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文檔簡介
1、顱面畸形(Craniofacial Deformity,CD)是一種影響人類頭、面、頸發(fā)育的先天性疾病,占先天性出生缺陷病的四分之三??艟噙^寬是某些顱面畸形疾病的臨床表現(xiàn),常伴隨其他特殊癥狀出現(xiàn),如突眼、并趾、智力異常等。目前已知多種顱面畸形如顱面裂隙畸形、顱縫早閉癥等均可表現(xiàn)出眶距過寬,雖然染色體的變異或基因突變可引起眶距過寬相關(guān)疾病的發(fā)生,但目前其致病機制尚不清楚。
在詳細收集家系臨床信息的基礎(chǔ)上,本課題從染色體到基因水平
2、對兩個表現(xiàn)出遺傳性眶距過寬家系進行了系統(tǒng)研究。通過探尋兩個家系相應(yīng)疾病的致病原因,為同類型疾病的診斷以及臨床干預(yù)治療提供理論依據(jù),基因診斷明確后可為患者及其家庭成員進行發(fā)病風(fēng)險評估甚至指導(dǎo)產(chǎn)前診斷。
第一部家系一的臨床檢查及遺傳學(xué)研究
1、材料和方法
1.1臨床檢查
分別采集家系一患者及正常成員的詳細病史、遺傳學(xué)信息,患者進行必要的體格檢查及相關(guān)專科檢查;
1.2全血基因組DNA提取
3、r> 抽取家系患者及正常成員的外周血液樣本,提取全血基因組DNA;
1.3核型分析
對家系一患者進行染色體G顯帶核型分析實驗,觀察染色體結(jié)構(gòu)和數(shù)量的情況;
1.4 aCGH檢查
采用微陣列比較基因組雜交技術(shù)檢測患者是否存在染色體拷貝數(shù)變異(Copy Number Variant, CNV);
1.5 CNV驗證
對aCGH發(fā)現(xiàn)的CNV設(shè)計相應(yīng)的引物,利用熒光定量PCR進行了家
4、系共分離驗證;針對缺失片段的STS區(qū)域進行雜合性缺失分析(Loss of Heterozygosity, LOH),確定CNV的遺傳方式。
2、結(jié)果
家系一先證者主要表現(xiàn)為輕度到中度智力障礙和眶距過寬、高額頭和寬鼻根等特殊面容;患者III-3臨床表現(xiàn)與之相似但無明顯智力發(fā)育障礙。先證者有兩個哥哥,已故,均表現(xiàn)出嚴重的智力障礙和發(fā)育障礙。家系的其他成員身體均健康,智力正常。患者核型分析結(jié)果正常,aCGH檢查發(fā)現(xiàn)患者II
5、-3和III-3各自攜帶3個CNV,結(jié)合家系正常成員 aCGH結(jié)果分析和 DGV、ISCA數(shù)據(jù)庫比對,鎖定chr14q32.32q32.33的微重復(fù)和 chr17p13.3的微缺失為家系的致病 CNV。熒光定量PCR和LOH分析間接證明了這兩個CNV的致病性和遺傳途徑。
3、結(jié)論
本研究中患者同時攜帶chr14q32.32-q32.3微重復(fù)和chr17p13.3微缺失兩種拷貝數(shù)變異并表現(xiàn)出兩種綜合征的臨床特征。上述兩
6、個拷貝數(shù)變異為該家系遺傳性眶距過寬的致病原因,本研究首次發(fā)現(xiàn)患者同時攜帶這兩種 CNV并且出現(xiàn)在同一綜合征里。
第二部家系二的臨床檢查及遺傳學(xué)研究
1、材料和方法
1.1臨床檢查
分別采集家系二患者及正常成員的詳細病史、遺傳學(xué)信息,患者進行必要的體格檢查及相關(guān)??茩z查;
1.2全血基因組DNA提取
抽取家系患者及家系其他成員的外周血液樣本,提取全血基因組DNA;
1.
7、3已知基因篩查
利用Sanger測序?qū)蜻x疾病致病基因的外顯子及其旁翼區(qū)的堿基序列進行基因突變檢測;
1.4核型分析
對家系所有患者進行染色體G顯帶核型分析實驗,觀察染色體結(jié)構(gòu)和數(shù)量的情況;
1.5 aCGH檢查
采用微陣列比較基因組雜交技術(shù)檢測患者染色體拷貝數(shù)變異情況;
1.6二代測序探尋致病基因
選取合適的樣本進行全外顯子組測序以及分析測序數(shù)據(jù),根據(jù)家系遺傳特征制
8、定個性化篩選策略并篩選出可能的候選基因,基于 GO的候選基因功能進行富集分析。
2、結(jié)果
家系二連續(xù)3代均有患者表現(xiàn)出嚴重的眶距過寬的面部異常,遺傳方式呈顯性遺傳。部分患者除了明顯的眶距過寬的表現(xiàn)之外,還有其他特殊癥狀,家系其他成員身體健康。經(jīng)過已知致病基因篩查、染色體核型分析、aCGH檢查未找到相關(guān)染色體變異和致病基因突變位點。全外顯子組測序以及相關(guān)數(shù)據(jù)分析獲得96個候選基因, GO分析發(fā)現(xiàn)在“肽酶活性”功能和“細
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