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文檔簡介
1、中國醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文PTEN基因在喉鱗癌中的表達(dá)及其第5、第8外顯子突變分析姓名:白偉良申請學(xué)位級別:博士專業(yè):耳鼻咽喉指導(dǎo)教師:任重2003.2.1段長度為316bp;第8外顯子:游引物5’AGGACAAAATGTTTCACTTTTGGG一3’,下游引物5’ACATACATACAAGTCACCAACCC一3’,其擴(kuò)增產(chǎn)物為275bp。每259L擴(kuò)增體系中含4種dNTP各100pmoL,引物各25pmo|,DNA模板lng,lOx緩
2、沖液25pL,Taq聚合酶1u。第5外顯子反映條件如下:首次變性94℃3min,然后92℃60s,55。C45s,72。C20s,35個循環(huán)后,于72℃延伸7min;第8外顯子反映條件如下:首次變性94℃3rain,然后94℃45s,57℃60s,72℃60s,32個循環(huán)后,于72。C延伸7rain。SSCP:取109LPCR產(chǎn)物,加入變性載樣緩沖液f95%甲酰胺,10mmol/L乙二胺四乙酸(pH80),005%溴酚藍(lán),005%氰化二
3、f_『f苯腈藍(lán),10mmol/LNaOH1109L混勻,96℃變性10rain,冰卜I驟冷,上樣行非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳,電泳300V,3~4小時左右,直至溴酚藍(lán)接近凝膠底部。DNA銀染:剝膠,固定20分鐘,AgN03染色30min,然后顯色至帶型清晰為止,看片燈下觀察電泳情況,與jl三常喉組織帶型一致為系統(tǒng)正常對照,對與此相異的DNA帶型遷移率改變即為SSCP結(jié)果陽性。PCR產(chǎn)物直接測序法:在PCRSSCP篩選的陽性標(biāo)本行PCR擴(kuò)增
4、,純化后在上海聯(lián)合基因科技研究院進(jìn)行PCR產(chǎn)物直接測序,DNA自動測序儀為美國產(chǎn)ABl3700,序列與基兇庫WWWncbinlmnihgov正常序列比較,并應(yīng)用—wwwbios—oflnet/sms/indexhtml_軟件分析。為有顯著性意義)。統(tǒng)計學(xué)方法:U檢驗(P005,結(jié)果:49例標(biāo)本中13actinmRNA擴(kuò)增結(jié)果表明3actin全部陽性,PTEN基因RTPCR預(yù)期的目的基岡片段長度為136bp,PTEN基因有47例陽性,且與
5、預(yù)期片段大小相等,特異性高,但強(qiáng)度各不相同。正常喉粘膜PTEN基因rnRNA的高表達(dá)、中等表達(dá)率分別為778%,222%;聲門犁喉癌高、中、低表達(dá)率分別為454%,273%,273%;無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的聲門上型喉癌高、中、低表達(dá)率分別為572%,214%,214%;有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的』引]上型喉癌高、中、低及無表達(dá)率分別為267%,333%,267%,133%,聲『j型及聲門上型喉癌與正常喉組織相比,其mRNA表達(dá)下降,其中有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的聲門卜
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