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文檔簡介
1、目的:
原發(fā)性肝細(xì)胞肝癌是目前較為普遍的惡性腫瘤之一,其危害巨大,但發(fā)病機(jī)制仍不是十分明確,目前的治療手段對肝癌的治療效果仍不理想。長鏈非編碼RNA是一類轉(zhuǎn)錄本超過200nt的非編碼RNA,其最初被認(rèn)定為無功能的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,但近來的研究表明其在細(xì)胞活動,疾病與腫瘤的發(fā)生發(fā)展方面都具有重要作用。為了探索針對肝癌更有效的診斷和治療途徑,就與肝癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)的lncRNA進(jìn)行研究具有明確的意義。
方法:
2.1通過
2、分析GEO數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)集GSE58043,發(fā)現(xiàn)長鏈非編碼RNALOC100288637在肝癌組織中高表達(dá)。
2.2在肝癌組織和配對癌旁組織以及肝癌細(xì)胞系和正常肝細(xì)胞系中運(yùn)用逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測LOC100288637的表達(dá)量。
2.3使用脂質(zhì)體向肝癌細(xì)胞轉(zhuǎn)染LOC100288637的小干擾RNA,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測干擾效率,敲低LOC100288637后,用CCK-8實(shí)驗(yàn)檢測肝癌細(xì)胞的增殖情況變化。
3、r> 2.4分析GEO數(shù)據(jù)庫的另一個(gè)數(shù)據(jù)集GSE10694,得出微RNA hsa-miR-101-3p在肝癌組織中低表達(dá)。
2.5運(yùn)用RNA-hybrid分析hsa-miR-101-3p與LOC100288637的結(jié)合可能性。
2.6使用脂質(zhì)體向肝癌細(xì)胞轉(zhuǎn)染hsa-miR-101-3p的模擬物,之后運(yùn)用逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測LOC100288637的表達(dá)量變化。
2.7使用熒光標(biāo)記探針在肝癌細(xì)胞中對L
4、OC100288637進(jìn)行熒光原位雜交實(shí)驗(yàn),鑒定其在肝癌細(xì)胞內(nèi)的分布情況。
2.8組間比較采用單因素方差分析,符合正態(tài)分布的計(jì)量資料以(X)±s表示,兩兩比較采用LSD-t檢驗(yàn)。
結(jié)果:
3.1逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)結(jié)果顯示:LOC100288637在手術(shù)切除肝癌患者的肝癌組織和癌旁組織樣本中的相對表達(dá)量分別為1.80±1.35、0.53±0.34,兩組比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=22.94,p<0.05)
5、,表明LOC100288637在肝癌組織內(nèi)高表達(dá)。肝癌細(xì)胞系(Huh7、HepG2、PLC/PRF/5、Bel-7704、SMMC-7721)中,LOC100288637的相對表達(dá)量分別為1.34±0.17、0.88±0.05、0.85±0.07、0.58±0.04、1.00±0.17,正常肝細(xì)胞系(L02)中LOC100288637的相對表達(dá)量為0.10±0.01,用五個(gè)肝癌細(xì)胞系分別與L02細(xì)胞系進(jìn)行比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=12
6、.56,24.47,18.41,18.38,9.08,p<0.05)。表明LOC100288637在肝癌細(xì)胞系中高表達(dá)。
3.2逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)結(jié)果顯示:在轉(zhuǎn)染siRNA后的HepG2細(xì)胞中,LOC100288637-control組和LOC100288637-siRNA組的LOC100288637表達(dá)量分別為38.97±3.98,5.12±0.15,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=14.72,p<0.01)。表明siRNA對LO
7、C100288637的干擾效果明顯。
3.3 CCK-8檢測結(jié)果顯示:向HepG2細(xì)胞轉(zhuǎn)染LOC100288637 siRNA12小時(shí)和24小時(shí)后,LOC100288637-siRNA組的HepG2細(xì)胞增值活性明顯降低,而LOC100288637-control組仍保持較高的增殖活性,兩組比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=139.80,F(xiàn)=191.40,p<0.01),表明LOC100288637能協(xié)助肝癌細(xì)胞的增殖。
3
8、.4逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)結(jié)果顯示:向HepG2細(xì)胞轉(zhuǎn)染hsa-miR-101-3p模擬物后,hsa-miR-101-3p control組和hsa-miR-101-3p mimics組LOC100288637表達(dá)量分別為1.00±0.05,0.08±0.00,兩組相比較,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=29.48,p<0.05),表明hsa-miR-101-3p能抑制LOC100288637的表達(dá)。
3.5熒光原位雜交實(shí)驗(yàn)顯示:LO
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