前列腺癌拷貝數(shù)目變異的生物信息學(xué)分析.pdf

1、前列腺癌是一種嚴(yán)重威脅男性健康的惡性腫瘤，其致病機(jī)理尚未明確。拷貝數(shù)目變異（copy number variations）作為一種染色體結(jié)構(gòu)變異，廣泛分布于人類基因組中。由于在發(fā)生變異的區(qū)段內(nèi)包含重要的遺傳信息，目前已有大量的研究表明拷貝數(shù)目變異對于前列腺癌的發(fā)生發(fā)展有著重要的影響。本文系統(tǒng)的探究了拷貝數(shù)目變異對前列腺癌的影響機(jī)制，為臨床上癌癥的治療提供幫助。
　　在本文中，我們利用 PubMed和 EmBase數(shù)據(jù)庫進(jìn)行文獻(xiàn)檢索

2、，篩選出53篇相關(guān)文獻(xiàn)。通過深入的文獻(xiàn)挖掘，對拷貝數(shù)目變異位點(diǎn)的遺傳信息、樣本信息、檢測方法、文獻(xiàn)信息進(jìn)行了全面注釋，最終記錄了345個前列腺癌拷貝數(shù)目變異位點(diǎn)，包含895個基因。我們對記錄的數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計分析，包括前列腺癌拷貝數(shù)目變異的檢測方法分析、染色體分布分析、變異類型分析等。結(jié)果表明：全基因組芯片技術(shù)和下一代測序技術(shù)使用最為廣泛，大大提高了拷貝數(shù)目變異的檢測率；8號染色體上分布的拷貝數(shù)目位點(diǎn)的個數(shù)所占的比例最大；缺失型拷貝數(shù)目變異

3、占大部分。
　　利用生物信息學(xué)方法，對前列腺癌拷貝數(shù)目變異基因進(jìn)行了基因本體論分析，生物通過分析，驅(qū)動變異分析。我們發(fā)現(xiàn)在前列腺癌拷貝數(shù)目變異基因富集的生物過程中，前10條生物通路都是與程序性細(xì)胞死亡，細(xì)胞凋亡，細(xì)胞增殖，細(xì)胞組件大小相關(guān)，表明了基因的拷貝數(shù)目變異影響了前列腺癌的發(fā)生發(fā)展。此外，在拷貝數(shù)目變異分布最多的8號染色上，其發(fā)生拷貝數(shù)目變異的基因，通過與周圍基因的相互作用，影響了生物體內(nèi)的重要信號通路，對于癌癥的發(fā)生起到了