3評閱人4評閱人5巫應(yīng)隱名雙向隱名塑囪塑名塑囪隆名塑囪隆名答辯委員會主席余海\教授\浙江大學(xué)委員1陳麗榮\教授\浙江大學(xué)委員2吳南翔\教授\浙江省醫(yī)學(xué)科學(xué)院委員3朱善寬\教授\浙江大學(xué)委員4朱益民\教授\浙江大學(xué)委員5浙江大學(xué)研究生學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包含為獲得逝婆太堂或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻(xiàn)均己在論文中作了明確的說明并表示謝意。學(xué)位論文作者簽名蚴簽字日期勱/歹年多月/歲日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解逝望盤堂有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交本論文的復(fù)印件和磁盤,允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)逝姿盤堂可以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索和傳播,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書學(xué)位論文作者簽名導(dǎo)師簽名簽字日期勱/名年歹月/歹日簽字日期加/伽中F多年∥月,歲日
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簡介:分類號R7421密級UDC編號學(xué)位論文一個一個罕見腦橋小腦發(fā)育不全家系臨床研究罕見腦橋小腦發(fā)育不全家系臨床研究及遺傳學(xué)分析及遺傳學(xué)分析ACLINICALGEICRESEARCHOFARAREPONTOCEREBELLARHYPOPLASIAFAMILY潘晴晴指導(dǎo)教師姓名王玉主任醫(yī)師教授安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科申請學(xué)位級別碩士專業(yè)名稱神經(jīng)病學(xué)提交論文日期201603論文答辯日期201605學(xué)位授予單位和日期安徽醫(yī)科大學(xué)201607答辯委員會主席評閱人2016年05月
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簡介:目的了解乙肝高危兒童乙肝免疫預(yù)防的效果,探討乙型肝炎病毒(HEPATITISBVIRUS,HBV)母嬰傳播的影響因素,分析HLADPDQ基因遺傳變異與兒童乙肝感染的關(guān)聯(lián),為揭示兒童乙肝的發(fā)病機(jī)制和制定相關(guān)防控措施提供科學(xué)依據(jù)。方法⑴采用病例對照研究的流行病學(xué)方法,于2013年10月至2015年8月間,分別在重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院、重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院、重慶市渝中區(qū)婦幼保健院及成都市婦女兒童中心醫(yī)院收集資料。以2011年4月至2014年8月在重醫(yī)附一院及成都市婦女兒童中心醫(yī)院分娩的HBSAG陽性母親及其所生乙肝高危兒童作為研究對象,使用流行病學(xué)調(diào)查表收集母親基本情況、兒童的出生情況、喂養(yǎng)情況及疫苗接種史,采集兒童靜脈血,分離血清及血凝塊后凍存?zhèn)錂z,乙肝血清學(xué)標(biāo)志物檢測采用ELISA法。以HBSAG陽性的兒童為病例組,HBSAG陰性者為對照組,采用14匹配病例對照研究的方法,進(jìn)行條件LOGISTIC回歸模型分析乙肝母嬰傳播的影響因素。⑵以上述在重慶的三所醫(yī)院成功采集到血樣的兒童為研究對象,提取血樣DNA,挑選位于HLADPDQ基因上的7個標(biāo)簽SNPS,采用SEQUENOMMASSARRAY方法對樣本進(jìn)行基因分型,采用二元非條件LOGISTIC回歸模型分析各SNPS與兒童乙肝感染的關(guān)系,采用PHASE20軟件進(jìn)行單倍型連鎖分析,采用MDR302和GMDR07軟件分析各SNPS的交互作用。結(jié)果①乙肝高危兒童乙肝免疫預(yù)防效果乙肝高危兒童的乙肝疫苗接種率為100%,9655聯(lián)合注射了乙肝疫苗和HBIG。乙肝高危兒童HBSAG陽性率為309,各年齡組間差異無統(tǒng)計學(xué)意義;HBSAB陽性率為6915,隨年齡增長陽性率逐步下降(Χ228135,P<0001)。不同性別HBSAB和HBSAG陽性率差異均無統(tǒng)計學(xué)意義。②乙肝高危兒童HBV母嬰傳播影響因素母親為HBSAG、HBEAG雙陽性的高危兒童乙肝感染率(1509)高于單純HBSAG陽性母親(022),P<001。母親HBEAG陽性是乙肝高危兒童HBV母嬰傳播的重要危險因素(33534,95CI4365257596)。③HLADPDQ基因遺傳變異與兒童乙肝感染的關(guān)聯(lián)分析單因素結(jié)果顯示HLADPA1基因上的RS3077和HLADPB1基因上的RS9277535在兒童HBV病例組和對照組中基因型頻率分布差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<005),RS3077和RS9277535的G等位基因與A相比,能增加兒童乙肝感染的風(fēng)險(1309,95CI10461639;1411,95CI11251771)。