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文檔簡介
1、目的:探討預(yù)測口腔癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的新型分子標(biāo)記物。
方法:選取8例口腔鱗狀細胞癌新鮮組織標(biāo)本,分為淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移陽性組(M組)4例和陰性組(N組)4例,分組混合,形成1對標(biāo)本;采用雙向凝膠電泳技術(shù)(two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)分離兩組的差異蛋白點,基質(zhì)輔助激光解吸電離串聯(lián)飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF-TOF MS)鑒定差異蛋白,并對質(zhì)譜鑒定出的蛋白質(zhì)進行生物信息學(xué)分析。
2、> 結(jié)果:采用雙向凝膠電泳技術(shù)分離兩組的差異蛋白點,共獲得39個差異蛋白點,其中包含27個上調(diào)蛋白位點和12個下調(diào)蛋白位點,進行MADLDI-TOF-TOF MS鑒定,通過差異比率、蛋白質(zhì)通路以及互作蛋白質(zhì)等綜合分析,篩選出9個顯著差異表達蛋白質(zhì),其中上調(diào)蛋白質(zhì)6個,下調(diào)蛋白質(zhì)3個。
結(jié)論:①運用2-DE結(jié)合MALDI-TOF-TOF MS對淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移陽性組和陰性組進行差異分析。得到了39個差異蛋白點,其中包含27個上調(diào)蛋白
3、位點和12個下調(diào)蛋白位點,通過綜合分析,篩選出9個顯著差異表達蛋白,其中上調(diào)蛋白質(zhì)6個,下調(diào)蛋白質(zhì)3個;②通過Swiss-prot蛋白庫的注釋信息對得到鑒定的9種淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白質(zhì)進行生物學(xué)分析,提示這些蛋白質(zhì)分布于多種通路參與細胞增殖、分化、凋亡、轉(zhuǎn)錄、粘附、血管形成、以及蛋白質(zhì)翻譯、合成、加工、修飾等功能;③口腔癌的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移是一個多因素、多步驟、多種細胞功能異常所導(dǎo)致的復(fù)雜病理過程,這些差異蛋白質(zhì)可以在蛋白質(zhì)通路以及互作蛋白質(zhì)關(guān)
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