5株副溶血弧菌O血清型決定簇的破譯及特異基因的鑒定.pdf

1、副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus，VP）是一種嗜鹽的革蘭氏陰性細(xì)菌，廣泛分布在海洋環(huán)境中。它主要存在于魚類、貝類等海產(chǎn)品中，是一種引起食源性疾病的重要病原，可導(dǎo)致患者患上胃腸炎、創(chuàng)傷感染和敗血癥。
　　 副溶血弧菌分為13個(gè)O血清型和71個(gè)K血清型。對于副溶血弧菌，目前有兩株不同血清型的菌株(O3:K6和O4:K8)完成了全基因組測序，通過生物信息學(xué)分析，同時(shí)運(yùn)用PCR-RFLP分析證明該菌的O血清型決

2、定簇位于持家基因coaD和gmhD之間。目前對副溶血弧菌O血清型決定簇的了解還很少，本論文完成了該菌O1、O5、O7、O10和O12這五種血清型O血清型決定簇的測序和分析。首先通過位于持家基因coaD和gmhD內(nèi)引物對該基因簇進(jìn)行Long-PCR擴(kuò)增，然后運(yùn)用鳥槍法將所得到PCR產(chǎn)物構(gòu)建基因文庫，篩選陽性克隆進(jìn)行序列測定，在獲得完整序列的基礎(chǔ)上，進(jìn)行生物信息學(xué)分析，預(yù)測基因功能，并篩選基因簇中的特異基因。
　　 對這五株副溶血弧

3、菌的O血清型決定簇分析后，我們發(fā)現(xiàn)：coaD基因和gmhD基因之間的基因，多數(shù)轉(zhuǎn)錄方向?yàn)?’→3’，個(gè)別基因由3’→5’方向轉(zhuǎn)錄；O血清型決定簇的（G+C）含量在40％-45%之間，相對其他細(xì)菌的基因組而言，其(G+C)含量并無太大區(qū)別。O血清型決定簇中含有常見的單糖合成酶基因和糖基轉(zhuǎn)移酶基因；但是沒有典型寡糖單位處理酶基因。這也許與其細(xì)胞壁的結(jié)構(gòu)有關(guān)。副溶血弧菌的細(xì)胞壁與其他革蘭氏陰性細(xì)菌的細(xì)胞壁不同，其細(xì)胞壁并不具有完整的脂多糖，它