人臍帶間充質干細胞培養(yǎng)液上清對肝癌細胞系HepG2影響的比較轉錄組學研究.pdf

1、間充質干細胞(Mesenchymal stem cells，MSCs)是一類來源于中胚層的成體干細胞，因其具有低免疫源性和來源廣泛的特點，被廣泛應用于各種疾病的，如心血管疾病、神經疾病、免疫缺陷疾病及癌癥等。大量研究證明，MSCs可歸巢至腫瘤，并對腫瘤的微環(huán)境起至關重要的作用。其分泌的細胞因子、生長因子等，對腫瘤細胞的增殖、擴散及腫瘤內血管形成等均有不同程度的影響。實驗室前期研究表明，UC-MSCs培養(yǎng)液上清對肝癌細胞系HepG2的增殖

2、具有抑制作用。
　　本研究對5個不同時間段UC-MSCs上清培養(yǎng)液處理的HepG2細胞進行了轉錄組測序（包括對照），分別獲得了約4767，4768，4774，4769和4753萬條reads，搭建了HepG2細胞的轉錄組信息平臺。所得數據與基因組比對發(fā)現，每個樣本的基因組覆蓋率和基因覆蓋率分別可達到84％和78％以上，表達基因條數1.6萬余條，可變剪接事件大于5萬個，識別出5萬多個SNP位點，基因融合事件約20個。兩兩比對差異表達

3、基因(DEGs)數目表明，隨著處理時間的延長，DEGs數目不斷增加。對DEGs分別進行了GO注釋和KEGG注釋，得到了大量注釋信息;其中，在處理至24h后，共有117條DEGs在細胞增殖條目中，共59條DEGs聚類在增殖相關通路MAPK通路中，69條DEGs聚類在癌癥相關通路中等。結合了他們的表達模式，對它們在UC-MSCs上清抑制HepG2細胞增殖現象中發(fā)揮的作用進行了討論。通過qRT-PCR手段對部分DEGs進行了實驗驗證，基因表達