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1、目的:研究IL-12/IFN-γ軸上五個(gè)基因的單核苷酸多態(tài)性與EV71感染手足口?。╤and,foot and mouth disease,HFMD)易感性的關(guān)系,這五個(gè)基因包括:白介素12B(IL-12B),白介素12受體β1(IL-12RB1),信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子4(STAT4),干擾素γ受體2(IFNGR2),信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子1(STAT1)。
方法:2014年3月至2015年6月,收集廣西地區(qū)EV71感染HF
2、MD患兒145例、EV71隱性感染兒童104例、健康對(duì)照兒童89例。采集非抗凝血提取血清,采用酶聯(lián)免疫吸附法(ELISA)測(cè)定血清標(biāo)本EV71 IgM、IgG及CoxA16 IgM、IgG抗體。采集抗凝血提取其外周血DNA,采用改進(jìn)的多重高溫連接酶檢測(cè)反應(yīng)技術(shù)(imLDRTM)檢測(cè)三組人群IL-12/IFN-γ軸上27個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn):IL-12B基因一個(gè)位點(diǎn):rs2288831;IL-12RB1基因11個(gè)位點(diǎn):rs12461312
3、,rs17882555,rs1870063,rs2305740,rs2305741,rs17878265,rs3746190,rs375947,rs383483,rs391410,rs401502;STAT4基因七個(gè)位點(diǎn):rs11676659,rs1517351,rs3024866,rs3024891,rs3024900,rs3024903,rs7574865;IFNGR2基因一個(gè)位點(diǎn):rs9808753;STAT1基因七個(gè)位點(diǎn):rs1
4、17037705,rs2066804,rs2280235,rs397897569,rs45515791,rs7597768,rs77910835的單核苷酸多態(tài)性,統(tǒng)計(jì)各個(gè)位點(diǎn)的基因型及等位基因頻率,并分析各個(gè)位點(diǎn)基因型及等位基因分布與EV71感染HFMD易感性之間的關(guān)系。
結(jié)果:⑴EV71感染HFMD組與對(duì)照組比較,IL-12RB1基因六個(gè)位點(diǎn)(rs12461312,rs17882555,1870063,rs2305740,r
5、s2305741,rs3746190)的基因型及等位基因頻率分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),IL-12RB1基因rs12461312等位基因C、rs17882555等位基因G、rs1870063等位基因C、rs2305740等位基因A、rs2305741等位基因G、rs3746190等位基因G頻率顯著高于對(duì)照組;EV71隱性感染組與正常對(duì)照組比較,IL-12RB1基因的這六個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)的基因型頻率及等位基因頻率分布差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)
6、意義(P>0.05);EV71感染HFMD組和EV71隱性感染組比較,這些多態(tài)性位點(diǎn)基因型及等位基因均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。⑵EV71感染HFMD組和正常對(duì)照組比較,STAT4基因位點(diǎn)rs11676659的基因型差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),EV71感染HFMD組基因型AA頻率低于對(duì)照組,而STAT4基因rs11676659等位基因頻率差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);EV71隱性感染組與對(duì)照組比較,rs11676659多
7、態(tài)性位點(diǎn)的基因型頻率及等位基因頻率分布差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);EV71感染HFMD組和EV71隱性感染組比較,STAT4位點(diǎn)rs11676659基因型差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.049),EV71感染HFMD組基因型AA頻率低于隱性感染組,其等位基因頻率分布無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。⑶EV71感染HFMD組和EV71隱性感染組分別與對(duì)照組比較,IFNGR2基因位點(diǎn)rs9808753的基因型及等位基因頻率差異均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意
8、義(P<0.05),EV71感染HFMD組和EV71隱性感染組基因型AA及A等位基因頻率均顯著高于對(duì)照組;EV71感染HFMD組和EV71隱性感染組比較,該多態(tài)性位點(diǎn)的基因型及等位基因均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。⑷IL-12RB1基因rs3746190(A/G),rs12461312(A/C),rs17882555(A/G),rs1870063(C/T),rs2305740(A/G),rs2305741(A/G)六個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)經(jīng)過連
9、鎖不平衡檢測(cè)示:這六個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)具有較強(qiáng)的連鎖不平衡(D’>0.8并且r2>0.8),處于同一個(gè)連鎖框內(nèi),可進(jìn)行單倍型分析。EV71感染HFMD組和對(duì)照組比較,IL-12RB1基因這六個(gè)SNP位點(diǎn)單倍型AAATGA在EV71感染HFMD組中低于對(duì)照組,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[P=0.0044<0.05,OR(95%CI):0.397(0.207-0.762)],單倍型GCGCAG在EV71感染HFMD組顯著高于對(duì)照組,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[P
10、=0.017,OR(95%CI):2.116(1.131-3.956)]。⑸EV71感染HFMD組和對(duì)照組比較,IL-12RB1基因位點(diǎn)rs375947,rs383483,rs391410,rs401502的等位基因頻率分布均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),在EV71感染HFMD組中位點(diǎn)rs375947等位基因A、位點(diǎn)rs383483等位基因A、位點(diǎn)rs391410等位基因G、位點(diǎn)rs401502等位基因C頻率均高于對(duì)照組,這四個(gè)位點(diǎn)基
11、因型分布差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);EV71隱性感染組和對(duì)照組比較,及EV71感染HFMD組和EV71隱性感染組比較,這四個(gè)位點(diǎn)基因型及等位基因頻率差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);EV71感染HFMD組、EV71隱性感染組分別和正常對(duì)照組比較,及EV71感染HFMD組和EV71隱性感染組比較,其余單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)基因型及等位基因的頻率分布差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
結(jié)論:①IL-12RB1基因六個(gè)位點(diǎn)(
12、rs12461312,rs17882555,1870063,rs2305740,rs2305741,rs3746190)的多態(tài)性可能與EV71感染HFMD易感性有關(guān),與這些位點(diǎn)相對(duì)應(yīng)的基因型及等位基因 CC/C、GG/G、CC/C、AA/A、GG/G、GG/G均是EV71感染HFMD的危險(xiǎn)因素;②STAT4基因位點(diǎn)rs11676659的多態(tài)性可能與EV71感染HFMD易感性有關(guān),基因型AG+GG及等位基因G是EV71感染HFMD的危險(xiǎn)因
13、素;③IFNGR2基因位點(diǎn)rs9808753的基因多態(tài)性與EV71感染易感性有關(guān),基因型AA及等位基因A是EV71感染的危險(xiǎn)因素;④IL-12RB1基因位點(diǎn)rs3746190,rs12461312,rs17882555,rs1870063,rs2305740,rs2305741單倍型GCGCAG是EV71感染HFMD危險(xiǎn)因素,攜帶單體型GCGCAG的兒童患EV71感染HFMD的風(fēng)險(xiǎn)更高;⑤IL-12RB1基因四個(gè)位點(diǎn)rs375947、r
14、s383483、rs391410、rs401502的等位基因可能與EV71感染HFMD易感性有關(guān);IL-12B基因位點(diǎn)rs2288831,STAT4基因五個(gè)位點(diǎn)rs3024866、rs3024891、rs3024900、rs3024903、rs7574865,STAT1基因七個(gè)位點(diǎn)rs117037705、rs2066804、rs2280235、rs397897569、rs45515791、rs7597768、rs77910835的單核苷
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