校正兒童性別、年齡及母親是否乙肝患者因素后發(fā)現(xiàn),與TT基因型相比,位于HLADPB2基因上的RS9366816TC基因型能增加兒童乙肝感染的風(fēng)險(1789,95CI11182863)。此外基因模型分析還發(fā)現(xiàn),與GGAA基因型相比,位于HLADPB1基因上的RS2281388GA基因型能增加兒童乙肝感染的風(fēng)險(143095CI10411966)。⒁單因素結(jié)果顯示RS3077和RS9277535的GA基因型在乙肝高危兒童HBV突破感染組和未感染組的分布差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<005),且RS9277535G等位基因能增加乙肝高危兒童HBV突破感染的風(fēng)險(151095CI10292215)。對乙肝高危兒童HBV突破感染的多種基因模型分析發(fā)現(xiàn),與GAAA基因型相比,RS9277535GG基因型能增加乙肝高危兒童HBV突破感染的風(fēng)險(203195CI11673534);而與GG基因型相比,GA基因型能降低乙肝高危兒童HBV突破感染的風(fēng)險(005095CI00060392)。結(jié)論⑴乙肝高危兒童HBSAB陽性率較低,且隨年齡增高逐漸下降。⑵母親HBEAG陽性是乙肝高危兒童母嬰傳播的危險因素。⑶位于HLADP基因上的四個SNPSRS3077、RS9277535、RS2281388和RS9366816與兒童HBV感染有關(guān)。⑷HLADPB1基因上的RS9277535與出生于HBSAG陽性母親的乙肝高危兒童HBV突破感染有關(guān)。
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簡介:目的潰瘍性結(jié)腸炎(ULCERATIVECOLITIS,UC)是一種慢性、反復(fù)發(fā)作性的結(jié)直腸連續(xù)性黏膜炎癥性疾病,多以年輕患者多發(fā)。但其發(fā)病機(jī)制仍不明確。目前,認(rèn)為UC是一種多因素、異質(zhì)性、多基因遺傳的疾病,多種因素包括環(huán)境、遺傳、感染、免疫、腸道微生物等相互作用的結(jié)果。近年來發(fā)現(xiàn)表觀遺傳學(xué)是環(huán)境與遺傳因素之間的橋梁,其中DNA甲基化是重要的表觀遺傳修飾之一,它能夠調(diào)節(jié)哺乳動物細(xì)胞的正常發(fā)育、分化,基因表達(dá)和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)。DNA甲基化需要甲基供體,包括葉酸、膽堿、B族維生素和甲硫氨酸。DNA高甲基化與基因沉默相關(guān),而低甲基化則基因表達(dá)活躍。研究發(fā)現(xiàn)在UC患者腸道T淋巴細(xì)胞中,IFNΓ表達(dá)增加與甲基化水平降低相關(guān),而且IFN?;颍↖FNG)甲基化水平在調(diào)節(jié)黏膜細(xì)胞因子分泌中有重要作用。眾多證據(jù)表明在哺乳動物發(fā)育過程中,妊娠期和新生兒期的環(huán)境因素通過影響表觀遺傳修飾,導(dǎo)致表型的永久性改變。因此,改變母體飲食因素可能通過影響DNA甲基化參與UC發(fā)生、發(fā)展。本研究以BALCC鼠為研究對象,通過給予母鼠甲基供體缺乏飲食,構(gòu)建子代小鼠實驗性結(jié)腸炎模型,并檢測血清葉酸、維生素B12和同型半胱氨酸水平,結(jié)腸黏膜IFNΓ表達(dá)水平,以及IFNG啟動子區(qū)DNA甲基化水平,探討母體甲基供體缺乏是否通過影響DNA甲基化從而參與UC的發(fā)病過程。方法1動物模型建立7周齡BALBC雌鼠在孕前1個月開始分別喂養(yǎng)標(biāo)準(zhǔn)飲食(C,N3)和甲基供體缺乏飲食(D,即無葉酸、膽堿、維生素B12和甲硫氨酸,N4),持續(xù)到子代斷乳(即出生后21天);子代小鼠與母鼠相同飲食直到被處死。子鼠出生后第23天,造模組以25%葡聚糖硫酸鈉溶液(DSS)作為飲用水5天,飲食水量不限。子代小鼠分組如下CDSS組、DDSS組、CDSS組、DDSS組,每組6只。2結(jié)腸炎疾病活動指數(shù)(DAI)每日觀察子代小鼠身體狀況、體質(zhì)量、糞便性狀、肛周紅腫糜爛和便血程度。根據(jù)體重減輕程度、糞便性狀和便血程度評分,分?jǐn)?shù)范圍04分,根據(jù)DAI總分?jǐn)?shù)3(04),評估結(jié)腸炎癥程度。3采用酶聯(lián)免疫吸附法(ELISA)檢測子代小鼠外周靜脈血清葉酸、維生素B12和同型半胱氨酸(HCY)水平。4采用免疫組織化學(xué)SP法檢測子代小鼠結(jié)腸黏膜組織中IFNΓ的表達(dá)水平。5提取結(jié)腸組織樣本基因組DNA,經(jīng)過亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化,采用SEQUENOMMASSARRAY甲基化檢測方法檢測IFNG啟動子區(qū)CPG島甲基化水平。結(jié)果1甲基供體缺乏的證據(jù)與標(biāo)準(zhǔn)飲食組(CDSS和CDSS組)相比,甲基供體缺乏飲食組(DDSS和DDSS組)小鼠的血清葉酸(887±111比1134±031NMOLL,P2甲基供體缺乏對DAI和組織學(xué)評分的影響在DSS處理后第5天,結(jié)腸炎癥程度最高。CDSS組較CDSS組的DAI高,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P3小鼠結(jié)腸黏膜組織IFNΓ的表達(dá)水平CDSS組和DDSS組IFNΓ表達(dá)水平較CDSS組和DDSS組顯著增高(214875,P4小鼠結(jié)腸黏膜組織IFNΓ表達(dá)水平與DAI的相關(guān)性CDSS組和DDSS組的IFNΓ表達(dá)水平與DAI呈正相關(guān)(R0853、0840,P均5IFNG啟動子區(qū)CPG島甲基化水平對同一CPG位點(diǎn)四組樣本之間甲基化水平分析未發(fā)現(xiàn)明顯差異,對四組樣本之間所有CPG位點(diǎn)總甲基化水平分析也未發(fā)現(xiàn)明顯差異。結(jié)論1母體甲基供體缺乏能夠加劇子代小鼠實驗性結(jié)腸炎發(fā)病。2甲基供體缺乏飲食可以引起子代結(jié)腸黏膜IFNΓ表達(dá)增高,參與實驗性結(jié)腸炎發(fā)病。3甲基供體缺乏并非通過IFNG啟動子區(qū)CPG島低甲基化,從而導(dǎo)致IFNΓ表達(dá)增高,進(jìn)而加重實驗性結(jié)腸炎。
