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文檔簡介
1、ROMK2通道是內(nèi)向整流鉀離子通道(Inwardly Rectifying Potassium Channels,Kir)家族的一種亞型通道,在調(diào)節(jié)鉀離子的分泌方面起著關鍵作用。ROMK2通道功能除依賴于PIP2外,還受到如鎂離子、氫離子等很多因素調(diào)控。通道的磷酸化水平也會影響通道功能,如蛋白激酶A(PKA)磷酸化Ser200增加ROMK2通道的開放幾率,但具體調(diào)節(jié)機理尚不清楚。本文采用分子動力學模擬、分子對接和靶向分子動力學模擬相結(jié)合
2、的方法對Ser200磷酸化對通道門控機制的調(diào)節(jié)作用進行初步探索,得到一些有價值的結(jié)果:
1.通道蛋白Ser200的磷酸化可以使胞內(nèi)區(qū)域52-59和161-168兩段氨基酸的柔性增強,使58位的色氨酸構(gòu)象發(fā)生變化,這一變化和Kir2.2晶體結(jié)構(gòu)上相同位置的79位氨基酸構(gòu)象一致。
2. PIP2與通道的對接結(jié)果表明,58位的色氨酸的構(gòu)象變化,有利于PIP2和通道的結(jié)合,這表明磷酸化是通過調(diào)節(jié)通道與PIP2的相互作用來調(diào)節(jié)
3、通道的門控,這與文獻[54]一致。
3.通道蛋白Ser200磷酸化后,通道的胞內(nèi)區(qū)域相對于未磷酸化的通道的對應位置上升了2?,實驗研究表明胞內(nèi)區(qū)域上升是通道打開所必需的,因此ROMK2通道的磷酸化使胞內(nèi)區(qū)域上升有利于通道的打開。
4.通過分析C-Linker和胞內(nèi)區(qū)域的相互作用表明:通道蛋白Ser200磷酸化增強了C-linker與通道胞內(nèi)區(qū)域的相互作用,從而使胞內(nèi)區(qū)域上升,才有助于通道的打開。本文對Ser200磷酸
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