青島文昌魚(yú)AmphiS28基因的克隆及進(jìn)化分析.pdf

1、該文從青島文昌魚(yú)(Branchiostoma belcheri tsingtauense)消化道cDNA文庫(kù)中得到一個(gè)cDNA克隆,鑒定后確定其為編碼核糖體蛋白S28的基因AmphiS28.AmphiS28 cDNA全長(zhǎng)460bp,其中31bp構(gòu)成5'非翻譯區(qū),即5'UTR;3'非翻譯區(qū)即3'UTR由222bp組成.AmphiS28 cDNA含有一個(gè)207bp的開(kāi)放閱讀框(ORF),編碼一個(gè)68個(gè)氨基酸殘基組成的蛋白質(zhì),推導(dǎo)的分子量為7

2、,694Da,等電點(diǎn)為10.74.AmphiS28含有14個(gè)堿性氨基酸殘基和9個(gè)酸性氨基酸殘基,堿性氨基酸和酸性氨基酸并不聚集在一起形成簇.AmphiS28具有很強(qiáng)的親水性,68個(gè)殘基中有23個(gè)帶有電荷,這與大鼠S28蛋白的情形是一樣的.AmphiS28和S28家族的其他15個(gè)核糖體蛋白全序列比較后顯示AmphiS28與其脊椎動(dòng)物同源物之間在氨基酸水平上的相似性大于84.8﹪,而與包括無(wú)脊椎動(dòng)物在內(nèi)的其他真核生物同源物的相似性小于80.

3、0﹪.這從一個(gè)側(cè)面似乎反映出文昌魚(yú)與脊椎動(dòng)物的親緣關(guān)系更近.在所構(gòu)建的進(jìn)化樹(shù)中,AmphiS28位于脊椎動(dòng)物S28和無(wú)脊椎動(dòng)物S28之間.這一結(jié)果符合構(gòu)建的生物進(jìn)化史,即文昌魚(yú)是位于脊椎動(dòng)物和無(wú)脊椎動(dòng)物之間的一種生物.系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果表明AmphiS28很可能是脊椎動(dòng)物核糖體蛋白S28的原始型.在進(jìn)化樹(shù)的脊索動(dòng)物區(qū)域,AmphiS28首先分支出來(lái),構(gòu)成了脊椎動(dòng)物S28蛋白的外類群.另外,AmphiS28與脊椎動(dòng)物各S28蛋白在氨基酸水平