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文檔簡介
1、ML(MD-2-related lipid-recognition,ML)家族是含有ML單一結(jié)構(gòu)域的蛋白家族,廣泛存在于動物、植物和真菌等生物體內(nèi),成員包括MD-1(myeloid differentiation protein-1,MD-1)、MD-2(myeloid differentiation protein-2,MD-2)、 NPC2(nieman-pick type C2,NPC2)等以及很多尚未清楚功能的蛋白。MD-1和
2、MD-2是細(xì)胞表面受體識別細(xì)菌脂多糖所必需的因子,而其它ML蛋白也在脂類識別和代謝中發(fā)揮作用。 本實(shí)驗(yàn)在由白斑綜合癥病毒(white spot syndrome virus,WSSV)感染凡納濱對蝦所建立的抑制性消減雜交(suppression subtractive hybridization,SSH)cDNA文庫所獲得的EST(expressed sequence tag,EST)的基礎(chǔ)上,使用cDNA快速擴(kuò)增技術(shù)(rapi
3、d amplification of cDNA end,RACE)技術(shù)獲得一個(gè)具有ML結(jié)構(gòu)域的蛋白的全長cDNA,將其命名為LvML并對該基因的基因組結(jié)構(gòu)、蛋白功能和表達(dá)譜等進(jìn)行了進(jìn)一步的研究。 通過基因組PCR(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增得到了約1873 bp大小的基因組片段,并在此基礎(chǔ)上利用genome walking技術(shù)獲得了ORF(open reading frame,ORF)上游近
4、1100 bp的序列。分析表明LvML的基因由四個(gè)外顯子和三個(gè)內(nèi)含子組成。為了研究該基因的相關(guān)功能,將該基因克隆到pQE-30載體,構(gòu)建了重組表達(dá)質(zhì)粒pQE-30-LvML,在大腸桿菌M15中進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),并純化得到可溶性的帶6xHis標(biāo)簽的融合蛋白。通過ELISA(enzyme-linked immunosorbent assay,ELJSA)方法檢測重組蛋白對LPS(lipopolysaccharide,LPS)的結(jié)合活性。結(jié)果表明
5、,原核表達(dá)的重組蛋白在5μg/ml的濃度以上,具有明顯的LPS結(jié)合活性。 運(yùn)用Northem blot和RT-PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)技術(shù)檢測了該基因在凡納濱對蝦各組織的表達(dá)情況。結(jié)果表明,該基因只在肝胰腺組織中高水平表達(dá),在后盲囊中低水平表達(dá),而在眼柄、鰓、血細(xì)胞、心臟、胃、腸、肌肉、神經(jīng)索等組織未見明顯表達(dá)。在此基礎(chǔ)上,使用Northern blot和定量競爭性PCR(qua
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