通過生物信息學方法分析microRNA在皰疹病毒和宿主相互作用過程中所起的作用.pdf

1、MicroRNA是一類長度為22個堿基左右的，能夠在轉錄后水平上調控基因表達的非編碼RNA。最近的研究表明，病毒和宿主分別利用microRNA來實現(xiàn)免疫逃避或者免疫應答。使用microRNA調控基因表達對于病毒來說有著非同尋常的意義，可以使它們通過一種非免疫原性的方式調控胞內環(huán)境。通過microRNA調控自身和對方的靶基因從而實現(xiàn)病毒的存活策略和宿主的反制策略，構成了受microRNA調節(jié)的病毒與宿主互作網(wǎng)絡的核心。宿主編碼的micro

2、RNA可以作用于自身的轉錄物或者病毒的轉錄物，反之亦然。宿主的microRNA作用于病毒的靶基因是迄今為止研究最為透徹的microRNA介導的病毒防御機制之一。病毒的microRNA作用于宿主的轉錄物可以創(chuàng)造出比較適合病毒存活并復制的胞內環(huán)境。病毒編碼的microRNA可以調節(jié)病毒自身的轉錄物，從而延遲疾病發(fā)生。由這些microRNA調控的宿主基因有可能在病毒潛伏過程中的病理生理學有關。對宿主和病毒在分子水平上的相互作用的研究有助于我們

3、發(fā)現(xiàn)病毒潛伏感染的機制。
　　 根據(jù)miRBase發(fā)布的最新數(shù)據(jù)，有26個病毒物種能夠編碼microRNA，并且其中大部分是皰疹病毒科病毒。皰疹病毒科病毒是一類能夠在動物中導致各種疾病，并能導致人類疾病的DNA病毒。皰疹病毒科包含3個亞科，17個屬和90個物種。皰疹病毒極可能通過免疫逃避的方式建立終生感染。在本研究中，我們試圖從非編碼基因的角度闡釋皰疹病毒和宿主的互作（病毒的免疫逃避和宿主的免疫應答）。通過預測靶基因和miRNA