皮膚鱗狀細(xì)胞癌相關(guān)異常甲基化基因的篩查及初步驗(yàn)證.pdf

1、皮膚鱗狀細(xì)胞癌是一種起源于表皮及其附屬器角質(zhì)形成細(xì)胞的惡性腫瘤。皮膚鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病率在皮膚惡性腫瘤中僅次于皮膚基底細(xì)胞癌，占第二位，該病的發(fā)病率較高，且處于不斷上升之中。由于皮膚鱗狀細(xì)胞癌的發(fā)病率日益增高，有較高的局部及遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移率，因此對(duì)其發(fā)病機(jī)理的研究日漸引起人們的重視。表觀遺傳學(xué)即在不改變基因組序列的前提下，通過DNA甲基化和組蛋白修飾來調(diào)控基因表達(dá)。DNA甲基化狀態(tài)的改變是引起腫瘤的一個(gè)重要因素，這種變化包括基因組整體甲基化水平降

2、低和CpG島局部甲基化水平的異常升高，從而導(dǎo)致基因組的不穩(wěn)定和抑癌基因的不表達(dá)。
　　目的:篩選出候選基因，并初步驗(yàn)證其在皮膚鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病中的表觀遺傳學(xué)作用。
　　方法:采用RRBS方法檢測(cè)皮膚鱗狀細(xì)胞癌及癌旁組織基因組甲基化水平，采用RNA-Seq方法檢測(cè)皮膚鱗狀細(xì)胞癌及癌旁組織基因轉(zhuǎn)錄組，篩選出皮膚鱗狀細(xì)胞癌異常甲基化基因，擴(kuò)大樣本量，采用QPCR方法進(jìn)行目的基因mRNA水平的檢測(cè)。
　　結(jié)果:通過RRBS和RN