使用高通量測序平臺對肌張力障礙患者進行基因篩查.pdf

1、肌張力障礙(dystonia)是一種運動障礙性疾病，通常以持續(xù)或偶發(fā)的肌肉收縮而引起的異常運動或姿勢為特征。肌張力障礙的臨床表現(xiàn)根據(jù)受累肌肉的部位、收縮強度和不同肌肉的組合而有不同表現(xiàn)。現(xiàn)階段對肌張力障礙進行臨床診斷多按照臨床表現(xiàn)和病史依據(jù)醫(yī)生的臨床經(jīng)驗進行診斷，難以滿足臨床準確診斷的要求。而各種輔助檢查也做不到準確快速。臨床診斷中正急需一種快速準確的診斷方法。
　　目的：應用Ion AmliSeq多重PCR定制序列捕獲系統(tǒng)結合I

2、on Torrent PGM高通量測序平臺檢測肌張力障礙患者的目標基因突變，在找尋肌張力障礙致病基因新突變的基礎上評估高通量測序技術在肌張力障礙臨床診斷上應用的可能性。
　　方法：使用的個性化定制panel包括25個肌張力障礙明確致病基因及相關易感基因的全部外顯子區(qū)域，應用Ion AmliSeq多重PCR定制序列捕獲系統(tǒng)對病人的目的基因區(qū)域進行捕獲，通過Ion Torrent PGM高通量測序平臺進行靶向重測序，對得到的變異數(shù)據(jù)進

3、行肌張力障礙候選基因突變分析。
　　結果：本研究共使用Ion Chip318芯片6張，318V2芯片12張，平均測序深度為134±23，覆蓋度為96.12％±0.71％，單張芯片最高產(chǎn)生數(shù)據(jù)達到900MB(IonChip318V2)。經(jīng)測序后數(shù)據(jù)分析和Sanger測序驗證，在肌張力障礙的致病基因上共檢測到15(60％，15/25)個突變，其中4種為已知變異，11種為之前未報道的新突變。
　　結論：應用Ion AmliSeq多