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簡介:顱面畸形(CRANIOFACIALDEFMITY,CD)是一種影響人類頭、面、頸發(fā)育的先天性疾病,占先天性出生缺陷病的四分之三??艟噙^寬是某些顱面畸形疾病的臨床表現(xiàn),常伴隨其他特殊癥狀出現(xiàn),如突眼、并趾、智力異常等。目前已知多種顱面畸形如顱面裂隙畸形、顱縫早閉癥等均可表現(xiàn)出眶距過寬,雖然染色體的變異或基因突變可引起眶距過寬相關(guān)疾病的發(fā)生,但目前其致病機(jī)制尚不清楚。在詳細(xì)收集家系臨床信息的基礎(chǔ)上,本課題從染色體到基因水平對兩個表現(xiàn)出遺傳性眶距過寬家系進(jìn)行了系統(tǒng)研究。通過探尋兩個家系相應(yīng)疾病的致病原因,為同類型疾病的診斷以及臨床干預(yù)治療提供理論依據(jù),基因診斷明確后可為患者及其家庭成員進(jìn)行發(fā)病風(fēng)險評估甚至指導(dǎo)產(chǎn)前診斷。第一部家系一的臨床檢查及遺傳學(xué)研究1、材料和方法11臨床檢查分別采集家系一患者及正常成員的詳細(xì)病史、遺傳學(xué)信息,患者進(jìn)行必要的體格檢查及相關(guān)??茩z查;12全血基因組DNA提取抽取家系患者及正常成員的外周血液樣本,提取全血基因組DNA;13核型分析對家系一患者進(jìn)行染色體G顯帶核型分析實驗,觀察染色體結(jié)構(gòu)和數(shù)量的情況;14ACGH檢查采用微陣列比較基因組雜交技術(shù)檢測患者是否存在染色體拷貝數(shù)變異(COPYNUMBERVARIANTCNV);15CNV驗證對ACGH發(fā)現(xiàn)的CNV設(shè)計相應(yīng)的引物,利用熒光定量PCR進(jìn)行了家系共分離驗證;針對缺失片段的STS區(qū)域進(jìn)行雜合性缺失分析(LOSSOFHETEROZYGOSITYLOH),確定CNV的遺傳方式。2、結(jié)果家系一先證者主要表現(xiàn)為輕度到中度智力障礙和眶距過寬、高額頭和寬鼻根等特殊面容;患者III3臨床表現(xiàn)與之相似但無明顯智力發(fā)育障礙。先證者有兩個哥哥,已故,均表現(xiàn)出嚴(yán)重的智力障礙和發(fā)育障礙。家系的其他成員身體均健康,智力正常?;颊吆诵头治鼋Y(jié)果正常,ACGH檢查發(fā)現(xiàn)患者II3和III3各自攜帶3個CNV,結(jié)合家系正常成員ACGH結(jié)果分析和DGV、ISCA數(shù)據(jù)庫比對,鎖定CHR14Q3232Q3233的微重復(fù)和CHR17P133的微缺失為家系的致病CNV。熒光定量PCR和LOH分析間接證明了這兩個CNV的致病性和遺傳途徑。3、結(jié)論本研究中患者同時攜帶CHR14Q3232Q323微重復(fù)和CHR17P133微缺失兩種拷貝數(shù)變異并表現(xiàn)出兩種綜合征的臨床特征。上述兩個拷貝數(shù)變異為該家系遺傳性眶距過寬的致病原因,本研究首次發(fā)現(xiàn)患者同時攜帶這兩種CNV并且出現(xiàn)在同一綜合征里。第二部家系二的臨床檢查及遺傳學(xué)研究1、材料和方法11臨床檢查分別采集家系二患者及正常成員的詳細(xì)病史、遺傳學(xué)信息,患者進(jìn)行必要的體格檢查及相關(guān)??茩z查;12全血基因組DNA提取抽取家系患者及家系其他成員的外周血液樣本,提取全血基因組DNA;13已知基因篩查利用SANGER測序?qū)蜻x疾病致病基因的外顯子及其旁翼區(qū)的堿基序列進(jìn)行基因突變檢測;14核型分析對家系所有患者進(jìn)行染色體G顯帶核型分析實驗,觀察染色體結(jié)構(gòu)和數(shù)量的情況;15ACGH檢查采用微陣列比較基因組雜交技術(shù)檢測患者染色體拷貝數(shù)變異情況;16二代測序探尋致病基因選取合適的樣本進(jìn)行全外顯子組測序以及分析測序數(shù)據(jù),根據(jù)家系遺傳特征制定個性化篩選策略并篩選出可能的候選基因,基于GO的候選基因功能進(jìn)行富集分析。2、結(jié)果家系二連續(xù)3代均有患者表現(xiàn)出嚴(yán)重的眶距過寬的面部異常,遺傳方式呈顯性遺傳。部分患者除了明顯的眶距過寬的表現(xiàn)之外,還有其他特殊癥狀,家系其他成員身體健康。經(jīng)過已知致病基因篩查、染色體核型分析、ACGH檢查未找到相關(guān)染色體變異和致病基因突變位點(diǎn)。全外顯子組測序以及相關(guān)數(shù)據(jù)分析獲得96個候選基因,GO分析發(fā)現(xiàn)在“肽酶活性”功能和“細(xì)胞粘附”功能領(lǐng)域候選基因富集程度較高。3、結(jié)論家系二患者的致病原因復(fù)雜,經(jīng)過已知基因篩查、核型分析和ACGH的檢測未發(fā)現(xiàn)患者存在致病位點(diǎn)或染色體變異,排除家系疾病原因與染色體異?;騊FEIFFER綜合征、CROUZON綜合征、APERT綜合征和顱額鼻綜合征相關(guān)。根據(jù)二代測序以及數(shù)據(jù)分析提示家系二患者疾病的致病基因可能與某些“肽酶活性”和“細(xì)胞粘附”功能相關(guān)。
