松遼白鵝Myf5外顯子Ⅰ基因克隆與序列分析.pdf

1、為提高鵝的產(chǎn)肉性能和改進(jìn)鵝肉品質(zhì)，為分子標(biāo)記輔助育種工作提供參考依據(jù)。本實(shí)驗(yàn)以吉林省農(nóng)業(yè)科學(xué)院選育的肉鵝配套系--松遼白鵝為研究對(duì)象，通過(guò)比較基因組學(xué)方法，首次克隆出松遼白鵝生長(zhǎng)決定因子5(Myogenic Factor5，Myf5)基因外顯子Ⅰ核苷酸序列；并對(duì)Myf5基因進(jìn)行了遺傳變異分析，同時(shí)結(jié)合屠宰性狀，分析了Myf5不同基因型與屠宰性狀的相關(guān)性。結(jié)果表明：
　　鵝Myf5基因外顯子Ⅰ的核苷酸序列全長(zhǎng)432bp，核苷酸A、T

2、、C和G四種堿基分別占整體序列的13.99％、23.78%、28.67%和33.57%，與其它禽類相差不大；編碼的143個(gè)氨基酸中Leu(19.58%)、Gly(18.88%)、Val(11.19%)和Ala(9.09%)的使用頻率均較高，使用頻率較低的氨基酸有Trp、Lys和Tyr，只有0.70%，其它氨基酸在2.10%-7.69%；Ala主要使用GCA，Arg使用AGG+CGC+CGU，Asp使用GAU，Gln使用CAG，His使用

3、CAU，Pro使用CCU，Leu使用CUC，Ser使用UCU等。顯示出密碼子使用的非隨機(jī)性，并且在密碼子使用頻率上與鴨的密碼子使用頻率的相似系數(shù)最高，達(dá)到0.965。同一基因在不同物種間密碼子的使用頻率不同，物種間親緣關(guān)系近的使用頻率相近。
　　對(duì)鵝 Myf5基因外顯子Ⅰ編碼序列與其它物種進(jìn)行比較分析，鵝與哺乳動(dòng)物的同源性在37.8%-38.5%，與魚(yú)類的同源性在26.6%-39.7%，顯著低于鴨和雞。鵝與鴨的同源性為98.4%，

4、與雞的同源性為91.4%。
　　實(shí)驗(yàn)得出Myf5基因AA、AB、BB3種基因型頻率分別為0.789、0.079和0.132，AA基因型為優(yōu)勢(shì)基因型，等位基因 A占主要優(yōu)勢(shì)。A、B兩個(gè)等位基因，頻率分別為0.829和0.171。
　　利用 PCR-SSCP技術(shù)分析了鵝 Myf5基因外顯子Ⅰ的多態(tài)性，結(jié)果表明在第1344處發(fā)生了單堿基的改變(A→G)，第1410處發(fā)生了單堿基改變(G→C)，且Myf5基因外顯子Ⅰ的兩個(gè)突變位點(diǎn)引

5、起了氨基酸的變化，分別為(Arg→Gly)、(Gly→Arg)。
　　研究發(fā)現(xiàn)不同基因型的宰前活重、屠體重、半凈膛重、全凈膛重、腿肌重、翅膀重與屠宰率性狀間有顯著差異。基因型AA的宰前活重、屠體重、半凈膛重、全凈膛重、翅膀重均值顯著高于基因型 BB（p<0.05），其中基因型 AB與 AA、BB個(gè)體間差異不顯著；腿肌重性狀上基因型BB均值顯著低于基因型AA、AB（p<0.05）；在半凈膛率性狀中，基因型AB的均值顯著高于基因型AA