熱休克蛋白及熱休克蛋白70家族進(jìn)化保守性的系統(tǒng)分析.pdf

1、熱休克蛋白(HSPs)是一類在所有有機(jī)體中廣泛存在的一類熱應(yīng)激蛋白質(zhì),按其分子量大小又可以分為6類,分別為HSP100、HSP90、HSP70,、HSP60、HSP40以及SmallHSP。熱休克蛋白的主要功能是當(dāng)有機(jī)體暴露于高溫環(huán)境時(shí),會(huì)發(fā)生熱休克應(yīng)激反應(yīng),從而合成此類蛋白以保護(hù)有機(jī)體,可見(jiàn)其具有很高的研究?jī)r(jià)值。但是目前對(duì)熱休克蛋白的研究主要是集中在人類上,而且已確定的熱休克蛋白的種類和數(shù)目也很少,特別是在人以外的物種之中。熱休克蛋白

2、在進(jìn)化過(guò)程中是否保守?是否還有許多新的熱休克蛋白有待發(fā)現(xiàn)?為了揭示這些問(wèn)題,本文通過(guò)生物信息學(xué)方法將已知的人類熱休克蛋白按家族分類后分別對(duì)果蠅,柄海鞘,斑馬魚(yú),非洲爪蛙,家雞,小鼠,大鼠和黑猩猩的全基因組序列進(jìn)行比對(duì),得到可能存在的HSP功能基因。并從以上9個(gè)物種選取HSP70家族中的已確定基因進(jìn)行系統(tǒng)分析,以確定其進(jìn)化上的保守性。
　　 主要研究結(jié)果:
　　 1.序列比對(duì)結(jié)果表明除了柄海鞘Small HSP家族外,其他

3、各物種的不同家族均存在大量潛在的新熱休克蛋白。
　　 2.對(duì)人類已知的熱休克蛋白質(zhì)的DNA序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果表明熱休克蛋白在進(jìn)化上具有很高的保守性。
　　 3.用MEGA中基于鄰接法構(gòu)建的HSP70已知氨基酸序列鄰接系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)表明,所有的物種并未明顯按照低等到高等的進(jìn)化趨勢(shì)分簇,說(shuō)明HSP70在進(jìn)化中具有高度的保守性。較高的自展驗(yàn)證值支持了該進(jìn)化樹(shù)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的準(zhǔn)確性。
　　 4.為了進(jìn)一步驗(yàn)證HSP的保守性,在使用