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簡介:目的通過收集遵義及周邊地區(qū)結(jié)膜吸吮線蟲(THELAZIACALLIPAEDATCP)人體感染標(biāo)本,對其進(jìn)行病例資料分析、形態(tài)學(xué)觀察和遺傳變異研究,初步獲得遵義及周邊地區(qū)結(jié)膜吸吮線蟲病的流行特征,了解遵義及周邊地區(qū)TCP形態(tài)特點(diǎn)及種間和種內(nèi)進(jìn)化關(guān)系,不僅為遵義及周邊地區(qū)結(jié)膜吸吮線蟲病的防治提供依據(jù),也為豐富TCP基因組序列信息奠定基礎(chǔ)。方法1、遵義醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院、遵義市航天醫(yī)院眼科采集TCP感染者成蟲標(biāo)本,獲得感染者病例資料;2、光學(xué)顯微鏡和掃描電鏡下觀察TCP雌、雄蟲形態(tài)特征和超微結(jié)構(gòu);3、HE染色法觀察TCP雌、雄蟲橫切和縱切組織結(jié)構(gòu)特征;4、利用試劑盒提取遵義及周邊地區(qū)不同來源地蟲體DNA,分別進(jìn)行18SRRNA、COX1兩個基因的PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測;5、對PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序,利用CLUSTALX183進(jìn)行比對,并用MEGA701軟件基于最大似然法(ML)進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果1、病例資料分析結(jié)果顯示遵義及周邊地區(qū)TCP人體感染病例為散發(fā),病例近年逐漸增多,每年8~11月為高發(fā)期;感染者集中在35~60歲;女性多于男性;以農(nóng)村患者居多,其中正安縣病例最多,約13患者家中養(yǎng)有狗、貓。2、遵義及周邊地區(qū)人體感染TCP形態(tài)特征與其他地區(qū)蟲體基本相同;掃描電鏡下觀察遵義及周邊地區(qū)TCP超微結(jié)構(gòu)與其他地區(qū)蟲體存在一定差異,遵義及周邊地區(qū)TCP口囊底部有兩塊半月形的咽門結(jié)構(gòu),成蟲尾部腹面末端1對尾乳突上未觀察到有新月形開口。3、HE染色結(jié)果顯示TCP體表結(jié)構(gòu)為鋸齒狀皺褶,為多肌型線蟲;體壁由角皮層、皮下層和縱肌層組成,體內(nèi)有消化系統(tǒng)、生殖系統(tǒng)等。4、遵義及周邊不同地區(qū)(正安縣、綏陽縣、桐梓縣、習(xí)水縣等)TCP18SRRNA基因序列同源性為99%~100;遵義及周邊地區(qū)多數(shù)樣本18SRRNA基因與日本OITA(AB5382821)樣本同源性為100,系統(tǒng)發(fā)育分析顯示同在一個分支。5、遵義及周邊不同地區(qū)TCP樣本COX1基因同源性為98~100,與羅馬尼亞(KP0877961)、日本OITA(AB5382831)樣本等其他地區(qū)COX1基因同源性為95~98。系統(tǒng)發(fā)育分析顯示正安1號與日本OITA(AB5382831)在一個分支;習(xí)水等遵義及周邊地區(qū)多數(shù)樣本的COX1基因與遵義市區(qū)2號、正安(2、3)號之間的親緣關(guān)系較近;遵義市區(qū)1號則與羅馬尼亞(KP0877961)、塞爾維亞(KJ4339831)樣本序列在同一分支。結(jié)論1、遵義及周邊地區(qū)TCP人體感染病例為散發(fā),近年逐漸增多;2、遵義及周邊地區(qū)TCP蟲體的形態(tài)特征與其他地區(qū)基本一致,但掃描電鏡下有一定區(qū)別;3、18SRRNA基因同源性高,可以作為TCP有效檢測基因;COX1基因則存在一定的種內(nèi)和不同地域差異,可作為TCP種群遺傳變異的有效分子標(biāo)記。
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簡介:分類號R7379學(xué)號2014010062重慶醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文(學(xué)術(shù)學(xué)位)(學(xué)術(shù)學(xué)位)論文題目DKK2在人結(jié)在人結(jié)直腸癌中表觀遺傳學(xué)調(diào)控及其抑制結(jié)腸癌中表觀遺傳學(xué)調(diào)控及其抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移的機(jī)制研究癌細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移的機(jī)制研究作者姓名王燦王燦一級學(xué)科名稱臨床醫(yī)學(xué)臨床醫(yī)學(xué)二級學(xué)科名稱腫瘤學(xué)腫瘤學(xué)論文答辯年月20172017年5月指導(dǎo)教師姓名(職稱、單位名稱)陶謙陶謙教授教授重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院任國勝任國勝教授教授重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院目錄英漢縮略語句名詞對照英漢縮略語句名詞對照1中文摘要中文摘要2英文摘要英文摘要4論文正文論文正文DKK2在人結(jié)在人結(jié)直腸癌中的表觀遺傳學(xué)調(diào)控及其抑制結(jié)腸癌中的表觀遺傳學(xué)調(diào)控及其抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞生直腸癌細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移的機(jī)制研究轉(zhuǎn)移的機(jī)制研究7前言前言7第一章第一章探討探討DKK2在人結(jié)在人結(jié)直腸癌細(xì)胞株和結(jié)腸癌細(xì)胞株和結(jié)直腸相關(guān)組織樣本的表達(dá)腸相關(guān)組織樣本的表達(dá)111實驗材料與方法實驗材料與方法132結(jié)果結(jié)果183討論討論19第二章第二章探討探討DKK2基因啟動子在人結(jié)基因啟動子在人結(jié)直腸癌中的甲基化癌中的甲基化211實驗材料與方法實驗材料與方法232結(jié)果結(jié)果263討論討論31第三章第三章探討探討DKK2抑制人結(jié)抑制人結(jié)直腸癌細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移的機(jī)制腸癌細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移的機(jī)制331實驗材料與方法實驗材料與方法342結(jié)果結(jié)果433討論討論54全文總結(jié)全文總結(jié)57參考文獻(xiàn)參考文獻(xiàn)58文獻(xiàn)綜述文獻(xiàn)綜述63致謝致謝74攻讀學(xué)位攻讀學(xué)位期間發(fā)表的論文期間發(fā)表的論文75
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簡介:背景目前,創(chuàng)傷是世界范圍內(nèi)的一個較為嚴(yán)重的公共健康問題,也是青年人致死的主要原因。隨著治療手段和護(hù)理技術(shù)的不斷發(fā)展,嚴(yán)重創(chuàng)傷病人也逐漸能夠在創(chuàng)傷中生存下來。然而創(chuàng)傷后并發(fā)癥仍然是住院病人致死的主要原因。因此,在第一時間預(yù)測并阻止創(chuàng)傷并發(fā)癥的發(fā)生和發(fā)展將會是治療創(chuàng)傷的一項有效措施。眾所周知,膿毒癥以及多器官功能障礙綜合征MODS是較為常見且嚴(yán)重的創(chuàng)傷并發(fā)癥。當(dāng)機(jī)體遇到微生物侵襲后所發(fā)生的超過機(jī)體承受能力的炎癥反應(yīng)是膿毒癥發(fā)生的根本原因。眾多炎癥因子的產(chǎn)生和釋放也將會促進(jìn)血管內(nèi)凝血和多器官功能障礙的發(fā)生。這種過度的炎癥反應(yīng)發(fā)生的機(jī)制或許能為我們探索膿毒癥以及多器官功能障礙的相關(guān)危險因素提供有價值的線索。白介素6(INTERLEUKIN6,IL6)是一種由內(nèi)皮細(xì)胞、單核細(xì)胞以及成纖維細(xì)胞等產(chǎn)生的細(xì)胞因子。它能夠刺激B、T等淋巴細(xì)胞,而且可以誘導(dǎo)發(fā)熱。目前的一些研究證實IL6在細(xì)菌入侵機(jī)體時所發(fā)生的炎癥反應(yīng)中扮演者重要的角色。TOLL樣受體2TOLLLIKERECEPT2,TLR2是TLR家族中的一員,它能夠識別一系列的細(xì)菌脂蛋白分子。有研究認(rèn)為TLR2蛋白分子是抵抗感染的最原始屏障中的一員。截止目前,越來越多的學(xué)者試圖探索IL6和TLR2兩個基因上的單核苷酸多態(tài)性與膿毒癥發(fā)生風(fēng)險的臨床關(guān)聯(lián)性。在這些常見的SNP位點(diǎn)中,IL6174GC和TLR2ARG753GLN兩個多態(tài)性位點(diǎn)被廣泛研究。然而,目前的結(jié)果卻存在較大的爭議。因此,我們在論文的第一部分通過META分析進(jìn)一步探索IL6174GC和TLR2ARG753GLN兩個位點(diǎn)的多態(tài)性對膿毒癥發(fā)生和發(fā)展的影響。過氧化物酶體增殖物激活受體(PEROXISOMEPROLIFERATACTIVATEDRECEPTS,PPARS)是一類核受體超家族的轉(zhuǎn)錄因子。它們在調(diào)節(jié)代謝、細(xì)胞的增殖和分化以及免疫反應(yīng)等過程中發(fā)揮著重要的作用。目前為止,在人類中共發(fā)現(xiàn)了PPAR家族的三種亞型,即PPARΑ、PPARΒΔ以及PPARΓ。除了關(guān)于PPAR家族成員在代謝方面重要作用的報道之外,人們開始越來越多地探索該家族成員在炎性疾病的發(fā)生和發(fā)展中的作用。這其中包括炎性腸病、腫瘤和蛋白尿性腎病等較為常見的炎性疾病。目前的研究顯示這類受體能夠?qū)FΚB的下游的炎性目的基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié),這或許是該家族成員發(fā)揮抗炎作用的一種較為常見的機(jī)制。而且PPAR家族成員的配體能夠?qū)ρ装Y反應(yīng)發(fā)生部位的白細(xì)胞聚集過程產(chǎn)生抑制作用。因此,探索PPAR家族成員在膿毒癥和多器官功能障礙發(fā)生發(fā)展中的潛在作用或許對我們進(jìn)一步明確該疾病的病理生理以及治療起到重要的作用。近期,越來越多的研究發(fā)現(xiàn)單核苷酸多態(tài)性SNP對創(chuàng)傷后不同患者的炎癥反應(yīng)差異有著重要的作用。雖然現(xiàn)階段不少學(xué)者已經(jīng)對PPAR家族基因在炎性疾病中的作用展開一定的研究,但是針對該家族成員的等位基因突變對創(chuàng)傷后膿毒癥以及MODS的影響卻少有探究?;谝陨闲畔ⅲ覀冊谡撐牡牡诙糠滞ㄟ^在PPAR家族成員的全基因范圍內(nèi)挑選SNP位點(diǎn),繼而探索其對創(chuàng)傷后膿毒癥和多器官功能障礙的影響。材料和方法1META分析我們首先通過PUBMED,EMBASE和WEBOFKNOWLEDGE三個數(shù)據(jù)庫對已發(fā)表文獻(xiàn)進(jìn)行檢索。兩位實驗人員按照相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)獨(dú)立對檢索的文獻(xiàn)展開篩查,并完成對相關(guān)數(shù)據(jù)的提取工作。由于目前人們對膿毒癥的遺傳模型還不確定,所以我們采用等位基因模型BVSA、共顯性模型BBVSAA、隱性模型BBVSABAA以及顯性模型BBABVSAA分別進(jìn)行META分析。我們用比值比和95%置信區(qū)間來評價相應(yīng)的SNP位點(diǎn)和膿毒癥發(fā)生風(fēng)險的相關(guān)性。Z檢驗用于評價合并后的比值比。除此之外,我們又分別進(jìn)行了亞組分析、異質(zhì)性分析、敏感性分析以及發(fā)表偏倚的檢測來進(jìn)一步評價相關(guān)SNP位點(diǎn)與膿毒癥的風(fēng)險。2PPAR家族基因多態(tài)性與創(chuàng)傷后膿毒癥發(fā)生風(fēng)險的臨床關(guān)聯(lián)性研究我們研究中共納入734例中國創(chuàng)傷病人,所有患者均為生活在重慶的漢族人?;虻难芯繀^(qū)域包含轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游延伸3KB區(qū)域、終止密碼下游延伸3KB以及基因的所有外顯子和內(nèi)含子。通過登錄HAPMAP數(shù)據(jù)庫的網(wǎng)站,我們獲得上述研究區(qū)域內(nèi)的所有SNP位點(diǎn)信息。利用HAPLOVIEW軟件對PPARΑ、PPARΒ和PPAR?;蜓芯繀^(qū)域內(nèi)的所有SNP位點(diǎn)分別構(gòu)建單倍型。共計挑選出9個標(biāo)簽SNP位點(diǎn)。我們使用改進(jìn)的多重高溫連接酶檢測反應(yīng)IMLDR技術(shù)對所收集的樣本DNA展開基因分型工作。另外,我們采用酶聯(lián)免疫反應(yīng)的方法對經(jīng)過LPS刺激后的外周血白細(xì)胞的腫瘤壞死因子Α表達(dá)水平進(jìn)行檢測。結(jié)果1META分析我們的結(jié)果顯示共有20個研究和7個研究分別探索了IL6174GC位點(diǎn)的基因多態(tài)性與膿毒癥的發(fā)生和死亡的相關(guān)性。META分析顯示目前在四種遺傳模型下,并沒有直接的證據(jù)證明IL6174GC位點(diǎn)的突變與膿毒癥的發(fā)生和死亡存在明顯的相關(guān)性。同樣的,亞組分析結(jié)果也顯示二者之間沒有必然的相關(guān)性存在。雖然我們在隱性模型下發(fā)現(xiàn)IL6174GC位點(diǎn)的突變與膿毒癥的死亡率有統(tǒng)計學(xué)相關(guān)性,但是經(jīng)過BONFERRONI校正后這種關(guān)聯(lián)性消失。在TLR2ARG753GLN位點(diǎn)的基因多態(tài)性和膿毒癥的發(fā)生風(fēng)險的META分析中我們共納入了12項研究,包含898名膿毒癥病人和1517名對照。結(jié)果顯示在等位基因模型和顯性模型下,TLR2ARG753GLN位點(diǎn)的多態(tài)性和膿毒癥的發(fā)生風(fēng)險存在明顯的關(guān)聯(lián)。另外,亞組分析與總的分析結(jié)果一致,TLR2ARG753GLN位點(diǎn)的多態(tài)性能夠影響膿毒癥的發(fā)生。2PPAR家族基因多態(tài)性與創(chuàng)傷后膿毒癥發(fā)生風(fēng)險的臨床關(guān)聯(lián)性研究研究中的734名病人均存活48小時以上。隨訪發(fā)現(xiàn)共有300人發(fā)生膿毒癥,其中138人46%出現(xiàn)病原菌血培養(yǎng)陽性。374人51%發(fā)生器官功能障礙,其中116人發(fā)生兩個或兩個以上器官功能障礙。統(tǒng)計發(fā)現(xiàn)呼吸道感染是最常見的感染類型。在所有PPAR家族的SNP位點(diǎn)中我們篩選出9個標(biāo)簽SNP位點(diǎn),分別為RS135551、RS5769178、RS4253711、RS4823613、RS6902123、RS2016520、RS4684846、RS10865710和RS1822825。除RS2016520位點(diǎn)位于5UTR位置和RS10865710位點(diǎn)位于EXONA2位置以外,其余位點(diǎn)均位于內(nèi)含子區(qū)域內(nèi)。在我們的研究人群中,這9個標(biāo)簽SNP位點(diǎn)的最小等位基因頻率MAF分別為76%RS135551、15%RS5769178、144%RS4253711、232%RS4823613、31%RS6902123、304%RS2016520、458%RS4684846、346%RS10865710和455%RS1822825。所有位點(diǎn)的基因型在研究人群中的分布均滿足哈代溫伯格平衡。進(jìn)一步統(tǒng)計分析顯示,我們所研究的每一個SNP位點(diǎn)的不同基因型的人群在性別、年齡和ISS評分上都沒有明顯的差異。PPAR?;騌S10865710位點(diǎn)攜帶G等位基因的病人與攜帶C等位基因的病人相比會明顯提高膿毒癥的發(fā)生率和MODS評分(隱性模型下該位點(diǎn)突變與膿毒癥發(fā)生風(fēng)險的相關(guān)性P0002,與多器官功能障礙評分的相關(guān)性P0041顯性模型下位點(diǎn)突變與膿毒癥發(fā)生風(fēng)險的相關(guān)性P0046)。對該位點(diǎn)在等位基因模型下進(jìn)行回歸分析時我們發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)與膿毒癥的發(fā)生風(fēng)險仍有明顯的相關(guān)性P0001。而其他八個位點(diǎn)在我們的研究中并未發(fā)現(xiàn)與創(chuàng)傷后膿毒癥和MODS評分具有明顯的相關(guān)性。進(jìn)一步分析顯示,在60例創(chuàng)傷病人的標(biāo)本(RS10865710位點(diǎn)基因型為GG、GC和CC的樣本各20例)中,RS10865710位點(diǎn)的突變與LPS誘導(dǎo)外周白細(xì)胞后腫瘤壞死因子Α的表達(dá)水平有明顯的相關(guān)性。攜帶G等位基因的病人腫瘤壞死因子Α的表達(dá)水平明顯高于攜帶C等位基因的病人顯性模型下P0041,隱性模型下P0027。結(jié)論本文第一部分結(jié)果顯示TLR2ARG753G1N位點(diǎn)的多態(tài)性可以顯著影響膿毒癥的發(fā)生風(fēng)險。因此,該位點(diǎn)或許能夠用于膿毒癥發(fā)生風(fēng)險的預(yù)警診斷。然而,META分析結(jié)果表明IL6174GC位點(diǎn)的多態(tài)性對膿毒癥的發(fā)生率和死亡率并沒有明顯影響。我們需要大樣本的研究來進(jìn)一步證實我們的結(jié)論。第二部分中,我們在PPAR家族三個成員基因的研究區(qū)域內(nèi)共挑選出9個SNP位點(diǎn)。結(jié)果顯示在中國漢族人中PPAR?;騌S10865710位點(diǎn)的突變與創(chuàng)傷后膿毒癥和MODS的風(fēng)險具有明顯的相關(guān)性。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)突變與LPS誘導(dǎo)的外周白細(xì)胞的腫瘤壞死因子Α的表達(dá)水平有很強(qiáng)的關(guān)聯(lián)性。因此,該位點(diǎn)今后或許可以用來對創(chuàng)傷后病人進(jìn)行膿毒癥和多器官功能障礙的風(fēng)險評估。
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簡介:藥物研發(fā)是一項投入高產(chǎn)出低的工作,如何提高藥物研發(fā)效率是醫(yī)藥行業(yè)面臨的一個主要問題。研究新藥從老藥出發(fā)可以極大地降低藥物研發(fā)的難度。隨著科學(xué)技術(shù)的進(jìn)步,二代測序技術(shù)的發(fā)展,人類基因組的注釋信息越來越豐富。分子生物學(xué)和遺傳學(xué)的突破使研究者們可以更深入地理解人類疾病,為發(fā)展新的藥物研發(fā)方法奠定了理論基礎(chǔ)。近年來,越來越多的研究者注意到基因的遺傳信息運(yùn)用到藥物研發(fā)的潛力。GWASDB、OMIM、HGMD等數(shù)據(jù)庫都收集了大量的影響人類表型的遺傳學(xué)變異信息。然后根據(jù)藥物靶標(biāo)互作信息,可以找到有遺傳信息的基因?qū)?yīng)的藥物,從而預(yù)測藥物的潛在活性。但是這種藥物活性預(yù)測方法效率比較低,藥物的富集效率只有5%10。如何提高藥物預(yù)測準(zhǔn)確率是一個有挑戰(zhàn)性的問題。考慮到疾病的致病因子往往不止一個,因此針對多個疾病相關(guān)基因開展藥物發(fā)現(xiàn)將提高藥物富集效率,加快藥物研發(fā)進(jìn)度。據(jù)此,本論文采用靶標(biāo)系統(tǒng)遺傳學(xué)方法,建立了藥物活性預(yù)測模型。首先,整合了7個數(shù)據(jù)庫收集的遺傳變異信息和DGIDB中的藥物活性信息。為了統(tǒng)一基因和藥物相關(guān)的疾病描述,使用醫(yī)學(xué)一體化系統(tǒng)UMLS中的醫(yī)學(xué)主題詞表MESH標(biāo)準(zhǔn)化了各來源的疾病描述。從而獲得了每一類疾病的若干致病基因和治療藥物。然后,從致病基因出發(fā)尋找與其相互作用的藥物,發(fā)現(xiàn)在絕大多數(shù)疾病中多靶標(biāo)的藥物比單靶標(biāo)藥物更容易產(chǎn)生相應(yīng)的治療活性,在此基礎(chǔ)上提出了基于系統(tǒng)遺傳學(xué)的藥物預(yù)測模型。使用支持向量機(jī)、樸素貝葉斯和邏輯回歸三種機(jī)器學(xué)習(xí)方法,對246種疾病構(gòu)建了基于兩個遺傳特征的預(yù)測模型。使用5折交叉驗證的方法,評價模型的表現(xiàn),發(fā)現(xiàn)84種疾病模型的PRECISION達(dá)到了080。針對精神分裂癥,使用與該疾病關(guān)聯(lián)較強(qiáng)的“TOP”基因,并建立了4特征的藥物預(yù)測模型。模型的各項評價指標(biāo)比2特征的模型均有提升。說明基于系統(tǒng)遺傳學(xué)的藥物預(yù)測模型可以有效地提高預(yù)測準(zhǔn)確率,并有良好的擴(kuò)展?jié)摿?。最后,為了便于同行使用本文的方法,我們建立了TSGDBIBIHZAUTSGDBHTML,實現(xiàn)了藥物活性預(yù)測的網(wǎng)絡(luò)服務(wù)。
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簡介:分類號R395密級不保密UDC610學(xué)校代碼11065碩士學(xué)位論文高密市原發(fā)性驚厥型癲癇遺傳流行病學(xué)調(diào)查杜省古王春霞教授精神病與精神衛(wèi)生學(xué)2016年11月25日關(guān)鍵詞原發(fā)性驚厥型癲癇;遺傳;流行病學(xué)關(guān)鍵詞原發(fā)性驚厥型癲癇;遺傳;流行病學(xué)GEICEPIDEMIOLOGICALINVESTIGATIONONGAOMICITYPRIMARYCONVULSIVEEPILEPSYABSTRACTOBJECTIVETOEVALUATETHEPRIMARYCONVULSIVEEPILEPSYGEICEFFECTMETHODSCLUSTEREPIDEMIOLOGICALINVESTIGATIONMETHODSTOMEETTHEPRIMARYCONVULSIVEEPILEPSYCRITERIAFTHEDIAGNOSISOF536CASESOFTHEPROBFAMILIESCOMETOSURVEYTOFINDAPOSITIVEFAMILYHISTYOFPATIENTSWITHFACEDETECTIONRATEIS100THISSTUDYWONDUCTEDINGAOMICITYCONVULSIVEEPILEPSYEPIDEMIOLOGICALINVESTIGATIONBASEDONTHECONTROLGROUPNOMEGAOMICITYTOTHECONVULSIVEEPILEPSYGROUPEPIDEMIOLOGYPREVALENCEDATAFTHECONTROLRESULTSTHERESULTSWEREINVESTIGATEDTHEPROBONETWORELATIVESOF16489PERSONS8CASESWEREFOUNDINPATIENTSWITHEPILEPSYPROBSRELATIVESPREVALENCERATEOF0049GAOMICITYCONVULSIVEEPILEPSYEPIDEMIOLOGICALDATAOUTCOMEGROUPSINTHEPREVALENCERATEIS0063THEREWASNOSTATISTICALSIGNIFICANCEP05631ACCDINGTOTHEFALCONERTHRESHOLDMODELTHEYTHEHERITABILITYESTIMATESFIRSTDEGREERELATIVESOFH2246NOTMETHAN60DOESNOTCONFMTOTHEDOMINANTRECESSIVEINHERITANCESEXLINKEDINHERITANCEPOLYGENESINHERITANCEMODELTWORELATIVESOFB0157GEICALLYUNRELATEDCONCLUSIONSTHEGEICFACTSINPRIMARYCONVULSIVEEPILEPSYETIOLOGYISNOTIMPTANTCONSIDERINGITSCAUSEMAYBEASSOCIATEDWITHCHILDHOODNEURODEVELOPMENTALABNMALITIESPOSTGRADUATESTUDENTSHENGGUDUPSYCHIATRYPSYCHOLOGYDIRECTEDBYPROFCHUNXIAWANG
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簡介:中大劑量阿糖胞苷鞏固治療細(xì)胞遺傳學(xué)低中危的年輕急性髓細(xì)胞白血病療效分析⑧論文作者簽名鄉(xiāng)收指導(dǎo)教師簽名龕整論文評閱人1錢美華主任醫(yī)師浙江省人民醫(yī)院評閱人2婁曼L至副主任逝洹太堂醫(yī)堂暄隨屬筮二醫(yī)院評閱人3垂萱副主堡浙江太堂醫(yī)堂暄隨屬筮二醫(yī)睦答辯委員會主席湯永民教授浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬兒童醫(yī)院委員1韭堂進(jìn)主堡醫(yī)垣蘊(yùn)趔壹紅土室金醫(yī)院委員2重漁洼熬拯逝選太堂醫(yī)堂醫(yī)隨屬筮二醫(yī)醫(yī)委員3佟紅墊熬拯浙江太堂醫(yī)堂院隨屬筮二醫(yī)院委員4童囪民主任醫(yī)短浙江盆厶民醫(yī)院答辯日期2016年5月30日浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文致謝致謝歲月如梭,轉(zhuǎn)眼間,即將畢業(yè),站在畢業(yè)的門檻上,回首往昔,奮斗和辛勞成為絲絲記憶,甜美與歡笑也都塵埃落定,浙江大學(xué)以其優(yōu)良的學(xué)習(xí)風(fēng)氣、嚴(yán)謹(jǐn)?shù)目蒲蟹諊涛仪髮W(xué),以其博大包容的情懷胸襟、浪漫充實的校園生活教育我成人。值此畢業(yè)論文完成之際,我謹(jǐn)向所有關(guān)心、愛護(hù)、幫助我的人們表示最誠摯的感謝與最美好的祝愿。本論文是在我的導(dǎo)師金潔教授的悉心指導(dǎo)之下完成的,在論文的編寫過程中,從論文的立題、研究方案的確立到論文的寫作過程,每一步都得到恩師孜孜不倦的教誨和無私的幫助。恩師高尚的品德、嚴(yán)謹(jǐn)?shù)闹螌W(xué)態(tài)度、敏銳的科研思維、精湛的臨床技能、不斷進(jìn)取的探索精神都是我學(xué)習(xí)的榜樣,將使我受益終生忠心感謝浙醫(yī)一院血液科錢文斌教授、盂海濤主任、麥文淵主任、佟紅艷主任、王蕾老師、韋菊英老師、俞文娟老師、毛莉萍老師等醫(yī)護(hù)人員在臨床學(xué)J過程中對我的指導(dǎo)和幫助,感謝錢劫靖老師、王敬瀚老師、婁引軍老師、王華鋒老師,索珊珊博士在論文寫作及數(shù)據(jù)統(tǒng)計中給予的支持和幫助,感謝余夢霞博士、馬志新博士、黃淑娟博士、陳曉常碩士、李霞碩士、朱雙麗碩士、賀嘯碩士、閆霄碩士等在數(shù)據(jù)收集及論文寫作中的陪伴及幫助最后,感謝我的父母、親人對我無微不至的關(guān)懷和照顧,感謝一路陪伴著的室友、同學(xué)和朋友對我的支持和鼓勵,感謝醫(yī)路生涯上指導(dǎo)幫助過我的師兄師姐師弟師妹們,感謝成長道路上遇到過的所有友善的人們。
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